RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507785.2

MSX2-202, Transcript of msh homeobox 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSX2, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX2-202ENST00000507785 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
MSX2-202ENST00000507785 NCOA1Q15788 1441 aa42.95■■■■■ 4.47
MSX2-202ENST00000507785 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.94■■■■■ 4.46
MSX2-202ENST00000507785 PTPRKQ15262 1439 aa42.93■■■■■ 4.46
MSX2-202ENST00000507785 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
MSX2-202ENST00000507785 ERBINQ96RT1 1412 aa42.89■■■■■ 4.46
MSX2-202ENST00000507785 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.89■■■■■ 4.46
MSX2-202ENST00000507785 ZMYM3Q14202 1370 aa42.87■■■■■ 4.45
MSX2-202ENST00000507785 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
MSX2-202ENST00000507785 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.86■■■■■ 4.45
MSX2-202ENST00000507785 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.84■■■■■ 4.45
MSX2-202ENST00000507785 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.83■■■■■ 4.45
MSX2-202ENST00000507785 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.78■■■■■ 4.44
MSX2-202ENST00000507785 ROCK1Q13464 1354 aa42.76■■■■■ 4.44
MSX2-202ENST00000507785 DEPDC5O75140 1603 aa42.75■■■■■ 4.43
MSX2-202ENST00000507785 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.73■■■■■ 4.43
MSX2-202ENST00000507785 NPATQ14207 1427 aa42.73■■■■■ 4.43
MSX2-202ENST00000507785 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
MSX2-202ENST00000507785 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
MSX2-202ENST00000507785 ABCC3O15438 1527 aa42.72■■■■■ 4.43
MSX2-202ENST00000507785 ITGAEP38570 1179 aa42.69■■■■■ 4.42
MSX2-202ENST00000507785 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.67■■■■■ 4.42
MSX2-202ENST00000507785 CEP152O94986 1710 aa42.66■■■■■ 4.42
MSX2-202ENST00000507785 PZPP20742 1482 aa42.64■■■■■ 4.42
MSX2-202ENST00000507785 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.63■■■■■ 4.41
MSX2-202ENST00000507785 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.58■■■■■ 4.41
MSX2-202ENST00000507785 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.58■■■■■ 4.41
MSX2-202ENST00000507785 HSPA2P54652 639 aa42.55■■■■■ 4.4
MSX2-202ENST00000507785 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.53■■■■■ 4.4
MSX2-202ENST00000507785 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.53■■■■■ 4.4
MSX2-202ENST00000507785 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
MSX2-202ENST00000507785 KANK1Q14678 1352 aa42.51■■■■■ 4.4
MSX2-202ENST00000507785 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.5■■■■■ 4.39
MSX2-202ENST00000507785 UNC13BO14795 1591 aa42.48■■■■■ 4.39
MSX2-202ENST00000507785 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
MSX2-202ENST00000507785 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.46■■■■■ 4.39
MSX2-202ENST00000507785 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
MSX2-202ENST00000507785 TNRQ92752 1358 aa42.44■■■■■ 4.38
MSX2-202ENST00000507785 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.44■■■■■ 4.38
MSX2-202ENST00000507785 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
MSX2-202ENST00000507785 ERVK-7P63135 1459 aa42.41■■■■■ 4.38
MSX2-202ENST00000507785 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.39■■■■■ 4.38
MSX2-202ENST00000507785 NAIPQ13075 1403 aa42.37■■■■■ 4.37
MSX2-202ENST00000507785 EFCAB6Q5THR3 1501 aa42.36■■■■■ 4.37
MSX2-202ENST00000507785 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.35■■■■■ 4.37
MSX2-202ENST00000507785 STRCQ7RTU9 1775 aa42.33■■■■■ 4.37
MSX2-202ENST00000507785 HFM1A2PYH4 1435 aa42.31■■■■■ 4.36
MSX2-202ENST00000507785 TET3O43151 1660 aa42.31■■■■■ 4.36
MSX2-202ENST00000507785 NLRP1Q9C000 1473 aa42.3■■■■■ 4.36
MSX2-202ENST00000507785 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.3■■■■■ 4.36
MSX2-202ENST00000507785 NUP155O75694 1391 aa42.21■■■■■ 4.35
MSX2-202ENST00000507785 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
MSX2-202ENST00000507785 PLA2R1Q13018 1463 aa42.18■■■■■ 4.34
MSX2-202ENST00000507785 NOS1P29475 1434 aa42.18■■■■■ 4.34
MSX2-202ENST00000507785 SYNMO15061 1565 aa42.15■■■■■ 4.34
MSX2-202ENST00000507785 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.15■■■■■ 4.34
MSX2-202ENST00000507785 E9PCH4 1651 aa42.15■■■■■ 4.34
MSX2-202ENST00000507785 UBR1Q8IWV7 1749 aa42.09■■■■■ 4.33
MSX2-202ENST00000507785 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
MSX2-202ENST00000507785 PIK3C2BO00750 1634 aa42.05■■■■■ 4.32
MSX2-202ENST00000507785 PTPRTO14522 1441 aa42.04■■■■■ 4.32
MSX2-202ENST00000507785 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.04■■■■■ 4.32
MSX2-202ENST00000507785 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42.03■■■■■ 4.32
MSX2-202ENST00000507785 PKD2Q13563 968 aa42.01■■■■■ 4.32
MSX2-202ENST00000507785 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
MSX2-202ENST00000507785 IDI1Q13907 227 aa41.99■■■■■ 4.31
MSX2-202ENST00000507785 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
MSX2-202ENST00000507785 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.95■■■■■ 4.31
MSX2-202ENST00000507785 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.94■■■■■ 4.3
MSX2-202ENST00000507785 TRIM52Q96A61 297 aa41.91■■■■■ 4.3
MSX2-202ENST00000507785 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.9■■■■■ 4.3
MSX2-202ENST00000507785 ADGRB3O60242 1522 aa41.9■■■■■ 4.3
MSX2-202ENST00000507785 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.89■■■■■ 4.3
MSX2-202ENST00000507785 SLIT1O75093 1534 aa41.89■■■■■ 4.3
MSX2-202ENST00000507785 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.89■■■■■ 4.3
MSX2-202ENST00000507785 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.88■■■■■ 4.29
MSX2-202ENST00000507785 MED14O60244 1454 aa41.83■■■■■ 4.29
MSX2-202ENST00000507785 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.82■■■■■ 4.29
MSX2-202ENST00000507785 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.81■■■■■ 4.28
MSX2-202ENST00000507785 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.8■■■■■ 4.28
MSX2-202ENST00000507785 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.79■■■■■ 4.28
MSX2-202ENST00000507785 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
MSX2-202ENST00000507785 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
MSX2-202ENST00000507785 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.76■■■■■ 4.28
MSX2-202ENST00000507785 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
MSX2-202ENST00000507785 LTKP29376 864 aa41.74■■■■■ 4.27
MSX2-202ENST00000507785 TRPM2O94759 1503 aa41.74■■■■■ 4.27
MSX2-202ENST00000507785 IQGAP1P46940 1657 aa41.74■■■■■ 4.27
MSX2-202ENST00000507785 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
MSX2-202ENST00000507785 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.7■■■■■ 4.27
MSX2-202ENST00000507785 CLTCL1P53675 1640 aa41.68■■■■■ 4.26
MSX2-202ENST00000507785 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.68■■■■■ 4.26
MSX2-202ENST00000507785 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.67■■■■■ 4.26
MSX2-202ENST00000507785 EID1Q9Y6B2 187 aa41.66■■■■■ 4.26
MSX2-202ENST00000507785 ZFYVE9O95405 1425 aa41.64■■■■■ 4.26
MSX2-202ENST00000507785 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
MSX2-202ENST00000507785 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
MSX2-202ENST00000507785 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.58■■■■■ 4.25
MSX2-202ENST00000507785 HRCP23327 699 aa41.57■■■■■ 4.25
MSX2-202ENST00000507785 FOXD1Q16676 465 aa41.57■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.5 ms