RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360507.9

CNPPD1-201, Transcript of cyclin Pas1/PHO80 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNPPD1, Length 2,060 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1-201ENST00000360507 LAMC1P11047 1609 aa22.51■■□□□ 1.19
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CNPPD1-201ENST00000360507 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1-201ENST00000360507 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1-201ENST00000360507 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CNPPD1-201ENST00000360507 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.5■■□□□ 1.19
CNPPD1-201ENST00000360507 NUP160Q12769 1436 aa22.49■■□□□ 1.19
CNPPD1-201ENST00000360507 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.48■■□□□ 1.19
CNPPD1-201ENST00000360507 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.48■■□□□ 1.19
CNPPD1-201ENST00000360507 NLRP13Q86W25 1043 aa22.48■■□□□ 1.19
CNPPD1-201ENST00000360507 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.47■■□□□ 1.19
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CNPPD1-201ENST00000360507 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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CNPPD1-201ENST00000360507 MS4A1P11836 297 aa22.46■■□□□ 1.19
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CNPPD1-201ENST00000360507 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.44■■□□□ 1.18
CNPPD1-201ENST00000360507 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1-201ENST00000360507 ATP10BO94823 1461 aa22.42■■□□□ 1.18
CNPPD1-201ENST00000360507 TSPY4P0CV99 314 aa22.42■■□□□ 1.18
CNPPD1-201ENST00000360507 TSPY10P0CW01 314 aa22.42■■□□□ 1.18
CNPPD1-201ENST00000360507 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.41■■□□□ 1.18
CNPPD1-201ENST00000360507 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.41■■□□□ 1.18
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CNPPD1-201ENST00000360507 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.39■■□□□ 1.17
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CNPPD1-201ENST00000360507 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.38■■□□□ 1.17
CNPPD1-201ENST00000360507 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.38■■□□□ 1.17
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CNPPD1-201ENST00000360507 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.33■■□□□ 1.17
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CNPPD1-201ENST00000360507 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.33■■□□□ 1.17
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CNPPD1-201ENST00000360507 USP35Q9P2H5 1018 aa22.32■■□□□ 1.16
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CNPPD1-201ENST00000360507 PLA2R1Q13018 1463 aa22.28■■□□□ 1.16
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CNPPD1-201ENST00000360507 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.18■■□□□ 1.14
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CNPPD1-201ENST00000360507 PANK3Q9H999 370 aa22.15■■□□□ 1.14
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CNPPD1-201ENST00000360507 CDCA8Q53HL2 280 aa22.04■■□□□ 1.12
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CNPPD1-201ENST00000360507 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.03■■□□□ 1.12
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CNPPD1-201ENST00000360507 PPP2R1AP30153 589 aa22.02■■□□□ 1.12
CNPPD1-201ENST00000360507 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.02■■□□□ 1.12
CNPPD1-201ENST00000360507 ABCC2Q92887 1545 aa22.01■■□□□ 1.11
CNPPD1-201ENST00000360507 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.01■■□□□ 1.11
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