RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481120.1

LAMA5-209, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 386 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-209ENST00000481120 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.11■■■■□ 3.21
LAMA5-209ENST00000481120 PTPRKQ15262 1439 aa35.11■■■■□ 3.21
LAMA5-209ENST00000481120 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.11■■■■□ 3.21
LAMA5-209ENST00000481120 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
LAMA5-209ENST00000481120 KIF15Q9NS87 1388 aa35.1■■■■□ 3.21
LAMA5-209ENST00000481120 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
LAMA5-209ENST00000481120 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.09■■■■□ 3.21
LAMA5-209ENST00000481120 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
LAMA5-209ENST00000481120 ERBINQ96RT1 1412 aa35.05■■■■□ 3.2
LAMA5-209ENST00000481120 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.05■■■■□ 3.2
LAMA5-209ENST00000481120 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.02■■■■□ 3.2
LAMA5-209ENST00000481120 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
LAMA5-209ENST00000481120 PZPP20742 1482 aa35■■■■□ 3.19
LAMA5-209ENST00000481120 NCOA1Q15788 1441 aa34.99■■■■□ 3.19
LAMA5-209ENST00000481120 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
LAMA5-209ENST00000481120 TNRQ92752 1358 aa34.93■■■■□ 3.18
LAMA5-209ENST00000481120 ADGRL2O95490 1459 aa34.92■■■■□ 3.18
LAMA5-209ENST00000481120 KANK1Q14678 1352 aa34.92■■■■□ 3.18
LAMA5-209ENST00000481120 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.92■■■■□ 3.187e-6■■■□□ 16.5
LAMA5-209ENST00000481120 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
LAMA5-209ENST00000481120 ABCC3O15438 1527 aa34.9■■■■□ 3.18
LAMA5-209ENST00000481120 PTPRTO14522 1441 aa34.89■■■■□ 3.18
LAMA5-209ENST00000481120 PKD2Q13563 968 aa34.89■■■■□ 3.18
LAMA5-209ENST00000481120 STRCQ7RTU9 1775 aa34.87■■■■□ 3.17
LAMA5-209ENST00000481120 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.87■■■■□ 3.17
LAMA5-209ENST00000481120 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.86■■■■□ 3.17
LAMA5-209ENST00000481120 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
LAMA5-209ENST00000481120 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.85■■■■□ 3.173e-9■□□□□ 9.6
LAMA5-209ENST00000481120 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
LAMA5-209ENST00000481120 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
LAMA5-209ENST00000481120 PLA2R1Q13018 1463 aa34.84■■■■□ 3.17
LAMA5-209ENST00000481120 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
LAMA5-209ENST00000481120 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.83■■■■□ 3.17
LAMA5-209ENST00000481120 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.83■■■■□ 3.17
LAMA5-209ENST00000481120 NLRP1Q9C000 1473 aa34.83■■■■□ 3.17
LAMA5-209ENST00000481120 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
LAMA5-209ENST00000481120 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.81■■■■□ 3.16
LAMA5-209ENST00000481120 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
LAMA5-209ENST00000481120 ROCK1Q13464 1354 aa34.81■■■■□ 3.16
LAMA5-209ENST00000481120 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.8■■■■□ 3.16
LAMA5-209ENST00000481120 DEPDC5O75140 1603 aa34.77■■■■□ 3.16
LAMA5-209ENST00000481120 FBXO41Q8TF61 875 aa34.76■■■■□ 3.16
LAMA5-209ENST00000481120 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.74■■■■□ 3.15
LAMA5-209ENST00000481120 CERKQ8TCT0 537 aa34.73■■■■□ 3.15
LAMA5-209ENST00000481120 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.73■■■■□ 3.15
LAMA5-209ENST00000481120 ERVK-7P63135 1459 aa34.71■■■■□ 3.15
LAMA5-209ENST00000481120 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.7■■■■□ 3.15
LAMA5-209ENST00000481120 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.7■■■■□ 3.14
LAMA5-209ENST00000481120 CEP152O94986 1710 aa34.69■■■■□ 3.14
LAMA5-209ENST00000481120 ITGAEP38570 1179 aa34.67■■■■□ 3.14
LAMA5-209ENST00000481120 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.66■■■■□ 3.14
LAMA5-209ENST00000481120 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.66■■■■□ 3.14
LAMA5-209ENST00000481120 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
LAMA5-209ENST00000481120 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
LAMA5-209ENST00000481120 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
LAMA5-209ENST00000481120 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.55■■■■□ 3.12
LAMA5-209ENST00000481120 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.52■■■■□ 3.12
LAMA5-209ENST00000481120 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.5■■■■□ 3.11
LAMA5-209ENST00000481120 NOS1P29475 1434 aa34.48■■■■□ 3.11
LAMA5-209ENST00000481120 MED14O60244 1454 aa34.48■■■■□ 3.11
LAMA5-209ENST00000481120 IDI1Q13907 227 aa34.48■■■■□ 3.11
LAMA5-209ENST00000481120 EID1Q9Y6B2 187 aa34.47■■■■□ 3.11
LAMA5-209ENST00000481120 UNC13BO14795 1591 aa34.46■■■■□ 3.11
LAMA5-209ENST00000481120 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
LAMA5-209ENST00000481120 NUP155O75694 1391 aa34.46■■■■□ 3.11
LAMA5-209ENST00000481120 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.44■■■■□ 3.1
LAMA5-209ENST00000481120 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.44■■■■□ 3.1
LAMA5-209ENST00000481120 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
LAMA5-209ENST00000481120 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
LAMA5-209ENST00000481120 TET3O43151 1660 aa34.42■■■■□ 3.1
LAMA5-209ENST00000481120 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.41■■■■□ 3.1
LAMA5-209ENST00000481120 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.41■■■■□ 3.1
LAMA5-209ENST00000481120 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.39■■■■□ 3.1
LAMA5-209ENST00000481120 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
LAMA5-209ENST00000481120 SLIT1O75093 1534 aa34.38■■■■□ 3.09
LAMA5-209ENST00000481120 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.37■■■■□ 3.09
LAMA5-209ENST00000481120 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.36■■■■□ 3.09
LAMA5-209ENST00000481120 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
LAMA5-209ENST00000481120 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.35■■■■□ 3.09
LAMA5-209ENST00000481120 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
LAMA5-209ENST00000481120 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.34■■■■□ 3.09
LAMA5-209ENST00000481120 LTKP29376 864 aa34.33■■■■□ 3.09
LAMA5-209ENST00000481120 PIK3C2BO00750 1634 aa34.33■■■■□ 3.09
LAMA5-209ENST00000481120 SYNMO15061 1565 aa34.32■■■■□ 3.09
LAMA5-209ENST00000481120 NAIPQ13075 1403 aa34.32■■■■□ 3.08
LAMA5-209ENST00000481120 HFM1A2PYH4 1435 aa34.29■■■■□ 3.08
LAMA5-209ENST00000481120 IQGAP1P46940 1657 aa34.28■■■■□ 3.08
LAMA5-209ENST00000481120 CPS1P31327 1500 aa34.27■■■■□ 3.08
LAMA5-209ENST00000481120 ADGRB3O60242 1522 aa34.23■■■■□ 3.07
LAMA5-209ENST00000481120 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
LAMA5-209ENST00000481120 E9PCH4 1651 aa34.22■■■■□ 3.07
LAMA5-209ENST00000481120 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.2■■■■□ 3.07
LAMA5-209ENST00000481120 TRIM52Q96A61 297 aa34.18■■■■□ 3.06
LAMA5-209ENST00000481120 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
LAMA5-209ENST00000481120 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.14■■■■□ 3.06
LAMA5-209ENST00000481120 TOM1O60784 492 aa34.11■■■■□ 3.05
LAMA5-209ENST00000481120 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
LAMA5-209ENST00000481120 BCANQ96GW7 911 aa34.1■■■■□ 3.05
LAMA5-209ENST00000481120 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.1■■■■□ 3.05
LAMA5-209ENST00000481120 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.08■■■■□ 3.05
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