RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522397.5

TCEA1-210, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 3

Gene TCEA1, Length 852 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-210ENST00000522397 MROH2AA6NES4 1674 aa29.75■■■□□ 2.35
TCEA1-210ENST00000522397 NCOA1Q15788 1441 aa29.74■■■□□ 2.35
TCEA1-210ENST00000522397 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
TCEA1-210ENST00000522397 PTPRKQ15262 1439 aa29.73■■■□□ 2.35
TCEA1-210ENST00000522397 ERBINQ96RT1 1412 aa29.72■■■□□ 2.35
TCEA1-210ENST00000522397 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
TCEA1-210ENST00000522397 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.68■■■□□ 2.34
TCEA1-210ENST00000522397 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.67■■■□□ 2.34
TCEA1-210ENST00000522397 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.66■■■□□ 2.34
TCEA1-210ENST00000522397 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.64■■■□□ 2.34
TCEA1-210ENST00000522397 ROCK1Q13464 1354 aa29.63■■■□□ 2.33
TCEA1-210ENST00000522397 ZMYM3Q14202 1370 aa29.63■■■□□ 2.33
TCEA1-210ENST00000522397 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
TCEA1-210ENST00000522397 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.62■■■□□ 2.33
TCEA1-210ENST00000522397 DEPDC5O75140 1603 aa29.61■■■□□ 2.33
TCEA1-210ENST00000522397 CEP152O94986 1710 aa29.61■■■□□ 2.33
TCEA1-210ENST00000522397 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.6■■■□□ 2.33
TCEA1-210ENST00000522397 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.6■■■□□ 2.33
TCEA1-210ENST00000522397 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
TCEA1-210ENST00000522397 ABCC3O15438 1527 aa29.57■■■□□ 2.32
TCEA1-210ENST00000522397 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.323e-7■■■■□ 23.7
TCEA1-210ENST00000522397 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
TCEA1-210ENST00000522397 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.54■■■□□ 2.32
TCEA1-210ENST00000522397 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.53■■■□□ 2.32
TCEA1-210ENST00000522397 KANK1Q14678 1352 aa29.52■■■□□ 2.32
TCEA1-210ENST00000522397 NPATQ14207 1427 aa29.51■■■□□ 2.31
TCEA1-210ENST00000522397 PZPP20742 1482 aa29.49■■■□□ 2.31
TCEA1-210ENST00000522397 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.49■■■□□ 2.31
TCEA1-210ENST00000522397 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.47■■■□□ 2.31
TCEA1-210ENST00000522397 UNC13BO14795 1591 aa29.46■■■□□ 2.31
TCEA1-210ENST00000522397 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.45■■■□□ 2.31
TCEA1-210ENST00000522397 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.44■■■□□ 2.3
TCEA1-210ENST00000522397 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
TCEA1-210ENST00000522397 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
TCEA1-210ENST00000522397 HSPA2P54652 639 aa29.41■■■□□ 2.3
TCEA1-210ENST00000522397 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.4■■■□□ 2.3
TCEA1-210ENST00000522397 NAIPQ13075 1403 aa29.39■■■□□ 2.3
TCEA1-210ENST00000522397 TNRQ92752 1358 aa29.38■■■□□ 2.29
TCEA1-210ENST00000522397 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
TCEA1-210ENST00000522397 HFM1A2PYH4 1435 aa29.37■■■□□ 2.29
TCEA1-210ENST00000522397 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.35■■■□□ 2.29
TCEA1-210ENST00000522397 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.35■■■□□ 2.29
TCEA1-210ENST00000522397 ERVK-7P63135 1459 aa29.35■■■□□ 2.29
TCEA1-210ENST00000522397 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.35■■■□□ 2.29
TCEA1-210ENST00000522397 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
TCEA1-210ENST00000522397 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.34■■■□□ 2.29
TCEA1-210ENST00000522397 TET3O43151 1660 aa29.34■■■□□ 2.29
TCEA1-210ENST00000522397 NUP155O75694 1391 aa29.3■■■□□ 2.28
