RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.2■■■□□ 2.75
COX5B-201ENST00000258424 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.18■■■□□ 2.74
COX5B-201ENST00000258424 KIF3BO15066 747 aa32.18■■■□□ 2.74
COX5B-201ENST00000258424 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
COX5B-201ENST00000258424 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
COX5B-201ENST00000258424 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.17■■■□□ 2.74
COX5B-201ENST00000258424 GGT6Q6P531 493 aa32.16■■■□□ 2.74
COX5B-201ENST00000258424 ITGAEP38570 1179 aa32.15■■■□□ 2.74
COX5B-201ENST00000258424 ERBINQ96RT1 1412 aa32.14■■■□□ 2.74
COX5B-201ENST00000258424 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.14■■■□□ 2.74
COX5B-201ENST00000258424 MROH2AA6NES4 1674 aa32.13■■■□□ 2.73
COX5B-201ENST00000258424 C3P01024 1663 aa32.13■■■□□ 2.73
COX5B-201ENST00000258424 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.13■■■□□ 2.73
COX5B-201ENST00000258424 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.12■■■□□ 2.73
COX5B-201ENST00000258424 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
COX5B-201ENST00000258424 ROCK1Q13464 1354 aa32.08■■■□□ 2.73
COX5B-201ENST00000258424 ZMYM3Q14202 1370 aa32.07■■■□□ 2.73
COX5B-201ENST00000258424 DEPDC5O75140 1603 aa32.06■■■□□ 2.72
COX5B-201ENST00000258424 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.05■■■□□ 2.72
COX5B-201ENST00000258424 CERKQ8TCT0 537 aa32.05■■■□□ 2.72
COX5B-201ENST00000258424 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.05■■■□□ 2.72
COX5B-201ENST00000258424 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.03■■■□□ 2.72
COX5B-201ENST00000258424 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.01■■■□□ 2.72
COX5B-201ENST00000258424 CEP152O94986 1710 aa32.01■■■□□ 2.72
COX5B-201ENST00000258424 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
COX5B-201ENST00000258424 ABCC3O15438 1527 aa31.99■■■□□ 2.71
COX5B-201ENST00000258424 NPATQ14207 1427 aa31.98■■■□□ 2.71
COX5B-201ENST00000258424 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.94■■■□□ 2.7
COX5B-201ENST00000258424 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.94■■■□□ 2.7
COX5B-201ENST00000258424 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.92■■■□□ 2.7
COX5B-201ENST00000258424 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.92■■■□□ 2.7
COX5B-201ENST00000258424 STRCQ7RTU9 1775 aa31.91■■■□□ 2.7
COX5B-201ENST00000258424 UNC13BO14795 1591 aa31.9■■■□□ 2.7
COX5B-201ENST00000258424 PTPRTO14522 1441 aa31.9■■■□□ 2.7
COX5B-201ENST00000258424 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.88■■■□□ 2.691e-10■□□□□ 9.5
COX5B-201ENST00000258424 PZPP20742 1482 aa31.87■■■□□ 2.69
COX5B-201ENST00000258424 NAIPQ13075 1403 aa31.87■■■□□ 2.69
COX5B-201ENST00000258424 HFM1A2PYH4 1435 aa31.83■■■□□ 2.69
COX5B-201ENST00000258424 KANK1Q14678 1352 aa31.83■■■□□ 2.69
COX5B-201ENST00000258424 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.83■■■□□ 2.69
COX5B-201ENST00000258424 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.79■■■□□ 2.68
COX5B-201ENST00000258424 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
COX5B-201ENST00000258424 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
COX5B-201ENST00000258424 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.77■■■□□ 2.68
COX5B-201ENST00000258424 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.76■■■□□ 2.67
COX5B-201ENST00000258424 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.75■■■□□ 2.67
COX5B-201ENST00000258424 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.75■■■□□ 2.67
COX5B-201ENST00000258424 TET3O43151 1660 aa31.74■■■□□ 2.67
COX5B-201ENST00000258424 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.74■■■□□ 2.67
COX5B-201ENST00000258424 PKD2Q13563 968 aa31.73■■■□□ 2.67
COX5B-201ENST00000258424 ERVK-7P63135 1459 aa31.72■■■□□ 2.67
COX5B-201ENST00000258424 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
COX5B-201ENST00000258424 TNRQ92752 1358 aa31.7■■■□□ 2.67
COX5B-201ENST00000258424 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
COX5B-201ENST00000258424 NUP155O75694 1391 aa31.68■■■□□ 2.66
COX5B-201ENST00000258424 PLA2R1Q13018 1463 aa31.67■■■□□ 2.66
COX5B-201ENST00000258424 E9PCH4 1651 aa31.65■■■□□ 2.66
COX5B-201ENST00000258424 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.64■■■□□ 2.66
COX5B-201ENST00000258424 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.6■■■□□ 2.65
COX5B-201ENST00000258424 SYNMO15061 1565 aa31.6■■■□□ 2.65
COX5B-201ENST00000258424 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
COX5B-201ENST00000258424 NLRP1Q9C000 1473 aa31.58■■■□□ 2.65
COX5B-201ENST00000258424 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
COX5B-201ENST00000258424 NOS1P29475 1434 aa31.57■■■□□ 2.64
COX5B-201ENST00000258424 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.56■■■□□ 2.64
COX5B-201ENST00000258424 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
COX5B-201ENST00000258424 TRIM52Q96A61 297 aa31.51■■■□□ 2.63
COX5B-201ENST00000258424 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.51■■■□□ 2.63
COX5B-201ENST00000258424 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.5■■■□□ 2.63
COX5B-201ENST00000258424 PIK3C2BO00750 1634 aa31.49■■■□□ 2.63
COX5B-201ENST00000258424 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.49■■■□□ 2.63
COX5B-201ENST00000258424 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.49■■■□□ 2.63
COX5B-201ENST00000258424 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.48■■■□□ 2.63
COX5B-201ENST00000258424 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.46■■■□□ 2.63
COX5B-201ENST00000258424 IDI1Q13907 227 aa31.4■■■□□ 2.62
COX5B-201ENST00000258424 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
COX5B-201ENST00000258424 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.39■■■□□ 2.62
COX5B-201ENST00000258424 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
COX5B-201ENST00000258424 ADGRB3O60242 1522 aa31.38■■■□□ 2.61
COX5B-201ENST00000258424 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
COX5B-201ENST00000258424 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.38■■■□□ 2.61
COX5B-201ENST00000258424 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.34■■■□□ 2.61
COX5B-201ENST00000258424 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.33■■■□□ 2.61
COX5B-201ENST00000258424 TRPM2O94759 1503 aa31.33■■■□□ 2.61
COX5B-201ENST00000258424 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.31■■■□□ 2.6
COX5B-201ENST00000258424 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
COX5B-201ENST00000258424 CLTCL1P53675 1640 aa31.31■■■□□ 2.6
COX5B-201ENST00000258424 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.3■■■□□ 2.6
COX5B-201ENST00000258424 SLIT1O75093 1534 aa31.29■■■□□ 2.6
COX5B-201ENST00000258424 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
COX5B-201ENST00000258424 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.29■■■□□ 2.6
COX5B-201ENST00000258424 MED14O60244 1454 aa31.28■■■□□ 2.6
COX5B-201ENST00000258424 FOXD1Q16676 465 aa31.28■■■□□ 2.6
COX5B-201ENST00000258424 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.26■■■□□ 2.59
COX5B-201ENST00000258424 HRCP23327 699 aa31.25■■■□□ 2.59
COX5B-201ENST00000258424 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
COX5B-201ENST00000258424 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.24■■■□□ 2.59
COX5B-201ENST00000258424 CPS1P31327 1500 aa31.24■■■□□ 2.59
COX5B-201ENST00000258424 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.23■■■□□ 2.59
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