RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
PTPRVP-201ENST00000482597 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRVP-201ENST00000482597 UGGT2Q9NYU1 1516 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRVP-201ENST00000482597 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRVP-201ENST00000482597 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.77□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 NUP160Q12769 1436 aa12.77□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 KIAA0556O60303 1618 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 CD109Q6YHK3 1445 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 AKNAQ7Z591 1439 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 ROCK1Q13464 1354 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC7Q96M83 1385 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 CFAP53Q96M91 514 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC184Q52MB2 194 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC146Q8IYE0 955 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC141Q6ZP82 1450 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 PBRM1Q86U86 1689 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 CEP170Q5SW79 1584 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 MAPKBP1O60336 1514 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRVP-201ENST00000482597 KIF14Q15058 1648 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 RALBP1Q15311 655 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 ARXQ96QS3 562 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 NLRP13Q86W25 1043 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.69□□□□□ -0.385e-9■■■■■ 30.9
PTPRVP-201ENST00000482597 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 ADGRL1O94910 1474 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 ASXL2Q76L83 1435 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 FANCAO15360 1455 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 CABP2Q9NPB3 220 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 NUDCQ9Y266 331 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 EID1Q9Y6B2 187 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 SAMD9Q5K651 1589 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRVP-201ENST00000482597 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A0G2JS52 829 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 PLCH2O75038 1416 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 SYCP2Q9BX26 1530 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 IDI1Q13907 227 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 TERF2IPQ9NYB0 399 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 EVC2Q86UK5 1308 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 TXNDC2Q86VQ3 553 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 CNTLNQ9NXG0 1405 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 PRAM1Q96QH2 718 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 ERBINQ96RT1 1412 aa12.58□□□□□ -0.39
PTPRVP-201ENST00000482597 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 APAF1O14727 1248 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 PLIN1O60240 522 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 RCAN3Q9UKA8 241 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 PPP4R2Q9NY27 417 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 WDR7Q9Y4E6 1490 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC52A1Q9NWF4 448 aa12.55□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 RGS3P49796 1198 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 ABCC2Q92887 1545 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 WAPLQ7Z5K2 1190 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 ADAMTS8Q9UP79 889 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 NUTM2GQ5VZR2 741 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 CLUAP1Q96AJ1 413 aa12.53□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 CGNL1Q0VF96 1302 aa12.53□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.53□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 STAC3Q96MF2 364 aa12.52□□□□□ -0.4
PTPRVP-201ENST00000482597 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
PTPRVP-201ENST00000482597 GOLGA2Q08379 1002 aa12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.5 ms