TCEA1-210ENST00000522397 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.28■■■□□ 2.28
TCEA1-210ENST00000522397 NLRP1Q9C000 1473 aa29.25■■■□□ 2.27
TCEA1-210ENST00000522397 E9PCH4 1651 aa29.24■■■□□ 2.27
TCEA1-210ENST00000522397 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
TCEA1-210ENST00000522397 STRCQ7RTU9 1775 aa29.21■■■□□ 2.27
TCEA1-210ENST00000522397 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.19■■■□□ 2.26
TCEA1-210ENST00000522397 TRIM52Q96A61 297 aa29.19■■■□□ 2.26
TCEA1-210ENST00000522397 SYNMO15061 1565 aa29.18■■■□□ 2.26
TCEA1-210ENST00000522397 NOS1P29475 1434 aa29.16■■■□□ 2.26
TCEA1-210ENST00000522397 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.14■■■□□ 2.26
TCEA1-210ENST00000522397 PIK3C2BO00750 1634 aa29.14■■■□□ 2.26
TCEA1-210ENST00000522397 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.13■■■□□ 2.25
TCEA1-210ENST00000522397 PLA2R1Q13018 1463 aa29.13■■■□□ 2.25
TCEA1-210ENST00000522397 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
TCEA1-210ENST00000522397 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
TCEA1-210ENST00000522397 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.08■■■□□ 2.25
TCEA1-210ENST00000522397 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.06■■■□□ 2.24
TCEA1-210ENST00000522397 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.06■■■□□ 2.24
TCEA1-210ENST00000522397 IDI1Q13907 227 aa29.05■■■□□ 2.24
TCEA1-210ENST00000522397 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.04■■■□□ 2.24
TCEA1-210ENST00000522397 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.04■■■□□ 2.24
TCEA1-210ENST00000522397 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.04■■■□□ 2.24
TCEA1-210ENST00000522397 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
TCEA1-210ENST00000522397 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
TCEA1-210ENST00000522397 ADGRB3O60242 1522 aa29.03■■■□□ 2.24
TCEA1-210ENST00000522397 PKD2Q13563 968 aa29.02■■■□□ 2.24
TCEA1-210ENST00000522397 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.01■■■□□ 2.23
TCEA1-210ENST00000522397 PTPRTO14522 1441 aa28.99■■■□□ 2.23
TCEA1-210ENST00000522397 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
TCEA1-210ENST00000522397 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.97■■■□□ 2.23
TCEA1-210ENST00000522397 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.97■■■□□ 2.23
TCEA1-210ENST00000522397 SLIT1O75093 1534 aa28.94■■■□□ 2.22
TCEA1-210ENST00000522397 TRPM2O94759 1503 aa28.94■■■□□ 2.22
TCEA1-210ENST00000522397 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TCEA1-210ENST00000522397 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.94■■■□□ 2.22
TCEA1-210ENST00000522397 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.93■■■□□ 2.22
TCEA1-210ENST00000522397 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.92■■■□□ 2.22
TCEA1-210ENST00000522397 CLTCL1P53675 1640 aa28.91■■■□□ 2.22
TCEA1-210ENST00000522397 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
TCEA1-210ENST00000522397 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.9■■■□□ 2.22
TCEA1-210ENST00000522397 IQGAP1P46940 1657 aa28.9■■■□□ 2.22
TCEA1-210ENST00000522397 FOXD1Q16676 465 aa28.89■■■□□ 2.22
TCEA1-210ENST00000522397 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
TCEA1-210ENST00000522397 EID1Q9Y6B2 187 aa28.88■■■□□ 2.21
TCEA1-210ENST00000522397 KIF1BO60333 1816 aa28.87■■■□□ 2.21
TCEA1-210ENST00000522397 MED14O60244 1454 aa28.87■■■□□ 2.21
TCEA1-210ENST00000522397 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.87■■■□□ 2.21
TCEA1-210ENST00000522397 LTKP29376 864 aa28.84■■■□□ 2.21
TCEA1-210ENST00000522397 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.81■■■□□ 2.2
TCEA1-210ENST00000522397 HRCP23327 699 aa28.81■■■□□ 2.2
TCEA1-210ENST00000522397 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
TCEA1-210ENST00000522397 ZFYVE9O95405 1425 aa28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.2 ms