RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.89□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.88□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 PTMSP20962 102 aa13.88□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 HECW1Q76N89 1606 aa13.88□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa13.88□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 RCAN3Q9UKA8 241 aa13.87□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 APBB1O00213 710 aa13.87□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 SOX12O15370 315 aa13.87□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCA8O94911 1581 aa13.86□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
EFTUD2-202ENST00000426333 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 PLB1Q6P1J6 1458 aa13.82□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.81□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 CLSTN1O94985 981 aa13.81□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa13.81□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa13.8□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 ITPRIPQ8IWB1 547 aa13.8□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 ARID3AQ99856 593 aa13.8□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC18Q5T9S5 1454 aa13.8□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 ADCY10Q96PN6 1610 aa13.8□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 KANK1Q14678 1352 aa13.79□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 RALBP1Q15311 655 aa13.78□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 NCOA2Q15596 1464 aa13.78□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 CHMP4AQ9BY43 222 aa13.77□□□□□ -0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 PKD2Q13563 968 aa13.77□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.77□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC34Q96HJ3 373 aa13.77□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPRKQ15262 1439 aa13.77□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.77□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 JPH4Q96JJ6 628 aa13.76□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF14Q15058 1648 aa13.76□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 SETD5Q9C0A6 1442 aa13.75□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 TPM4P67936 248 aa13.74□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 STK31Q9BXU1 1019 aa13.73□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 STK26Q9P289 416 aa13.73□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.73□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 HMMRO75330 724 aa13.73□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 HDAC5Q9UQL6 1122 aa13.73□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.73□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 SMC4Q9NTJ3 1288 aa13.72□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.72□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 CLUAP1Q96AJ1 413 aa13.72□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE3BQ13370 1112 aa13.71□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa13.71□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 GGT6Q6P531 493 aa13.71□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 MLECQ14165 292 aa13.7□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRP13Q86W25 1043 aa13.7□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa13.7□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXD1Q16676 465 aa13.7□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP10BO94823 1461 aa13.7□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 GORABQ5T7V8 394 aa13.7□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.7□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.69□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa13.69□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 GPATCH3Q96I76 525 aa13.68□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 USP35Q9P2H5 1018 aa13.67□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 ST18O60284 1047 aa13.67□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 MPHOSPH9Q99550 1183 aa13.67□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.66□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPKBP1O60336 1514 aa13.66□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 PHF14O94880 888 aa13.66□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM6BO15054 1643 aa13.66□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF3AQ9Y496 699 aa13.66□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.65□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC4A10Q6U841 1118 aa13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms