RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468915.5

SLC13A3-209, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 1,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-209ENST00000468915 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.35■■■■□ 3.25
SLC13A3-209ENST00000468915 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.15■■■□□ 2.58
SLC13A3-209ENST00000468915 ABCC9O60706 1549 aa29.93■■■□□ 2.38
SLC13A3-209ENST00000468915 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
SLC13A3-209ENST00000468915 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.27■■■□□ 2.28
SLC13A3-209ENST00000468915 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.16■■■□□ 2.26
SLC13A3-209ENST00000468915 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.15■■■□□ 2.26
SLC13A3-209ENST00000468915 NACADO15069 1562 aa29.12■■■□□ 2.25
SLC13A3-209ENST00000468915 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29■■■□□ 2.23
SLC13A3-209ENST00000468915 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.51■■■□□ 2.15
SLC13A3-209ENST00000468915 SCRIBQ14160 1630 aa28.48■■■□□ 2.15
SLC13A3-209ENST00000468915 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.25■■■□□ 2.11
SLC13A3-209ENST00000468915 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.24■■■□□ 2.11
SLC13A3-209ENST00000468915 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
SLC13A3-209ENST00000468915 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.53■■■□□ 2
SLC13A3-209ENST00000468915 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
SLC13A3-209ENST00000468915 SMARCA4P51532 1647 aa27.31■■□□□ 1.96
SLC13A3-209ENST00000468915 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SLC13A3-209ENST00000468915 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.29■■□□□ 1.96
SLC13A3-209ENST00000468915 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
SLC13A3-209ENST00000468915 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.12■■□□□ 1.93
SLC13A3-209ENST00000468915 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.05■■□□□ 1.92
SLC13A3-209ENST00000468915 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.05■■□□□ 1.92
SLC13A3-209ENST00000468915 WIZO95785 1651 aa27.03■■□□□ 1.92
SLC13A3-209ENST00000468915 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.01■■□□□ 1.91
SLC13A3-209ENST00000468915 SMARCA2P51531 1590 aa26.94■■□□□ 1.9
SLC13A3-209ENST00000468915 NCAPD3P42695 1498 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC13A3-209ENST00000468915 HMGXB3Q12766 1538 aa26.81■■□□□ 1.88
SLC13A3-209ENST00000468915 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SLC13A3-209ENST00000468915 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SLC13A3-209ENST00000468915 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SLC13A3-209ENST00000468915 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC13A3-209ENST00000468915 NESP48681 1621 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC13A3-209ENST00000468915 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC13A3-209ENST00000468915 CFTRP13569 1480 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC13A3-209ENST00000468915 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC13A3-209ENST00000468915 PRDM2Q13029 1718 aa25.98■■□□□ 1.75
SLC13A3-209ENST00000468915 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.83■■□□□ 1.73
SLC13A3-209ENST00000468915 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC13A3-209ENST00000468915 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC13A3-209ENST00000468915 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.7■■□□□ 1.71
SLC13A3-209ENST00000468915 ABCC8Q09428 1581 aa25.66■■□□□ 1.7
SLC13A3-209ENST00000468915 ERCC6Q03468 1493 aa25.65■■□□□ 1.7
SLC13A3-209ENST00000468915 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SLC13A3-209ENST00000468915 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SLC13A3-209ENST00000468915 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.56■■□□□ 1.68
SLC13A3-209ENST00000468915 CUX1P39880 1505 aa25.56■■□□□ 1.68
SLC13A3-209ENST00000468915 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
SLC13A3-209ENST00000468915 SYNJ1O43426 1573 aa25.53■■□□□ 1.68
SLC13A3-209ENST00000468915 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.51■■□□□ 1.67
SLC13A3-209ENST00000468915 WDR62O43379 1518 aa25.5■■□□□ 1.67
SLC13A3-209ENST00000468915 TOPBP1Q92547 1522 aa25.5■■□□□ 1.67
SLC13A3-209ENST00000468915 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.47■■□□□ 1.67
SLC13A3-209ENST00000468915 TOP2BQ02880 1626 aa25.46■■□□□ 1.67
SLC13A3-209ENST00000468915 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC13A3-209ENST00000468915 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC13A3-209ENST00000468915 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SLC13A3-209ENST00000468915 CUX2O14529 1486 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC13A3-209ENST00000468915 TRIM41Q8WV44 630 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC13A3-209ENST00000468915 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SLC13A3-209ENST00000468915 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC13A3-209ENST00000468915 SOGA1O94964 1423 aa25.18■■□□□ 1.62
SLC13A3-209ENST00000468915 WDR97A6NE52 1622 aa25.17■■□□□ 1.62
SLC13A3-209ENST00000468915 IFT140Q96RY7 1462 aa25.14■■□□□ 1.61
SLC13A3-209ENST00000468915 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.12■■□□□ 1.61
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC13A3-209ENST00000468915 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.02■■□□□ 1.6
SLC13A3-209ENST00000468915 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.01■■□□□ 1.59
SLC13A3-209ENST00000468915 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SLC13A3-209ENST00000468915 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SLC13A3-209ENST00000468915 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
SLC13A3-209ENST00000468915 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC13A3-209ENST00000468915 KIF27Q86VH2 1401 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC13A3-209ENST00000468915 PBRM1Q86U86 1689 aa24.87■■□□□ 1.57
SLC13A3-209ENST00000468915 IGF1RP08069 1367 aa24.82■■□□□ 1.56
SLC13A3-209ENST00000468915 GRIN2BQ13224 1484 aa24.81■■□□□ 1.56
SLC13A3-209ENST00000468915 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.81■■□□□ 1.56
SLC13A3-209ENST00000468915 EEA1Q15075 1411 aa24.8■■□□□ 1.56
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SLC13A3-209ENST00000468915 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.73■■□□□ 1.55
SLC13A3-209ENST00000468915 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.71■■□□□ 1.55
SLC13A3-209ENST00000468915 ADAMTS12P58397 1594 aa24.7■■□□□ 1.54
SLC13A3-209ENST00000468915 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SLC13A3-209ENST00000468915 CUL7Q14999 1698 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC13A3-209ENST00000468915 PRXQ9BXM0 1461 aa24.67■■□□□ 1.54
SLC13A3-209ENST00000468915 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.64■■□□□ 1.53
SLC13A3-209ENST00000468915 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.63■■□□□ 1.53
SLC13A3-209ENST00000468915 SYNJ2O15056 1496 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC13A3-209ENST00000468915 KIF21BO75037 1637 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC13A3-209ENST00000468915 CHD1O14646 1710 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC13A3-209ENST00000468915 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.55■■□□□ 1.52
SLC13A3-209ENST00000468915 GRIN2AQ12879 1464 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC13A3-209ENST00000468915 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SLC13A3-209ENST00000468915 FBLN2P98095 1184 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC13A3-209ENST00000468915 CEP170Q5SW79 1584 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC13A3-209ENST00000468915 GOLGA3Q08378 1498 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC13A3-209ENST00000468915 NUP160Q12769 1436 aa24.42■■□□□ 1.5
SLC13A3-209ENST00000468915 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.39■■□□□ 1.5
SLC13A3-209ENST00000468915 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.38■■□□□ 1.49
SLC13A3-209ENST00000468915 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.33■■□□□ 1.49
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