RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 HMMRO75330 724 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 IL27Q8NEV9 243 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 NUP155O75694 1391 aa23.05■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.04■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.04■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 SOX12O15370 315 aa23.03■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.01■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 COG6Q9Y2V7 657 aa23■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 KANK1Q14678 1352 aa23■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF16BQ96L93 1317 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 MRE11P49959 708 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 E9PSI1 815 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 STK31Q9BXU1 1019 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF592Q92610 1267 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 MAP7D2Q96T17 732 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 GPATCH3Q96I76 525 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 PANK3Q9H999 370 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 SMARCA4P51532 1647 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 STK26Q9P289 416 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 TPM3P06753 285 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 GGT6Q6P531 493 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 BECN2A8MW95 431 aa22.9■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 GPS2Q13227 327 aa22.88■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF3AQ9Y496 699 aa22.87■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 TPM2P07951 284 aa22.86■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 TEX35Q5T0J7 233 aa22.84■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.84■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 APAF1O14727 1248 aa22.83■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 NUCB2P80303 420 aa22.83■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.83■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 RILPL2Q969X0 211 aa22.83■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.82■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 TRAK2O60296 914 aa22.82■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.82■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.82■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 REC8O95072 547 aa22.81■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 H3BQV1 296 aa22.81■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 IFFO2Q5TF58 517 aa22.81■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.8■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 MCTP1Q6DN14 999 aa22.8■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.8■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 USP47Q96K76 1375 aa22.8■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.79■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 CLSTN1O94985 981 aa22.78■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 MLECQ14165 292 aa22.78■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 NPHP1O15259 732 aa22.78■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 GORABQ5T7V8 394 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 HOMER1Q86YM7 354 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF3BO15066 747 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 IFT57Q9NWB7 429 aa22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 NGEFQ8N5V2 710 aa22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC7Q96M83 1385 aa22.72■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 JPH4Q96JJ6 628 aa22.71■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 RNF214Q8ND24 703 aa22.7■■□□□ 1.23
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