RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522397.5

TCEA1-210, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 3

Gene TCEA1, Length 852 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-210ENST00000522397 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.11■■■■■ 5.13
TCEA1-210ENST00000522397 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.91■■■■■ 4.3
TCEA1-210ENST00000522397 ABCC9O60706 1549 aa40.91■■■■■ 4.14
TCEA1-210ENST00000522397 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.39■■■■□ 3.9
TCEA1-210ENST00000522397 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.38■■■■□ 3.89
TCEA1-210ENST00000522397 NACADO15069 1562 aa39.33■■■■□ 3.89
TCEA1-210ENST00000522397 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
TCEA1-210ENST00000522397 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.06■■■■□ 3.84
TCEA1-210ENST00000522397 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.95■■■■□ 3.83
TCEA1-210ENST00000522397 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.58■■■■□ 3.77
TCEA1-210ENST00000522397 SCRIBQ14160 1630 aa38.29■■■■□ 3.72
TCEA1-210ENST00000522397 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.21■■■■□ 3.71
TCEA1-210ENST00000522397 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.16■■■■□ 3.7
TCEA1-210ENST00000522397 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.73■■■■□ 3.63
TCEA1-210ENST00000522397 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.36■■■■□ 3.57
TCEA1-210ENST00000522397 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
TCEA1-210ENST00000522397 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.02■■■■□ 3.52
TCEA1-210ENST00000522397 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.72■■■■□ 3.47
TCEA1-210ENST00000522397 SMARCA4P51532 1647 aa36.59■■■■□ 3.45
TCEA1-210ENST00000522397 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
TCEA1-210ENST00000522397 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.32■■■■□ 3.41
TCEA1-210ENST00000522397 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.31■■■■□ 3.4
TCEA1-210ENST00000522397 SMARCA2P51531 1590 aa36.3■■■■□ 3.4
TCEA1-210ENST00000522397 NCAPD3P42695 1498 aa36.24■■■■□ 3.39
TCEA1-210ENST00000522397 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.17■■■■□ 3.38
TCEA1-210ENST00000522397 HMGXB3Q12766 1538 aa36.13■■■■□ 3.37
TCEA1-210ENST00000522397 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
TCEA1-210ENST00000522397 WIZO95785 1651 aa36■■■■□ 3.35
TCEA1-210ENST00000522397 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
TCEA1-210ENST00000522397 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
TCEA1-210ENST00000522397 NESP48681 1621 aa35.42■■■■□ 3.26
TCEA1-210ENST00000522397 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.34■■■■□ 3.25
TCEA1-210ENST00000522397 ERCC6Q03468 1493 aa35.28■■■■□ 3.24
TCEA1-210ENST00000522397 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.21■■■■□ 3.23
TCEA1-210ENST00000522397 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
TCEA1-210ENST00000522397 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.14■■■■□ 3.22
TCEA1-210ENST00000522397 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.08■■■■□ 3.21
TCEA1-210ENST00000522397 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.07■■■■□ 3.21
TCEA1-210ENST00000522397 CFTRP13569 1480 aa35.02■■■■□ 3.2
TCEA1-210ENST00000522397 PRDM2Q13029 1718 aa34.92■■■■□ 3.18
TCEA1-210ENST00000522397 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
TCEA1-210ENST00000522397 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.84■■■■□ 3.17
TCEA1-210ENST00000522397 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.82■■■■□ 3.16
TCEA1-210ENST00000522397 CUX2O14529 1486 aa34.81■■■■□ 3.16
TCEA1-210ENST00000522397 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.73■■■■□ 3.15
TCEA1-210ENST00000522397 WDR62O43379 1518 aa34.61■■■■□ 3.13
TCEA1-210ENST00000522397 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
TCEA1-210ENST00000522397 TOPBP1Q92547 1522 aa34.3■■■■□ 3.08
