RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.94■■■■□ 3.34
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.09■■■□□ 2.73
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCC9O60706 1549 aa31.38■■■□□ 2.61
SH3BP1-205ENST00000466097 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.22■■■□□ 2.43
SH3BP1-205ENST00000466097 NACADO15069 1562 aa30.15■■■□□ 2.42
SH3BP1-205ENST00000466097 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.05■■■□□ 2.4
SH3BP1-205ENST00000466097 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
SH3BP1-205ENST00000466097 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP1-205ENST00000466097 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP1-205ENST00000466097 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.58■■■□□ 2.33
SH3BP1-205ENST00000466097 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.27
SH3BP1-205ENST00000466097 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.25■■■□□ 2.27
SH3BP1-205ENST00000466097 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.23■■■□□ 2.27
SH3BP1-205ENST00000466097 SCRIBQ14160 1630 aa29.22■■■□□ 2.27
SH3BP1-205ENST00000466097 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP1-205ENST00000466097 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
SH3BP1-205ENST00000466097 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.42■■■□□ 2.14
SH3BP1-205ENST00000466097 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP1-205ENST00000466097 SMARCA4P51532 1647 aa27.95■■■□□ 2.06
SH3BP1-205ENST00000466097 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SMARCA2P51531 1590 aa27.79■■■□□ 2.04
SH3BP1-205ENST00000466097 NCAPD3P42695 1498 aa27.76■■■□□ 2.04
SH3BP1-205ENST00000466097 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.76■■■□□ 2.04
SH3BP1-205ENST00000466097 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.68■■■□□ 2.02
SH3BP1-205ENST00000466097 HMGXB3Q12766 1538 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP1-205ENST00000466097 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.66■■■□□ 2.02
SH3BP1-205ENST00000466097 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
SH3BP1-205ENST00000466097 WIZO95785 1651 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP1-205ENST00000466097 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SH3BP1-205ENST00000466097 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP1-205ENST00000466097 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SH3BP1-205ENST00000466097 NESP48681 1621 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP1-205ENST00000466097 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP1-205ENST00000466097 ERCC6Q03468 1493 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP1-205ENST00000466097 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP1-205ENST00000466097 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.89■■□□□ 1.89
SH3BP1-205ENST00000466097 CUX2O14529 1486 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP1-205ENST00000466097 CFTRP13569 1480 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP1-205ENST00000466097 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP1-205ENST00000466097 PRDM2Q13029 1718 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP1-205ENST00000466097 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP1-205ENST00000466097 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP1-205ENST00000466097 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1-205ENST00000466097 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SH3BP1-205ENST00000466097 WDR62O43379 1518 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP1-205ENST00000466097 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCC8Q09428 1581 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP1-205ENST00000466097 TOPBP1Q92547 1522 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP1-205ENST00000466097 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP1-205ENST00000466097 IFT140Q96RY7 1462 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP1-205ENST00000466097 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP1-205ENST00000466097 CUX1P39880 1505 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP1-205ENST00000466097 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP1-205ENST00000466097 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP1-205ENST00000466097 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP1-205ENST00000466097 SOGA1O94964 1423 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM41Q8WV44 630 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP1-205ENST00000466097 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP1-205ENST00000466097 WDR97A6NE52 1622 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP1-205ENST00000466097 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP1-205ENST00000466097 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
SH3BP1-205ENST00000466097 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.729e-10■■■■■ 32.8
SH3BP1-205ENST00000466097 TOP2BQ02880 1626 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP1-205ENST00000466097 SYNJ1O43426 1573 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP1-205ENST00000466097 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SH3BP1-205ENST00000466097 OSCARQ8IYS5 282 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP1-205ENST00000466097 CHD1O14646 1710 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP1-205ENST00000466097 PBRM1Q86U86 1689 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP1-205ENST00000466097 GRIN2BQ13224 1484 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP1-205ENST00000466097 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP1-205ENST00000466097 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP1-205ENST00000466097 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1-205ENST00000466097 FBLN2P98095 1184 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1-205ENST00000466097 SYNJ2O15056 1496 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP1-205ENST00000466097 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP1-205ENST00000466097 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAMTS12P58397 1594 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP1-205ENST00000466097 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP1-205ENST00000466097 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP1-205ENST00000466097 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP1-205ENST00000466097 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP1-205ENST00000466097 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGEF11O15085 1522 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF27Q86VH2 1401 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1-205ENST00000466097 GRIN2AQ12879 1464 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1-205ENST00000466097 CUL7Q14999 1698 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP1-205ENST00000466097 CEP170Q5SW79 1584 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP1-205ENST00000466097 NUP160Q12769 1436 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP1-205ENST00000466097 IGF1RP08069 1367 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP1-205ENST00000466097 ARAP1Q96P48 1450 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1-205ENST00000466097 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP1-205ENST00000466097 SHROOM2Q13796 1616 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP1-205ENST00000466097 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP1-205ENST00000466097 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP1-205ENST00000466097 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.9■■□□□ 1.58
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