RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409010.1

COQ10B-202, Transcript of coenzyme Q10B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COQ10B, Length 1,355 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ10B-202ENST00000409010 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.51
COQ10B-202ENST00000409010 FOXK1P85037 733 aa11.84□□□□□ -0.51
COQ10B-202ENST00000409010 DSG2Q14126 1118 aa11.84□□□□□ -0.51
COQ10B-202ENST00000409010 TOPBP1Q92547 1522 aa11.84□□□□□ -0.51
COQ10B-202ENST00000409010 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.83□□□□□ -0.52
COQ10B-202ENST00000409010 KIF27Q86VH2 1401 aa11.83□□□□□ -0.52
COQ10B-202ENST00000409010 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.81□□□□□ -0.52
COQ10B-202ENST00000409010 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.81□□□□□ -0.52
COQ10B-202ENST00000409010 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
COQ10B-202ENST00000409010 CAMK2BQ13554 666 aa11.8□□□□□ -0.52
COQ10B-202ENST00000409010 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
COQ10B-202ENST00000409010 PLPP6Q8IY26 295 aa11.79□□□□□ -0.52
COQ10B-202ENST00000409010 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa11.79□□□□□ -0.52
COQ10B-202ENST00000409010 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
COQ10B-202ENST00000409010 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.77□□□□□ -0.52
COQ10B-202ENST00000409010 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.77□□□□□ -0.52
COQ10B-202ENST00000409010 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.77□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 NBR1Q14596 966 aa11.77□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 GOLGA3Q08378 1498 aa11.77□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 KIF21BO75037 1637 aa11.76□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.76□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 NUDT7P0C024 238 aa11.76□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 CUX2O14529 1486 aa11.75□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 PRXQ9BXM0 1461 aa11.73□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.73□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.72□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 IGF1RP08069 1367 aa11.72□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 ERCC6Q03468 1493 aa11.72□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 LHX6Q9UPM6 363 aa11.71□□□□□ -0.53
COQ10B-202ENST00000409010 WDR62O43379 1518 aa11.71□□□□□ -0.54
COQ10B-202ENST00000409010 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.7□□□□□ -0.54
COQ10B-202ENST00000409010 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.69□□□□□ -0.54
COQ10B-202ENST00000409010 UBTFP17480 764 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
COQ10B-202ENST00000409010 DPYSL4O14531 572 aa11.66□□□□□ -0.54
COQ10B-202ENST00000409010 IFT140Q96RY7 1462 aa11.65□□□□□ -0.54
COQ10B-202ENST00000409010 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.65□□□□□ -0.54
COQ10B-202ENST00000409010 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.65□□□□□ -0.54
COQ10B-202ENST00000409010 WDR97A6NE52 1622 aa11.65□□□□□ -0.54
COQ10B-202ENST00000409010 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
COQ10B-202ENST00000409010 OXER1Q8TDS5 423 aa11.65□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 PBX2P40425 430 aa11.64□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.64□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 CEP162Q5TB80 1403 aa11.63□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.63□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.62□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 SEMA3EO15041 775 aa11.62□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 CUL7Q14999 1698 aa11.61□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 MAP3K9P80192 1104 aa11.61□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 PTGER2P43116 358 aa11.6□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.6□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 PDIA6Q15084 440 aa11.59□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.59□□□□□ -0.55
COQ10B-202ENST00000409010 TBC1D12O60347 775 aa11.58□□□□□ -0.56
COQ10B-202ENST00000409010 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
COQ10B-202ENST00000409010 GRIN2BQ13224 1484 aa11.57□□□□□ -0.56
COQ10B-202ENST00000409010 CLIP1P30622 1438 aa11.57□□□□□ -0.56
COQ10B-202ENST00000409010 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.56□□□□□ -0.56
COQ10B-202ENST00000409010 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.53□□□□□ -0.56
COQ10B-202ENST00000409010 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.53□□□□□ -0.56
COQ10B-202ENST00000409010 ARHGAP33O14559 1287 aa11.53□□□□□ -0.56
COQ10B-202ENST00000409010 EVI5O60447 810 aa11.52□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.5□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.49□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 PBRM1Q86U86 1689 aa11.48□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.47□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 ADAMTS12P58397 1594 aa11.46□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.46□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.46□□□□□ -0.57
COQ10B-202ENST00000409010 TK2O00142 265 aa11.45□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 PSEN2P49810 448 aa11.45□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.45□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.44□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.43□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.43□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.43□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 DDX12PQ92771 950 aa11.42□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.42□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.42□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 HRO43593 1189 aa11.41□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 SYNJ2O15056 1496 aa11.41□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 ARAP1Q96P48 1450 aa11.41□□□□□ -0.58
COQ10B-202ENST00000409010 FOSBP53539 338 aa11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms