RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258111.4

KCNMB4-201, Transcript of potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNMB4, Length 4,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4-201ENST00000258111 IFT140Q96RY7 1462 aa25.69■■□□□ 1.7
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KCNMB4-201ENST00000258111 SLC4A3P48751 1232 aa25.68■■□□□ 1.7
KCNMB4-201ENST00000258111 SOX12O15370 315 aa25.65■■□□□ 1.7
KCNMB4-201ENST00000258111 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
KCNMB4-201ENST00000258111 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
KCNMB4-201ENST00000258111 NCOA2Q15596 1464 aa25.62■■□□□ 1.69
KCNMB4-201ENST00000258111 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.62■■□□□ 1.69
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KCNMB4-201ENST00000258111 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.6■■□□□ 1.69
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KCNMB4-201ENST00000258111 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.59■■□□□ 1.69
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KCNMB4-201ENST00000258111 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.57■■□□□ 1.68
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KCNMB4-201ENST00000258111 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.56■■□□□ 1.68
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KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC7Q96M83 1385 aa25.56■■□□□ 1.68
KCNMB4-201ENST00000258111 UACAQ9BZF9 1416 aa25.56■■□□□ 1.68
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KCNMB4-201ENST00000258111 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.55■■□□□ 1.68
KCNMB4-201ENST00000258111 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
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KCNMB4-201ENST00000258111 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
KCNMB4-201ENST00000258111 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
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KCNMB4-201ENST00000258111 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
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KCNMB4-201ENST00000258111 USP47Q96K76 1375 aa25.5■■□□□ 1.67
KCNMB4-201ENST00000258111 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.49■■□□□ 1.67
KCNMB4-201ENST00000258111 NRDCO43847 1150 aa25.49■■□□□ 1.67
KCNMB4-201ENST00000258111 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
KCNMB4-201ENST00000258111 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.48■■□□□ 1.67
KCNMB4-201ENST00000258111 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.48■■□□□ 1.67
KCNMB4-201ENST00000258111 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
KCNMB4-201ENST00000258111 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.46■■□□□ 1.67
KCNMB4-201ENST00000258111 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.46■■□□□ 1.67
KCNMB4-201ENST00000258111 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.46■■□□□ 1.67
KCNMB4-201ENST00000258111 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.46■■□□□ 1.67
KCNMB4-201ENST00000258111 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.45■■□□□ 1.67
KCNMB4-201ENST00000258111 MSH5O43196 834 aa25.45■■□□□ 1.66
KCNMB4-201ENST00000258111 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
KCNMB4-201ENST00000258111 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.45■■□□□ 1.66
KCNMB4-201ENST00000258111 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.45■■□□□ 1.66
KCNMB4-201ENST00000258111 IL27Q8NEV9 243 aa25.45■■□□□ 1.66
KCNMB4-201ENST00000258111 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.44■■□□□ 1.66
KCNMB4-201ENST00000258111 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
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KCNMB4-201ENST00000258111 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.41■■□□□ 1.66
KCNMB4-201ENST00000258111 ARID3AQ99856 593 aa25.41■■□□□ 1.66
KCNMB4-201ENST00000258111 PANK3Q9H999 370 aa25.4■■□□□ 1.66
KCNMB4-201ENST00000258111 AFAP1Q8N556 730 aa25.39■■□□□ 1.65
KCNMB4-201ENST00000258111 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.39■■□□□ 1.65
KCNMB4-201ENST00000258111 E9PSI1 815 aa25.39■■□□□ 1.65
KCNMB4-201ENST00000258111 STAC3Q96MF2 364 aa25.38■■□□□ 1.65
KCNMB4-201ENST00000258111 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.37■■□□□ 1.65
KCNMB4-201ENST00000258111 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
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KCNMB4-201ENST00000258111 DRC7Q8IY82 874 aa25.36■■□□□ 1.65
KCNMB4-201ENST00000258111 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
KCNMB4-201ENST00000258111 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.36■■□□□ 1.65
KCNMB4-201ENST00000258111 MIA2Q96PC5 1412 aa25.35■■□□□ 1.65
KCNMB4-201ENST00000258111 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.35■■□□□ 1.65
KCNMB4-201ENST00000258111 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.35■■□□□ 1.65
KCNMB4-201ENST00000258111 KCNJ4P48050 445 aa25.33■■□□□ 1.65
KCNMB4-201ENST00000258111 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 EVC2Q86UK5 1308 aa25.32■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 NGEFQ8N5V2 710 aa25.32■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 BACH2Q9BYV9 841 aa25.32■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 TIAM1Q13009 1591 aa25.3■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.3■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.3■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 COG6Q9Y2V7 657 aa25.29■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 NUTM2FA1L443 756 aa25.29■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
KCNMB4-201ENST00000258111 HECW1Q76N89 1606 aa25.26■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 FGD1P98174 961 aa25.26■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 PHF14O94880 888 aa25.25■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 ST18O60284 1047 aa25.25■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 MRE11P49959 708 aa25.25■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 AKNAQ7Z591 1439 aa25.25■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 APBB1O00213 710 aa25.24■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.23■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
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