TCEA1-210ENST00000522397 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.3■■■■□ 3.08
TCEA1-210ENST00000522397 ABCC8Q09428 1581 aa34.28■■■■□ 3.08
TCEA1-210ENST00000522397 CUX1P39880 1505 aa34.08■■■■□ 3.05
TCEA1-210ENST00000522397 IFT140Q96RY7 1462 aa34.05■■■■□ 3.04
TCEA1-210ENST00000522397 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.04
TCEA1-210ENST00000522397 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.97■■■■□ 3.03
TCEA1-210ENST00000522397 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
TCEA1-210ENST00000522397 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
TCEA1-210ENST00000522397 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.89■■■■□ 3.02
TCEA1-210ENST00000522397 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.88■■■■□ 3.01
TCEA1-210ENST00000522397 SOGA1O94964 1423 aa33.86■■■■□ 3.01
TCEA1-210ENST00000522397 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.85■■■■□ 3.01
TCEA1-210ENST00000522397 SYNJ1O43426 1573 aa33.85■■■■□ 3.01
TCEA1-210ENST00000522397 TOP2BQ02880 1626 aa33.83■■■■□ 3.01
TCEA1-210ENST00000522397 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
TCEA1-210ENST00000522397 WDR97A6NE52 1622 aa33.72■■■□□ 2.99
TCEA1-210ENST00000522397 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.72■■■□□ 2.994e-8■■■■□ 23.2
TCEA1-210ENST00000522397 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
TCEA1-210ENST00000522397 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.61■■■□□ 2.97
TCEA1-210ENST00000522397 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.57■■■□□ 2.96
TCEA1-210ENST00000522397 PBRM1Q86U86 1689 aa33.52■■■□□ 2.96
TCEA1-210ENST00000522397 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.51■■■□□ 2.96
TCEA1-210ENST00000522397 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.49■■■□□ 2.95
TCEA1-210ENST00000522397 GRIN2BQ13224 1484 aa33.46■■■□□ 2.95
TCEA1-210ENST00000522397 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.44■■■□□ 2.94
TCEA1-210ENST00000522397 CHD1O14646 1710 aa33.43■■■□□ 2.94
TCEA1-210ENST00000522397 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
TCEA1-210ENST00000522397 OSCARQ8IYS5 282 aa33.36■■■□□ 2.93
TCEA1-210ENST00000522397 FBLN2P98095 1184 aa33.33■■■□□ 2.93
TCEA1-210ENST00000522397 SYNJ2O15056 1496 aa33.24■■■□□ 2.91
TCEA1-210ENST00000522397 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
TCEA1-210ENST00000522397 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.22■■■□□ 2.91
TCEA1-210ENST00000522397 ADAMTS12P58397 1594 aa33.2■■■□□ 2.91
TCEA1-210ENST00000522397 KIF27Q86VH2 1401 aa33.17■■■□□ 2.9
TCEA1-210ENST00000522397 TRIM41Q8WV44 630 aa33.16■■■□□ 2.9
TCEA1-210ENST00000522397 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.09■■■□□ 2.89
TCEA1-210ENST00000522397 GRIN2AQ12879 1464 aa33.05■■■□□ 2.88
TCEA1-210ENST00000522397 CUL7Q14999 1698 aa33■■■□□ 2.87
TCEA1-210ENST00000522397 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.97■■■□□ 2.87
TCEA1-210ENST00000522397 IGF1RP08069 1367 aa32.96■■■□□ 2.87
TCEA1-210ENST00000522397 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.91■■■□□ 2.86
TCEA1-210ENST00000522397 CEP170Q5SW79 1584 aa32.91■■■□□ 2.86
TCEA1-210ENST00000522397 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.9■■■□□ 2.86
TCEA1-210ENST00000522397 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.9■■■□□ 2.86
TCEA1-210ENST00000522397 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.9■■■□□ 2.86
TCEA1-210ENST00000522397 ARHGEF11O15085 1522 aa32.87■■■□□ 2.85
TCEA1-210ENST00000522397 NUP160Q12769 1436 aa32.86■■■□□ 2.85
TCEA1-210ENST00000522397 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.82■■■□□ 2.84
TCEA1-210ENST00000522397 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.78■■■□□ 2.84
TCEA1-210ENST00000522397 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.65■■■□□ 2.82
TCEA1-210ENST00000522397 SHROOM2Q13796 1616 aa32.65■■■□□ 2.82
TCEA1-210ENST00000522397 ARAP1Q96P48 1450 aa32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.4 ms