RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 KDM5CP41229 1560 aa26.04■■□□□ 1.76
HCLS1-201ENST00000314583 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
HCLS1-201ENST00000314583 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.03■■□□□ 1.76
HCLS1-201ENST00000314583 NEO1Q92859 1461 aa26.02■■□□□ 1.76
HCLS1-201ENST00000314583 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HCLS1-201ENST00000314583 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.01■■□□□ 1.75
HCLS1-201ENST00000314583 NBPF8Q3BBV2 869 aa26■■□□□ 1.75
HCLS1-201ENST00000314583 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
HCLS1-201ENST00000314583 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.98■■□□□ 1.75
HCLS1-201ENST00000314583 PLA2R1Q13018 1463 aa25.96■■□□□ 1.75
HCLS1-201ENST00000314583 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.75
HCLS1-201ENST00000314583 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.95■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 ATP10AO60312 1499 aa25.94■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.94■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 DIP2BQ9P265 1576 aa25.93■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.93■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 ANP32CO43423 234 aa25.93■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.93■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.92■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.9■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 CCER2I3L3R5 266 aa25.9■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 E9PCH4 1651 aa25.9■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.89■■□□□ 1.74
HCLS1-201ENST00000314583 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.89■■□□□ 1.73
HCLS1-201ENST00000314583 TET3O43151 1660 aa25.89■■□□□ 1.73
HCLS1-201ENST00000314583 RICTORQ6R327 1708 aa25.87■■□□□ 1.73
HCLS1-201ENST00000314583 A2MP01023 1474 aa25.86■■□□□ 1.73
HCLS1-201ENST00000314583 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.86■■□□□ 1.73
HCLS1-201ENST00000314583 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
HCLS1-201ENST00000314583 ABCA6Q8N139 1617 aa25.85■■□□□ 1.73
HCLS1-201ENST00000314583 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.85■■□□□ 1.73
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC7Q96M83 1385 aa25.84■■□□□ 1.73
HCLS1-201ENST00000314583 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.83■■□□□ 1.73
HCLS1-201ENST00000314583 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.83■■□□□ 1.73
HCLS1-201ENST00000314583 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.83■■□□□ 1.73
HCLS1-201ENST00000314583 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
HCLS1-201ENST00000314583 KANK1Q14678 1352 aa25.81■■□□□ 1.72
HCLS1-201ENST00000314583 KIF3BO15066 747 aa25.8■■□□□ 1.72
HCLS1-201ENST00000314583 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.8■■□□□ 1.72
HCLS1-201ENST00000314583 TRPM2O94759 1503 aa25.79■■□□□ 1.72
HCLS1-201ENST00000314583 USP47Q96K76 1375 aa25.79■■□□□ 1.72
HCLS1-201ENST00000314583 PTPRTO14522 1441 aa25.78■■□□□ 1.72
HCLS1-201ENST00000314583 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.78■■□□□ 1.72
HCLS1-201ENST00000314583 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.78■■□□□ 1.72
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.72
HCLS1-201ENST00000314583 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.75■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.75■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.74■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 RAPGEF3O95398 923 aa25.74■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.73■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.73■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 CEP152O94986 1710 aa25.72■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.72■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 LAMC1P11047 1609 aa25.71■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.71■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 CLTCL1P53675 1640 aa25.7■■□□□ 1.71
HCLS1-201ENST00000314583 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.69■■□□□ 1.7
HCLS1-201ENST00000314583 TSPOAP1O95153 1857 aa25.68■■□□□ 1.7
HCLS1-201ENST00000314583 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.68■■□□□ 1.7
HCLS1-201ENST00000314583 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.67■■□□□ 1.7
HCLS1-201ENST00000314583 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.66■■□□□ 1.7
HCLS1-201ENST00000314583 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
HCLS1-201ENST00000314583 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.63■■□□□ 1.69
HCLS1-201ENST00000314583 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.62■■□□□ 1.69
HCLS1-201ENST00000314583 ABCC3O15438 1527 aa25.62■■□□□ 1.69
HCLS1-201ENST00000314583 RGL3Q3MIN7 710 aa25.61■■□□□ 1.69
HCLS1-201ENST00000314583 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.57■■□□□ 1.68
HCLS1-201ENST00000314583 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HCLS1-201ENST00000314583 STAC3Q96MF2 364 aa25.56■■□□□ 1.68
HCLS1-201ENST00000314583 REREQ9P2R6 1566 aa25.56■■□□□ 1.68
HCLS1-201ENST00000314583 MADDQ8WXG6 1647 aa25.55■■□□□ 1.68
HCLS1-201ENST00000314583 NPATQ14207 1427 aa25.54■■□□□ 1.68
HCLS1-201ENST00000314583 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.54■■□□□ 1.68
HCLS1-201ENST00000314583 GGT6Q6P531 493 aa25.53■■□□□ 1.68
HCLS1-201ENST00000314583 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
HCLS1-201ENST00000314583 KIF1BO60333 1816 aa25.52■■□□□ 1.68
HCLS1-201ENST00000314583 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.49■■□□□ 1.67
HCLS1-201ENST00000314583 MROH2AA6NES4 1674 aa25.49■■□□□ 1.67
HCLS1-201ENST00000314583 IFT172Q9UG01 1749 aa25.48■■□□□ 1.67
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.47■■□□□ 1.67
HCLS1-201ENST00000314583 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.47■■□□□ 1.67
HCLS1-201ENST00000314583 ADGRB3O60242 1522 aa25.47■■□□□ 1.67
HCLS1-201ENST00000314583 AGLP35573 1532 aa25.47■■□□□ 1.67
HCLS1-201ENST00000314583 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.46■■□□□ 1.67
HCLS1-201ENST00000314583 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.46■■□□□ 1.67
HCLS1-201ENST00000314583 NOS1P29475 1434 aa25.45■■□□□ 1.67
HCLS1-201ENST00000314583 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.45■■□□□ 1.66
HCLS1-201ENST00000314583 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
HCLS1-201ENST00000314583 MYOM2P54296 1465 aa25.44■■□□□ 1.66
HCLS1-201ENST00000314583 IQGAP1P46940 1657 aa25.43■■□□□ 1.66
HCLS1-201ENST00000314583 PIK3C2BO00750 1634 aa25.43■■□□□ 1.66
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.43■■□□□ 1.66
HCLS1-201ENST00000314583 SYNMO15061 1565 aa25.41■■□□□ 1.66
HCLS1-201ENST00000314583 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.41■■□□□ 1.66
HCLS1-201ENST00000314583 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
HCLS1-201ENST00000314583 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms