RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 UNC13BO14795 1591 aa29.99■■■□□ 2.39
ACTB-210ENST00000477812 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.98■■■□□ 2.39
ACTB-210ENST00000477812 MLECQ14165 292 aa29.96■■■□□ 2.39
ACTB-210ENST00000477812 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.95■■■□□ 2.39
ACTB-210ENST00000477812 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.95■■■□□ 2.38
ACTB-210ENST00000477812 GGT6Q6P531 493 aa29.94■■■□□ 2.38
ACTB-210ENST00000477812 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.94■■■□□ 2.38
ACTB-210ENST00000477812 MADDQ8WXG6 1647 aa29.93■■■□□ 2.38
ACTB-210ENST00000477812 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.91■■■□□ 2.38
ACTB-210ENST00000477812 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.91■■■□□ 2.38
ACTB-210ENST00000477812 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.9■■■□□ 2.38
ACTB-210ENST00000477812 ABCC3O15438 1527 aa29.9■■■□□ 2.38
ACTB-210ENST00000477812 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.88■■■□□ 2.37
ACTB-210ENST00000477812 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
ACTB-210ENST00000477812 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.86■■■□□ 2.37
ACTB-210ENST00000477812 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.85■■■□□ 2.37
ACTB-210ENST00000477812 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.85■■■□□ 2.37
ACTB-210ENST00000477812 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
ACTB-210ENST00000477812 CEP152O94986 1710 aa29.83■■■□□ 2.37
ACTB-210ENST00000477812 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.372e-37■□□□□ 8.4
ACTB-210ENST00000477812 MROH2AA6NES4 1674 aa29.82■■■□□ 2.36
ACTB-210ENST00000477812 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
ACTB-210ENST00000477812 NUP155O75694 1391 aa29.81■■■□□ 2.36
ACTB-210ENST00000477812 KANK1Q14678 1352 aa29.81■■■□□ 2.36
ACTB-210ENST00000477812 HRCP23327 699 aa29.81■■■□□ 2.36
ACTB-210ENST00000477812 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.8■■■□□ 2.36
ACTB-210ENST00000477812 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.79■■■□□ 2.36
ACTB-210ENST00000477812 PZPP20742 1482 aa29.79■■■□□ 2.36
ACTB-210ENST00000477812 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.78■■■□□ 2.36
ACTB-210ENST00000477812 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.76■■■□□ 2.36
ACTB-210ENST00000477812 TET3O43151 1660 aa29.76■■■□□ 2.36
ACTB-210ENST00000477812 PTPRMP28827 1452 aa29.76■■■□□ 2.35
ACTB-210ENST00000477812 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
ACTB-210ENST00000477812 ZMYM3Q14202 1370 aa29.74■■■□□ 2.35
ACTB-210ENST00000477812 C3P01024 1663 aa29.73■■■□□ 2.35
ACTB-210ENST00000477812 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.73■■■□□ 2.35
ACTB-210ENST00000477812 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
ACTB-210ENST00000477812 NPATQ14207 1427 aa29.71■■■□□ 2.35
ACTB-210ENST00000477812 TRIM52Q96A61 297 aa29.7■■■□□ 2.35
ACTB-210ENST00000477812 E9PCH4 1651 aa29.66■■■□□ 2.34
ACTB-210ENST00000477812 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
ACTB-210ENST00000477812 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
ACTB-210ENST00000477812 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.61■■■□□ 2.33
ACTB-210ENST00000477812 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
ACTB-210ENST00000477812 ERVK-7P63135 1459 aa29.61■■■□□ 2.33
ACTB-210ENST00000477812 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.6■■■□□ 2.33
ACTB-210ENST00000477812 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.6■■■□□ 2.33
ACTB-210ENST00000477812 NOS1P29475 1434 aa29.58■■■□□ 2.33
ACTB-210ENST00000477812 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
ACTB-210ENST00000477812 PKD2Q13563 968 aa29.56■■■□□ 2.32
ACTB-210ENST00000477812 PTPRTO14522 1441 aa29.54■■■□□ 2.32
ACTB-210ENST00000477812 SYNMO15061 1565 aa29.53■■■□□ 2.32
ACTB-210ENST00000477812 PLA2R1Q13018 1463 aa29.51■■■□□ 2.31
ACTB-210ENST00000477812 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.51■■■□□ 2.31
ACTB-210ENST00000477812 TNRQ92752 1358 aa29.5■■■□□ 2.31
ACTB-210ENST00000477812 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
ACTB-210ENST00000477812 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.49■■■□□ 2.31
ACTB-210ENST00000477812 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
ACTB-210ENST00000477812 TRPM2O94759 1503 aa29.47■■■□□ 2.31
ACTB-210ENST00000477812 FOXD1Q16676 465 aa29.47■■■□□ 2.31
ACTB-210ENST00000477812 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.45■■■□□ 2.31
ACTB-210ENST00000477812 PIK3C2BO00750 1634 aa29.45■■■□□ 2.3
ACTB-210ENST00000477812 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
ACTB-210ENST00000477812 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.42■■■□□ 2.3
ACTB-210ENST00000477812 NLRP1Q9C000 1473 aa29.42■■■□□ 2.3
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.39■■■□□ 2.3
ACTB-210ENST00000477812 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
ACTB-210ENST00000477812 CLTCL1P53675 1640 aa29.38■■■□□ 2.29
ACTB-210ENST00000477812 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
ACTB-210ENST00000477812 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.36■■■□□ 2.29
ACTB-210ENST00000477812 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.36■■■□□ 2.29
ACTB-210ENST00000477812 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.35■■■□□ 2.29
ACTB-210ENST00000477812 IDI1Q13907 227 aa29.34■■■□□ 2.29
ACTB-210ENST00000477812 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.34■■■□□ 2.29
ACTB-210ENST00000477812 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
ACTB-210ENST00000477812 ADGRB3O60242 1522 aa29.3■■■□□ 2.28
ACTB-210ENST00000477812 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.28■■■□□ 2.28
ACTB-210ENST00000477812 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.28■■■□□ 2.28
ACTB-210ENST00000477812 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.27■■■□□ 2.28
ACTB-210ENST00000477812 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.21■■■□□ 2.27
ACTB-210ENST00000477812 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
ACTB-210ENST00000477812 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.21■■■□□ 2.27
ACTB-210ENST00000477812 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.2■■■□□ 2.26
ACTB-210ENST00000477812 KIF1BO60333 1816 aa29.19■■■□□ 2.26
ACTB-210ENST00000477812 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.17■■■□□ 2.26
ACTB-210ENST00000477812 SLIT1O75093 1534 aa29.16■■■□□ 2.26
ACTB-210ENST00000477812 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.13■■■□□ 2.25
ACTB-210ENST00000477812 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
ACTB-210ENST00000477812 ZFYVE9O95405 1425 aa29.12■■■□□ 2.25
ACTB-210ENST00000477812 HSPA2P54652 639 aa29.12■■■□□ 2.25
ACTB-210ENST00000477812 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.12■■■□□ 2.25
ACTB-210ENST00000477812 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.12■■■□□ 2.25
ACTB-210ENST00000477812 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
ACTB-210ENST00000477812 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.1■■■□□ 2.25
ACTB-210ENST00000477812 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.08■■■□□ 2.25
ACTB-210ENST00000477812 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
ACTB-210ENST00000477812 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.05■■■□□ 2.24
ACTB-210ENST00000477812 IFT172Q9UG01 1749 aa29.03■■■□□ 2.24
ACTB-210ENST00000477812 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
ACTB-210ENST00000477812 PPLO60437 1756 aa29.02■■■□□ 2.24
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