RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.08■■□□□ 1.61
NEFHP1-201ENST00000412845 CEP170Q5SW79 1584 aa25.07■■□□□ 1.6
NEFHP1-201ENST00000412845 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
NEFHP1-201ENST00000412845 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.05■■□□□ 1.6
NEFHP1-201ENST00000412845 PDE4AP27815 886 aa25.04■■□□□ 1.6
NEFHP1-201ENST00000412845 NLRP13Q86W25 1043 aa25.04■■□□□ 1.6
NEFHP1-201ENST00000412845 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.03■■□□□ 1.6
NEFHP1-201ENST00000412845 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.03■■□□□ 1.6
NEFHP1-201ENST00000412845 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.01■■□□□ 1.6
NEFHP1-201ENST00000412845 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 BACH2Q9BYV9 841 aa24.99■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.99■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 PLIN1O60240 522 aa24.99■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 PTPRGP23470 1445 aa24.98■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 TSPY4P0CV99 314 aa24.98■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 TSPY10P0CW01 314 aa24.98■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 PDE3BQ13370 1112 aa24.98■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.97■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.97■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 SKAP1Q86WV1 359 aa24.97■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.95■■□□□ 1.59
NEFHP1-201ENST00000412845 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
NEFHP1-201ENST00000412845 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.94■■□□□ 1.58
NEFHP1-201ENST00000412845 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
NEFHP1-201ENST00000412845 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
NEFHP1-201ENST00000412845 MS4A1P11836 297 aa24.92■■□□□ 1.58
NEFHP1-201ENST00000412845 FBLN2P98095 1184 aa24.92■■□□□ 1.58
NEFHP1-201ENST00000412845 RGL3Q3MIN7 710 aa24.92■■□□□ 1.58
NEFHP1-201ENST00000412845 JPH4Q96JJ6 628 aa24.91■■□□□ 1.58
NEFHP1-201ENST00000412845 ATP10BO94823 1461 aa24.9■■□□□ 1.58
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.9■■□□□ 1.58
NEFHP1-201ENST00000412845 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.9■■□□□ 1.58
NEFHP1-201ENST00000412845 CRBNQ96SW2 442 aa24.89■■□□□ 1.57
NEFHP1-201ENST00000412845 ABCA8O94911 1581 aa24.89■■□□□ 1.57
NEFHP1-201ENST00000412845 NEFMP07197 916 aa24.88■■□□□ 1.57
NEFHP1-201ENST00000412845 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.88■■□□□ 1.57
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.86■■□□□ 1.57
NEFHP1-201ENST00000412845 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
NEFHP1-201ENST00000412845 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
NEFHP1-201ENST00000412845 TESK2Q96S53 571 aa24.85■■□□□ 1.57
NEFHP1-201ENST00000412845 SYNJ2O15056 1496 aa24.85■■□□□ 1.57
NEFHP1-201ENST00000412845 PANK3Q9H999 370 aa24.84■■□□□ 1.57
NEFHP1-201ENST00000412845 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.83■■□□□ 1.57
NEFHP1-201ENST00000412845 A2MP01023 1474 aa24.82■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.82■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.82■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 IL27Q8NEV9 243 aa24.82■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 PLA2R1Q13018 1463 aa24.82■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.79■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.79■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 NUP160Q12769 1436 aa24.78■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.78■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 USP35Q9P2H5 1018 aa24.77■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 ERBINQ96RT1 1412 aa24.77■■□□□ 1.56
NEFHP1-201ENST00000412845 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.76■■□□□ 1.55
NEFHP1-201ENST00000412845 INSRP06213 1382 aa24.76■■□□□ 1.55
NEFHP1-201ENST00000412845 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.76■■□□□ 1.55
NEFHP1-201ENST00000412845 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.75■■□□□ 1.55
NEFHP1-201ENST00000412845 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.75■■□□□ 1.55
NEFHP1-201ENST00000412845 LAMC1P11047 1609 aa24.73■■□□□ 1.55
NEFHP1-201ENST00000412845 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NEFHP1-201ENST00000412845 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.71■■□□□ 1.55
NEFHP1-201ENST00000412845 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.71■■□□□ 1.55
NEFHP1-201ENST00000412845 TMF1P82094 1093 aa24.7■■□□□ 1.55
NEFHP1-201ENST00000412845 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC4A3P48751 1232 aa24.69■■□□□ 1.54
NEFHP1-201ENST00000412845 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.69■■□□□ 1.54
NEFHP1-201ENST00000412845 UNC13BO14795 1591 aa24.68■■□□□ 1.54
NEFHP1-201ENST00000412845 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.68■■□□□ 1.54
NEFHP1-201ENST00000412845 PREX2Q70Z35 1606 aa24.68■■□□□ 1.54
NEFHP1-201ENST00000412845 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.67■■□□□ 1.54
NEFHP1-201ENST00000412845 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.66■■□□□ 1.54
NEFHP1-201ENST00000412845 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
NEFHP1-201ENST00000412845 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.65■■□□□ 1.54
NEFHP1-201ENST00000412845 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
NEFHP1-201ENST00000412845 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.63■■□□□ 1.53
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP2R1AP30153 589 aa24.63■■□□□ 1.53
NEFHP1-201ENST00000412845 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.62■■□□□ 1.53
NEFHP1-201ENST00000412845 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
NEFHP1-201ENST00000412845 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.61■■□□□ 1.53
NEFHP1-201ENST00000412845 NFKBIBQ15653 356 aa24.6■■□□□ 1.53
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF521Q96K83 1311 aa24.59■■□□□ 1.53
NEFHP1-201ENST00000412845 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
NEFHP1-201ENST00000412845 C8orf34Q49A92 452 aa24.59■■□□□ 1.53
NEFHP1-201ENST00000412845 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.58■■□□□ 1.53
NEFHP1-201ENST00000412845 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
NEFHP1-201ENST00000412845 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.57■■□□□ 1.52
NEFHP1-201ENST00000412845 ERCC6Q03468 1493 aa24.57■■□□□ 1.52
NEFHP1-201ENST00000412845 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
NEFHP1-201ENST00000412845 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.56■■□□□ 1.52
NEFHP1-201ENST00000412845 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.56■■□□□ 1.52
NEFHP1-201ENST00000412845 GOLGA2Q08379 1002 aa24.56■■□□□ 1.52
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM161AQ3B820 660 aa24.56■■□□□ 1.52
NEFHP1-201ENST00000412845 GSE1Q14687 1217 aa24.54■■□□□ 1.52
NEFHP1-201ENST00000412845 RGS3P49796 1198 aa24.53■■□□□ 1.52
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