RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276431.8

TNFRSF10B-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 10b, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF10B, Length 4,146 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10B-201ENST00000276431 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF10B-201ENST00000276431 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF10B-201ENST00000276431 IFT140Q96RY7 1462 aa14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF10B-201ENST00000276431 MIA2Q96PC5 1412 aa14.93□□□□□ -0.02
TNFRSF10B-201ENST00000276431 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.92□□□□□ -0.02
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TNFRSF10B-201ENST00000276431 POGKQ9P215 609 aa14.91□□□□□ -0.02
TNFRSF10B-201ENST00000276431 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.91□□□□□ -0.02
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.9□□□□□ -0.02
TNFRSF10B-201ENST00000276431 DAPK1P53355 1430 aa14.88□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.036e-8■■■□□ 15.2
TNFRSF10B-201ENST00000276431 GOLGA2Q08379 1002 aa14.88□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 BECN1Q14457 450 aa14.88□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.87□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.87□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ABCC5O15440 1437 aa14.87□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 BCAR3O75815 825 aa14.86□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.86□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.85□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 COG6Q9Y2V7 657 aa14.85□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.85□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 APAF1O14727 1248 aa14.84□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TMF1P82094 1093 aa14.84□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.84□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 C8orf34Q49A92 452 aa14.84□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.84□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.83□□□□□ -0.03
TNFRSF10B-201ENST00000276431 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.83□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 SAMD9Q5K651 1589 aa14.83□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.83□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PANK1Q8TE04 598 aa14.82□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.82□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 SEC24BO95487 1268 aa14.79□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.79□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ROCK1Q13464 1354 aa14.79□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 GRIN2AQ12879 1464 aa14.78□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.78□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.78□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.77□□□□□ -0.04
TNFRSF10B-201ENST00000276431 IGHDP01880 384 aa14.77□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ADAMTS12P58397 1594 aa14.77□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PTPRGP23470 1445 aa14.76□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PPP2R1AP30153 589 aa14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.74□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PZPP20742 1482 aa14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.73□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 WDR62O43379 1518 aa14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PANK2Q9BZ23 570 aa14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.72□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PBRM1Q86U86 1689 aa14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 SYNJ2O15056 1496 aa14.71□□□□□ -0.05
TNFRSF10B-201ENST00000276431 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 SLFN5Q08AF3 891 aa14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 ARID3AQ99856 593 aa14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 KIAA0556O60303 1618 aa14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.67□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TNNQ9UQP3 1299 aa14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.66□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 DISP1Q96F81 1524 aa14.65□□□□□ -0.06
TNFRSF10B-201ENST00000276431 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF10B-201ENST00000276431 E9PSI1 815 aa14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF10B-201ENST00000276431 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 27.5
TNFRSF10B-201ENST00000276431 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.64□□□□□ -0.07
TNFRSF10B-201ENST00000276431 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms