RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523788.1

GGH-208, Transcript of gamma-glutamyl hydrolase, human

TSL 2

Gene GGH, Length 492 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGH-208	ENST00000523788	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
GGH-208	ENST00000523788	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
GGH-208	ENST00000523788	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GGH-208	ENST00000523788	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GGH-208	ENST00000523788	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.7	■■■□□ 2.82
GGH-208	ENST00000523788	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GGH-208	ENST00000523788	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
GGH-208	ENST00000523788	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GGH-208	ENST00000523788	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GGH-208	ENST00000523788	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GGH-208	ENST00000523788	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
GGH-208	ENST00000523788	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.65	■■■□□ 2.82
GGH-208	ENST00000523788	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.64	■■■□□ 2.82
GGH-208	ENST00000523788	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.61	■■■□□ 2.81
GGH-208	ENST00000523788	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GGH-208	ENST00000523788	PZP	P20742	1482 aa		32.57	■■■□□ 2.8
GGH-208	ENST00000523788	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.56	■■■□□ 2.8
GGH-208	ENST00000523788	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
GGH-208	ENST00000523788	ABCC3	O15438	1527 aa		32.55	■■■□□ 2.8
GGH-208	ENST00000523788	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
GGH-208	ENST00000523788	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GGH-208	ENST00000523788	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.5	■■■□□ 2.79
GGH-208	ENST00000523788	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.49	■■■□□ 2.79
GGH-208	ENST00000523788	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
GGH-208	ENST00000523788	TNR	Q92752	1358 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GGH-208	ENST00000523788	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GGH-208	ENST00000523788	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
GGH-208	ENST00000523788	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
GGH-208	ENST00000523788	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.45	■■■□□ 2.78
GGH-208	ENST00000523788	CEP152	O94986	1710 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GGH-208	ENST00000523788	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.44	■■■□□ 2.78	1e-6	■■□□□ 12.5
GGH-208	ENST00000523788	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GGH-208	ENST00000523788	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GGH-208	ENST00000523788	KANK1	Q14678	1352 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GGH-208	ENST00000523788	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
GGH-208	ENST00000523788	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GGH-208	ENST00000523788	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GGH-208	ENST00000523788	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GGH-208	ENST00000523788	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GGH-208	ENST00000523788	PTPRT	O14522	1441 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GGH-208	ENST00000523788	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GGH-208	ENST00000523788	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GGH-208	ENST00000523788	ITGAE	P38570	1179 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GGH-208	ENST00000523788	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GGH-208	ENST00000523788	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
GGH-208	ENST00000523788	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GGH-208	ENST00000523788	PKD2	Q13563	968 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GGH-208	ENST00000523788	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.3	■■■□□ 2.76
GGH-208	ENST00000523788	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
GGH-208	ENST00000523788	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GGH-208	ENST00000523788	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
GGH-208	ENST00000523788	UNC13B	O14795	1591 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GGH-208	ENST00000523788	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.2	■■■□□ 2.74
GGH-208	ENST00000523788	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GGH-208	ENST00000523788	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GGH-208	ENST00000523788	NOS1	P29475	1434 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GGH-208	ENST00000523788	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
GGH-208	ENST00000523788	TET3	O43151	1660 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GGH-208	ENST00000523788	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.13	■■■□□ 2.73
GGH-208	ENST00000523788	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
GGH-208	ENST00000523788	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GGH-208	ENST00000523788	NUP155	O75694	1391 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GGH-208	ENST00000523788	IDI1	Q13907	227 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GGH-208	ENST00000523788	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GGH-208	ENST00000523788	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GGH-208	ENST00000523788	NAIP	Q13075	1403 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GGH-208	ENST00000523788	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GGH-208	ENST00000523788	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GGH-208	ENST00000523788	SYNM	O15061	1565 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GGH-208	ENST00000523788	MED14	O60244	1454 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GGH-208	ENST00000523788	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GGH-208	ENST00000523788	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GGH-208	ENST00000523788	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
GGH-208	ENST00000523788	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GGH-208	ENST00000523788	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GGH-208	ENST00000523788	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.01	■■■□□ 2.72
GGH-208	ENST00000523788	SLIT1	O75093	1534 aa		32.01	■■■□□ 2.72
GGH-208	ENST00000523788	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
GGH-208	ENST00000523788	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
GGH-208	ENST00000523788		E9PCH4	1651 aa		32	■■■□□ 2.71
GGH-208	ENST00000523788	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GGH-208	ENST00000523788	LTK	P29376	864 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GGH-208	ENST00000523788	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GGH-208	ENST00000523788	EID1	Q9Y6B2	187 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GGH-208	ENST00000523788	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.7
GGH-208	ENST00000523788	IQGAP1	P46940	1657 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GGH-208	ENST00000523788	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.91	■■■□□ 2.7
GGH-208	ENST00000523788	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.91	■■■□□ 2.7
GGH-208	ENST00000523788	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.84	■■■□□ 2.69
GGH-208	ENST00000523788	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GGH-208	ENST00000523788	CPS1	P31327	1500 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GGH-208	ENST00000523788	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GGH-208	ENST00000523788	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
GGH-208	ENST00000523788	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GGH-208	ENST00000523788	ZFYVE9	O95405	1425 aa		31.77	■■■□□ 2.68
GGH-208	ENST00000523788	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
GGH-208	ENST00000523788	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
GGH-208	ENST00000523788	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GGH-208	ENST00000523788	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	31.72	■■■□□ 2.67
GGH-208	ENST00000523788	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67

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