RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468915.5

SLC13A3-209, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 1,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-209ENST00000468915 HRCP23327 699 aa22.25■■□□□ 1.15
SLC13A3-209ENST00000468915 KIF3BO15066 747 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC13A3-209ENST00000468915 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SLC13A3-209ENST00000468915 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC13A3-209ENST00000468915 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.21■■□□□ 1.15
SLC13A3-209ENST00000468915 PZPP20742 1482 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3-209ENST00000468915 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3-209ENST00000468915 CEP152O94986 1710 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC13A3-209ENST00000468915 NUP155O75694 1391 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC13A3-209ENST00000468915 GGT6Q6P531 493 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3-209ENST00000468915 ABCC3O15438 1527 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3-209ENST00000468915 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.132e-8■■■□□ 18.6
SLC13A3-209ENST00000468915 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC13A3-209ENST00000468915 TRIM52Q96A61 297 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3-209ENST00000468915 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3-209ENST00000468915 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3-209ENST00000468915 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC13A3-209ENST00000468915 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC13A3-209ENST00000468915 MLECQ14165 292 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC13A3-209ENST00000468915 TET3O43151 1660 aa22.08■■□□□ 1.12
SLC13A3-209ENST00000468915 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SLC13A3-209ENST00000468915 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SLC13A3-209ENST00000468915 E9PCH4 1651 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3-209ENST00000468915 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3-209ENST00000468915 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3-209ENST00000468915 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3-209ENST00000468915 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3-209ENST00000468915 KANK1Q14678 1352 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3-209ENST00000468915 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC13A3-209ENST00000468915 MADDQ8WXG6 1647 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC13A3-209ENST00000468915 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3-209ENST00000468915 MROH2AA6NES4 1674 aa22■■□□□ 1.11
SLC13A3-209ENST00000468915 NPATQ14207 1427 aa21.99■■□□□ 1.11
SLC13A3-209ENST00000468915 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC13A3-209ENST00000468915 PKD2Q13563 968 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC13A3-209ENST00000468915 FOXD1Q16676 465 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC13A3-209ENST00000468915 PLA2R1Q13018 1463 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC13A3-209ENST00000468915 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-209ENST00000468915 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-209ENST00000468915 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.95■■□□□ 1.11
SLC13A3-209ENST00000468915 C3P01024 1663 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-209ENST00000468915 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SLC13A3-209ENST00000468915 ZMYM3Q14202 1370 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-209ENST00000468915 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-209ENST00000468915 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-209ENST00000468915 PTPRTO14522 1441 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-209ENST00000468915 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-209ENST00000468915 NOS1P29475 1434 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC13A3-209ENST00000468915 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC13A3-209ENST00000468915 SYNMO15061 1565 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ERVK-7P63135 1459 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-209ENST00000468915 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-209ENST00000468915 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-209ENST00000468915 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC13A3-209ENST00000468915 TRPM2O94759 1503 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-209ENST00000468915 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-209ENST00000468915 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-209ENST00000468915 PTPRMP28827 1452 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-209ENST00000468915 PIK3C2BO00750 1634 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-209ENST00000468915 CLTCL1P53675 1640 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-209ENST00000468915 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-209ENST00000468915 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-209ENST00000468915 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC13A3-209ENST00000468915 TNRQ92752 1358 aa21.75■■□□□ 1.07
SLC13A3-209ENST00000468915 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.74■■□□□ 1.07
SLC13A3-209ENST00000468915 IDI1Q13907 227 aa21.73■■□□□ 1.07
SLC13A3-209ENST00000468915 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.72■■□□□ 1.07
SLC13A3-209ENST00000468915 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.72■■□□□ 1.07
SLC13A3-209ENST00000468915 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.72■■□□□ 1.07
SLC13A3-209ENST00000468915 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SLC13A3-209ENST00000468915 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.71■■□□□ 1.07
SLC13A3-209ENST00000468915 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC13A3-209ENST00000468915 KIF1BO60333 1816 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC13A3-209ENST00000468915 ADGRB3O60242 1522 aa21.69■■□□□ 1.06
SLC13A3-209ENST00000468915 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.68■■□□□ 1.06
SLC13A3-209ENST00000468915 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.67■■□□□ 1.06
SLC13A3-209ENST00000468915 NLRP1Q9C000 1473 aa21.67■■□□□ 1.06
SLC13A3-209ENST00000468915 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SLC13A3-209ENST00000468915 NEUROD1Q13562 356 aa21.66■■□□□ 1.06
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SLC13A3-209ENST00000468915 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.64■■□□□ 1.05
SLC13A3-209ENST00000468915 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SLC13A3-209ENST00000468915 IFT172Q9UG01 1749 aa21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3-209ENST00000468915 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-209ENST00000468915 PPLO60437 1756 aa21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3-209ENST00000468915 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3-209ENST00000468915 RGL3Q3MIN7 710 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3-209ENST00000468915 ZFYVE9O95405 1425 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3-209ENST00000468915 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3-209ENST00000468915 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3-209ENST00000468915 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3-209ENST00000468915 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3-209ENST00000468915 SLIT1O75093 1534 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3-209ENST00000468915 TONSLQ96HA7 1378 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3-209ENST00000468915 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3-209ENST00000468915 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3-209ENST00000468915 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.49■■□□□ 1.03
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