RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 CCDC7Q96M83 1385 aa26.28■■□□□ 1.8
NME4-210ENST00000468031 PLA2R1Q13018 1463 aa26.28■■□□□ 1.8
NME4-210ENST00000468031 AFAP1Q8N556 730 aa26.27■■□□□ 1.8
NME4-210ENST00000468031 DEPDC5O75140 1603 aa26.26■■□□□ 1.79
NME4-210ENST00000468031 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.25■■□□□ 1.79
NME4-210ENST00000468031 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
NME4-210ENST00000468031 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.25■■□□□ 1.79
NME4-210ENST00000468031 KDM5CP41229 1560 aa26.25■■□□□ 1.79
NME4-210ENST00000468031 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.24■■□□□ 1.79
NME4-210ENST00000468031 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.23■■□□□ 1.79
NME4-210ENST00000468031 USP47Q96K76 1375 aa26.22■■□□□ 1.79
NME4-210ENST00000468031 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
NME4-210ENST00000468031 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
NME4-210ENST00000468031 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.18■■□□□ 1.78
NME4-210ENST00000468031 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.18■■□□□ 1.78
NME4-210ENST00000468031 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.18■■□□□ 1.78
NME4-210ENST00000468031 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
NME4-210ENST00000468031 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-210ENST00000468031 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-210ENST00000468031 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-210ENST00000468031 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-210ENST00000468031 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
NME4-210ENST00000468031 E9PCH4 1651 aa26.14■■□□□ 1.78
NME4-210ENST00000468031 CD109Q6YHK3 1445 aa26.14■■□□□ 1.78
NME4-210ENST00000468031 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.14■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 TET3O43151 1660 aa26.13■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 A2MP01023 1474 aa26.13■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.12■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.12■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.12■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 TRPM2O94759 1503 aa26.1■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.1■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 KANK1Q14678 1352 aa26.09■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.09■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 PTPRTO14522 1441 aa26.08■■□□□ 1.77
NME4-210ENST00000468031 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.08■■□□□ 1.76
NME4-210ENST00000468031 LAMC1P11047 1609 aa26.07■■□□□ 1.76
NME4-210ENST00000468031 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.07■■□□□ 1.76
NME4-210ENST00000468031 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.07■■□□□ 1.76
NME4-210ENST00000468031 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-210ENST00000468031 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
NME4-210ENST00000468031 NEO1Q92859 1461 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-210ENST00000468031 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.05■■□□□ 1.76
NME4-210ENST00000468031 CEP152O94986 1710 aa26.03■■□□□ 1.76
NME4-210ENST00000468031 RGL3Q3MIN7 710 aa26.01■■□□□ 1.75
NME4-210ENST00000468031 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
NME4-210ENST00000468031 HECW2Q9P2P5 1572 aa26■■□□□ 1.75
NME4-210ENST00000468031 KIF3BO15066 747 aa26■■□□□ 1.75
NME4-210ENST00000468031 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26■■□□□ 1.75
NME4-210ENST00000468031 MYT1LQ9UL68 1186 aa26■■□□□ 1.75
NME4-210ENST00000468031 NEURL4Q96JN8 1562 aa26■■□□□ 1.75
NME4-210ENST00000468031 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
NME4-210ENST00000468031 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.98■■□□□ 1.75
NME4-210ENST00000468031 CLTCL1P53675 1640 aa25.97■■□□□ 1.75
NME4-210ENST00000468031 STAC3Q96MF2 364 aa25.96■■□□□ 1.75
NME4-210ENST00000468031 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.96■■□□□ 1.75
NME4-210ENST00000468031 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.94■■□□□ 1.74
NME4-210ENST00000468031 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.94■■□□□ 1.74
NME4-210ENST00000468031 GLI2P10070 1586 aa25.94■■□□□ 1.74
NME4-210ENST00000468031 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-210ENST00000468031 MADDQ8WXG6 1647 aa25.91■■□□□ 1.74
NME4-210ENST00000468031 ABCA6Q8N139 1617 aa25.89■■□□□ 1.74
NME4-210ENST00000468031 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
NME4-210ENST00000468031 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.88■■□□□ 1.73
NME4-210ENST00000468031 RICTORQ6R327 1708 aa25.84■■□□□ 1.73
NME4-210ENST00000468031 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
NME4-210ENST00000468031 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.81■■□□□ 1.72
NME4-210ENST00000468031 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.81■■□□□ 1.72
NME4-210ENST00000468031 KIF1BO60333 1816 aa25.81■■□□□ 1.72
NME4-210ENST00000468031 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.8■■□□□ 1.72
NME4-210ENST00000468031 IQGAP1P46940 1657 aa25.78■■□□□ 1.72
NME4-210ENST00000468031 MYOM2P54296 1465 aa25.78■■□□□ 1.72
NME4-210ENST00000468031 CCDC184Q52MB2 194 aa25.77■■□□□ 1.72
NME4-210ENST00000468031 TESK2Q96S53 571 aa25.77■■□□□ 1.72
NME4-210ENST00000468031 MRS2Q9HD23 443 aa25.76■■□□□ 1.71
NME4-210ENST00000468031 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
NME4-210ENST00000468031 DIP2BQ9P265 1576 aa25.76■■□□□ 1.71
NME4-210ENST00000468031 ABCC3O15438 1527 aa25.75■■□□□ 1.71
NME4-210ENST00000468031 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.75■■□□□ 1.71
NME4-210ENST00000468031 RAPGEF3O95398 923 aa25.74■■□□□ 1.71
NME4-210ENST00000468031 IFT172Q9UG01 1749 aa25.74■■□□□ 1.71
NME4-210ENST00000468031 NPATQ14207 1427 aa25.74■■□□□ 1.71
NME4-210ENST00000468031 ADGRB3O60242 1522 aa25.72■■□□□ 1.71
NME4-210ENST00000468031 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
NME4-210ENST00000468031 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
NME4-210ENST00000468031 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.71■■□□□ 1.71
NME4-210ENST00000468031 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.7■■□□□ 1.7
NME4-210ENST00000468031 MROH2AA6NES4 1674 aa25.7■■□□□ 1.7
NME4-210ENST00000468031 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
NME4-210ENST00000468031 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
NME4-210ENST00000468031 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.69■■□□□ 1.7
NME4-210ENST00000468031 TMF1P82094 1093 aa25.68■■□□□ 1.7
NME4-210ENST00000468031 GGT6Q6P531 493 aa25.68■■□□□ 1.7
NME4-210ENST00000468031 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.68■■□□□ 1.7
NME4-210ENST00000468031 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.66■■□□□ 1.7
NME4-210ENST00000468031 RALBP1Q15311 655 aa25.65■■□□□ 1.7
NME4-210ENST00000468031 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.64■■□□□ 1.7
NME4-210ENST00000468031 NOS1P29475 1434 aa25.64■■□□□ 1.69
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