RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 HMMRO75330 724 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 IL27Q8NEV9 243 aa23.06■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 NUP155O75694 1391 aa23.05■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.04■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.04■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 SOX12O15370 315 aa23.03■■□□□ 1.28
AMIGO1-202ENST00000369864 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.01■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 COG6Q9Y2V7 657 aa23■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 KANK1Q14678 1352 aa23■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF16BQ96L93 1317 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.98■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 MRE11P49959 708 aa22.97■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 E9PSI1 815 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.96■■□□□ 1.27
AMIGO1-202ENST00000369864 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 STK31Q9BXU1 1019 aa22.95■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF592Q92610 1267 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 MAP7D2Q96T17 732 aa22.93■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.92■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 GPATCH3Q96I76 525 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 PANK3Q9H999 370 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 SMARCA4P51532 1647 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 STK26Q9P289 416 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 TPM3P06753 285 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 GGT6Q6P531 493 aa22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 BECN2A8MW95 431 aa22.9■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
AMIGO1-202ENST00000369864 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 GPS2Q13227 327 aa22.88■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF3AQ9Y496 699 aa22.87■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 TPM2P07951 284 aa22.86■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 TEX35Q5T0J7 233 aa22.84■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.84■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 APAF1O14727 1248 aa22.83■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 NUCB2P80303 420 aa22.83■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.83■■□□□ 1.25
AMIGO1-202ENST00000369864 RILPL2Q969X0 211 aa22.83■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.82■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 TRAK2O60296 914 aa22.82■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.82■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.82■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 REC8O95072 547 aa22.81■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 H3BQV1 296 aa22.81■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 IFFO2Q5TF58 517 aa22.81■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.8■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 MCTP1Q6DN14 999 aa22.8■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.8■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 USP47Q96K76 1375 aa22.8■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.79■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 CLSTN1O94985 981 aa22.78■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 MLECQ14165 292 aa22.78■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 NPHP1O15259 732 aa22.78■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.77■■□□□ 1.24
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 GORABQ5T7V8 394 aa22.75■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 HOMER1Q86YM7 354 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF3BO15066 747 aa22.74■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 IFT57Q9NWB7 429 aa22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 NGEFQ8N5V2 710 aa22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.73■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC7Q96M83 1385 aa22.72■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 JPH4Q96JJ6 628 aa22.71■■□□□ 1.23
AMIGO1-202ENST00000369864 RNF214Q8ND24 703 aa22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms