RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 NEO1Q92859 1461 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 NUP155O75694 1391 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXA3-201ENST00000317201 ATP7AQ04656 1500 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXA3-201ENST00000317201 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXA3-201ENST00000317201 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXA3-201ENST00000317201 KDM5CP41229 1560 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXA3-201ENST00000317201 AFAP1Q8N556 730 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXA3-201ENST00000317201 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 PKD2Q13563 968 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHG5O94827 1062 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 DEPDC5O75140 1603 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 FOXD1Q16676 465 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 DIP2BQ9P265 1576 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HOXA3-201ENST00000317201 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXA3-201ENST00000317201 ATP10AO60312 1499 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXA3-201ENST00000317201 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXA3-201ENST00000317201 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXA3-201ENST00000317201 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXA3-201ENST00000317201 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXA3-201ENST00000317201 RICTORQ6R327 1708 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 FKBP8Q14318 412 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 A2MP01023 1474 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 TET3O43151 1660 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 KANK1Q14678 1352 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 PLA2R1Q13018 1463 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 ABCA6Q8N139 1617 aa20.45■□□□□ 0.87
HOXA3-201ENST00000317201 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 IL27Q8NEV9 243 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 E9PCH4 1651 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 PTPRTO14522 1441 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 KIF3BO15066 747 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 TRPM2O94759 1503 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXA3-201ENST00000317201 NBR1Q14596 966 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 RAPGEF3O95398 923 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 REREQ9P2R6 1566 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 TSPOAP1O95153 1857 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXA3-201ENST00000317201 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 CEP152O94986 1710 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 STAC3Q96MF2 364 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 ABCC3O15438 1527 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 CLTCL1P53675 1640 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA3-201ENST00000317201 AGLP35573 1532 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 LAMC1P11047 1609 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 NPATQ14207 1427 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA3-201ENST00000317201 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 GGT6Q6P531 493 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 KIF1BO60333 1816 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 USP47Q96K76 1375 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA3-201ENST00000317201 NOS1P29475 1434 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms