RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.75■■□□□ 1.23
ATG4B-222ENST00000491867 ALKQ9UM73 1620 aa22.75■■□□□ 1.23
ATG4B-222ENST00000491867 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG4B-222ENST00000491867 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.234e-7■□□□□ 8.1
ATG4B-222ENST00000491867 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-222ENST00000491867 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-222ENST00000491867 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-222ENST00000491867 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ATG4B-222ENST00000491867 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-222ENST00000491867 PZPP20742 1482 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-222ENST00000491867 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-222ENST00000491867 KIF3BO15066 747 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-222ENST00000491867 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
ATG4B-222ENST00000491867 MED14O60244 1454 aa22.64■■□□□ 1.21
ATG4B-222ENST00000491867 MIA2Q96PC5 1412 aa22.63■■□□□ 1.21
ATG4B-222ENST00000491867 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG4B-222ENST00000491867 MBD5Q9P267 1494 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-222ENST00000491867 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-222ENST00000491867 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-222ENST00000491867 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-222ENST00000491867 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-222ENST00000491867 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-222ENST00000491867 DEPDC5O75140 1603 aa22.6■■□□□ 1.21
ATG4B-222ENST00000491867 NLRP1Q9C000 1473 aa22.6■■□□□ 1.21
ATG4B-222ENST00000491867 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.59■■□□□ 1.21
ATG4B-222ENST00000491867 IQGAP1P46940 1657 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-222ENST00000491867 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-222ENST00000491867 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
ATG4B-222ENST00000491867 TIAM1Q13009 1591 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-222ENST00000491867 SYNMO15061 1565 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-222ENST00000491867 POTEAQ6S8J7 498 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.47■■□□□ 1.19
ATG4B-222ENST00000491867 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.46■■□□□ 1.19
ATG4B-222ENST00000491867 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-222ENST00000491867 CEP162Q5TB80 1403 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-222ENST00000491867 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-222ENST00000491867 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-222ENST00000491867 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-222ENST00000491867 ERVK-7P63135 1459 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-222ENST00000491867 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-222ENST00000491867 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-222ENST00000491867 LTKP29376 864 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-222ENST00000491867 ABCC3O15438 1527 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-222ENST00000491867 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-222ENST00000491867 TSPY4P0CV99 314 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-222ENST00000491867 TSPY10P0CW01 314 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-222ENST00000491867 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-222ENST00000491867 NCOA2Q15596 1464 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-222ENST00000491867 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-222ENST00000491867 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-222ENST00000491867 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-222ENST00000491867 EID1Q9Y6B2 187 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM94Q12767 1356 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-222ENST00000491867 SLIT1O75093 1534 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-222ENST00000491867 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-222ENST00000491867 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-222ENST00000491867 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-222ENST00000491867 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-222ENST00000491867 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-222ENST00000491867 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-222ENST00000491867 KCNA6P17658 529 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-222ENST00000491867 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-222ENST00000491867 CEP152O94986 1710 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-222ENST00000491867 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-222ENST00000491867 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-222ENST00000491867 MAP3K1Q13233 1512 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-222ENST00000491867 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-222ENST00000491867 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-222ENST00000491867 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-222ENST00000491867 JCADQ9P266 1359 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-222ENST00000491867 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-222ENST00000491867 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-222ENST00000491867 SLAIN2Q9P270 581 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-222ENST00000491867 PIK3C2BO00750 1634 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-222ENST00000491867 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-222ENST00000491867 MSH6P52701 1360 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-222ENST00000491867 TRIM52Q96A61 297 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-222ENST00000491867 PHLPP1O60346 1717 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-222ENST00000491867 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-222ENST00000491867 IDI1Q13907 227 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-222ENST00000491867 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.137e-14■■□□□ 11.6
ATG4B-222ENST00000491867 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-222ENST00000491867 TET3O43151 1660 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-222ENST00000491867 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-222ENST00000491867 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-222ENST00000491867 LRP6O75581 1613 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-222ENST00000491867 BCANQ96GW7 911 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-222ENST00000491867 KIF15Q9NS87 1388 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-222ENST00000491867 NWD1Q149M9 1564 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-222ENST00000491867 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-222ENST00000491867 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-222ENST00000491867 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-222ENST00000491867 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-222ENST00000491867 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-222ENST00000491867 KANK1Q14678 1352 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-222ENST00000491867 RXRBP28702 533 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-222ENST00000491867 ERBINQ96RT1 1412 aa22.02■■□□□ 1.12
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