RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF15Q9NS87 1388 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ZMYM3Q14202 1370 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-205ENST00000466097 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP1-205ENST00000466097 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-205ENST00000466097 NPATQ14207 1427 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-205ENST00000466097 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ERBINQ96RT1 1412 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP1-205ENST00000466097 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ADGRL2O95490 1459 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1-205ENST00000466097 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1-205ENST00000466097 NCOA1Q15788 1441 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP1-205ENST00000466097 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1-205ENST00000466097 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CEP152O94986 1710 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPRKQ15262 1439 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1-205ENST00000466097 DEPDC5O75140 1603 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1-205ENST00000466097 HSPA2P54652 639 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCC3O15438 1527 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PZPP20742 1482 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-205ENST00000466097 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-205ENST00000466097 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ROCK1Q13464 1354 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-205ENST00000466097 KANK1Q14678 1352 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-205ENST00000466097 ITGAEP38570 1179 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-205ENST00000466097 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-205ENST00000466097 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.193e-7■■■■□ 23.3
SH3BP1-205ENST00000466097 TNRQ92752 1358 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP1-205ENST00000466097 STRCQ7RTU9 1775 aa22.45■■□□□ 1.19
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP1-205ENST00000466097 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-205ENST00000466097 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-205ENST00000466097 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP1-205ENST00000466097 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-205ENST00000466097 UNC13BO14795 1591 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-205ENST00000466097 ERVK-7P63135 1459 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-205ENST00000466097 NLRP1Q9C000 1473 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP1-205ENST00000466097 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP1-205ENST00000466097 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PLA2R1Q13018 1463 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-205ENST00000466097 TET3O43151 1660 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-205ENST00000466097 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP1-205ENST00000466097 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP1-205ENST00000466097 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-205ENST00000466097 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPRTO14522 1441 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP1-205ENST00000466097 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP1-205ENST00000466097 PKD2Q13563 968 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1-205ENST00000466097 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1-205ENST00000466097 CERKQ8TCT0 537 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP1-205ENST00000466097 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP1-205ENST00000466097 NAIPQ13075 1403 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP1-205ENST00000466097 NUP155O75694 1391 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-205ENST00000466097 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP1-205ENST00000466097 E9PCH4 1651 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-205ENST00000466097 SYNMO15061 1565 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-205ENST00000466097 PIK3C2BO00750 1634 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-205ENST00000466097 HFM1A2PYH4 1435 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-205ENST00000466097 NOS1P29475 1434 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP1-205ENST00000466097 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP1-205ENST00000466097 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-205ENST00000466097 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-205ENST00000466097 IDI1Q13907 227 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-205ENST00000466097 ADGRB3O60242 1522 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-205ENST00000466097 SLIT1O75093 1534 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-205ENST00000466097 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-205ENST00000466097 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP1-205ENST00000466097 IQGAP1P46940 1657 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP1-205ENST00000466097 MED14O60244 1454 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-205ENST00000466097 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-205ENST00000466097 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM52Q96A61 297 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-205ENST00000466097 EID1Q9Y6B2 187 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-205ENST00000466097 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-205ENST00000466097 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.08■■□□□ 1.13
SH3BP1-205ENST00000466097 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-205ENST00000466097 LTKP29376 864 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF1BO60333 1816 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-205ENST00000466097 TRPM2O94759 1503 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-205ENST00000466097 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SOCS7O14512 581 aa22■■□□□ 1.11
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