RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376709.8

VSX1-202, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 2,192 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-202ENST00000376709 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.09■■■□□ 2.09
VSX1-202ENST00000376709 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.09■■■□□ 2.09
VSX1-202ENST00000376709 ADGRL1O94910 1474 aa28.08■■■□□ 2.09
VSX1-202ENST00000376709 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.07■■■□□ 2.08
VSX1-202ENST00000376709 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.07■■■□□ 2.08
VSX1-202ENST00000376709 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.07■■■□□ 2.08
VSX1-202ENST00000376709 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.06■■■□□ 2.08
VSX1-202ENST00000376709 KDM5CP41229 1560 aa28.06■■■□□ 2.08
VSX1-202ENST00000376709 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.05■■■□□ 2.08
VSX1-202ENST00000376709 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.04■■■□□ 2.08
VSX1-202ENST00000376709 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
VSX1-202ENST00000376709 ATP7AQ04656 1500 aa28.02■■■□□ 2.08
VSX1-202ENST00000376709 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
VSX1-202ENST00000376709 CARD11Q9BXL7 1154 aa28■■■□□ 2.07
VSX1-202ENST00000376709 PLA2R1Q13018 1463 aa28■■■□□ 2.07
VSX1-202ENST00000376709 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.99■■■□□ 2.07
VSX1-202ENST00000376709 CD109Q6YHK3 1445 aa27.97■■■□□ 2.07
VSX1-202ENST00000376709 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.96■■■□□ 2.07
VSX1-202ENST00000376709 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
VSX1-202ENST00000376709 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.92■■■□□ 2.06
VSX1-202ENST00000376709 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
VSX1-202ENST00000376709 RGL3Q3MIN7 710 aa27.92■■■□□ 2.06
VSX1-202ENST00000376709 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
VSX1-202ENST00000376709 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.89■■■□□ 2.06
VSX1-202ENST00000376709 DEPDC5O75140 1603 aa27.89■■■□□ 2.06
VSX1-202ENST00000376709 ATP10AO60312 1499 aa27.88■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.88■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.88■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.86■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.86■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.86■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 A2MP01023 1474 aa27.85■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 E9PCH4 1651 aa27.84■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.84■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 KIF3BO15066 747 aa27.83■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 CCDC184Q52MB2 194 aa27.83■■■□□ 2.05
VSX1-202ENST00000376709 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.82■■■□□ 2.04
VSX1-202ENST00000376709 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.82■■■□□ 2.04
VSX1-202ENST00000376709 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.82■■■□□ 2.04
VSX1-202ENST00000376709 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
VSX1-202ENST00000376709 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.82■■■□□ 2.04
VSX1-202ENST00000376709 MRS2Q9HD23 443 aa27.82■■■□□ 2.04
VSX1-202ENST00000376709 KANK1Q14678 1352 aa27.79■■■□□ 2.04
VSX1-202ENST00000376709 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.78■■■□□ 2.04
VSX1-202ENST00000376709 TET3O43151 1660 aa27.77■■■□□ 2.04
VSX1-202ENST00000376709 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.77■■■□□ 2.04
VSX1-202ENST00000376709 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.04
VSX1-202ENST00000376709 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.74■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 NEO1Q92859 1461 aa27.74■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 TRPM2O94759 1503 aa27.74■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 NEFLP07196 543 aa27.73■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.73■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.73■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.72■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.72■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.72■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 FKBP8Q14318 412 aa27.72■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 LAMC1P11047 1609 aa27.72■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 PTPRTO14522 1441 aa27.71■■■□□ 2.03
VSX1-202ENST00000376709 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.69■■■□□ 2.02
VSX1-202ENST00000376709 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.68■■■□□ 2.02
VSX1-202ENST00000376709 CLTCL1P53675 1640 aa27.68■■■□□ 2.02
VSX1-202ENST00000376709 RAPGEF3O95398 923 aa27.67■■■□□ 2.02
VSX1-202ENST00000376709 CEP152O94986 1710 aa27.67■■■□□ 2.02
VSX1-202ENST00000376709 ABCA6Q8N139 1617 aa27.66■■■□□ 2.02
VSX1-202ENST00000376709 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
VSX1-202ENST00000376709 GLI2P10070 1586 aa27.63■■■□□ 2.01
VSX1-202ENST00000376709 BCANQ96GW7 911 aa27.63■■■□□ 2.01
VSX1-202ENST00000376709 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.63■■■□□ 2.01
VSX1-202ENST00000376709 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
VSX1-202ENST00000376709 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.59■■■□□ 2.01
VSX1-202ENST00000376709 MADDQ8WXG6 1647 aa27.58■■■□□ 2.01
VSX1-202ENST00000376709 RICTORQ6R327 1708 aa27.58■■■□□ 2.01
VSX1-202ENST00000376709 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.56■■■□□ 2
VSX1-202ENST00000376709 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.56■■■□□ 2
VSX1-202ENST00000376709 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
VSX1-202ENST00000376709 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.56■■■□□ 2
VSX1-202ENST00000376709 GGT6Q6P531 493 aa27.56■■■□□ 2
VSX1-202ENST00000376709 DIP2BQ9P265 1576 aa27.55■■■□□ 2
VSX1-202ENST00000376709 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.55■■■□□ 2
VSX1-202ENST00000376709 TESK2Q96S53 571 aa27.54■■■□□ 2
VSX1-202ENST00000376709 STAC3Q96MF2 364 aa27.53■■■□□ 2
VSX1-202ENST00000376709 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
VSX1-202ENST00000376709 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.52■■■□□ 2
VSX1-202ENST00000376709 RALBP1Q15311 655 aa27.5■■□□□ 1.99
VSX1-202ENST00000376709 TMC1Q8TDI8 760 aa27.5■■□□□ 1.99
VSX1-202ENST00000376709 TMF1P82094 1093 aa27.49■■□□□ 1.99
VSX1-202ENST00000376709 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.48■■□□□ 1.99
VSX1-202ENST00000376709 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
VSX1-202ENST00000376709 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.47■■□□□ 1.99
VSX1-202ENST00000376709 IQGAP1P46940 1657 aa27.46■■□□□ 1.99
VSX1-202ENST00000376709 NPATQ14207 1427 aa27.46■■□□□ 1.99
VSX1-202ENST00000376709 ABCC3O15438 1527 aa27.46■■□□□ 1.99
VSX1-202ENST00000376709 KIF1BO60333 1816 aa27.46■■□□□ 1.99
VSX1-202ENST00000376709 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.45■■□□□ 1.98
VSX1-202ENST00000376709 TSPOAP1O95153 1857 aa27.45■■□□□ 1.98
VSX1-202ENST00000376709 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms