RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235150.4

RNF19B-201, Transcript of ring finger protein 19B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF19B, Length 2,334 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19B-201ENST00000235150 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
RNF19B-201ENST00000235150 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.79■■■■□ 3.16
RNF19B-201ENST00000235150 ATP10AO60312 1499 aa34.77■■■■□ 3.16
RNF19B-201ENST00000235150 AFAP1Q8N556 730 aa34.77■■■■□ 3.16
RNF19B-201ENST00000235150 USP47Q96K76 1375 aa34.77■■■■□ 3.16
RNF19B-201ENST00000235150 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
RNF19B-201ENST00000235150 ATP7AQ04656 1500 aa34.75■■■■□ 3.15
RNF19B-201ENST00000235150 ADGRL1O94910 1474 aa34.74■■■■□ 3.15
RNF19B-201ENST00000235150 DEPDC5O75140 1603 aa34.73■■■■□ 3.15
RNF19B-201ENST00000235150 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.72■■■■□ 3.15
RNF19B-201ENST00000235150 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.7■■■■□ 3.15
RNF19B-201ENST00000235150 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.68■■■■□ 3.14
RNF19B-201ENST00000235150 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.68■■■■□ 3.14
RNF19B-201ENST00000235150 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.68■■■■□ 3.14
RNF19B-201ENST00000235150 E9PCH4 1651 aa34.63■■■■□ 3.13
RNF19B-201ENST00000235150 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.63■■■■□ 3.13
RNF19B-201ENST00000235150 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
RNF19B-201ENST00000235150 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.63■■■■□ 3.13
RNF19B-201ENST00000235150 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.62■■■■□ 3.13
RNF19B-201ENST00000235150 A2MP01023 1474 aa34.61■■■■□ 3.13
RNF19B-201ENST00000235150 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.6■■■■□ 3.13
RNF19B-201ENST00000235150 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
RNF19B-201ENST00000235150 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.6■■■■□ 3.13
RNF19B-201ENST00000235150 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.58■■■■□ 3.13
RNF19B-201ENST00000235150 TET3O43151 1660 aa34.57■■■■□ 3.12
RNF19B-201ENST00000235150 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.56■■■■□ 3.12
RNF19B-201ENST00000235150 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.54■■■■□ 3.12
RNF19B-201ENST00000235150 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.53■■■■□ 3.12
RNF19B-201ENST00000235150 TRPM2O94759 1503 aa34.53■■■■□ 3.12
RNF19B-201ENST00000235150 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
RNF19B-201ENST00000235150 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
RNF19B-201ENST00000235150 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
RNF19B-201ENST00000235150 CD109Q6YHK3 1445 aa34.52■■■■□ 3.12
RNF19B-201ENST00000235150 LAMC1P11047 1609 aa34.52■■■■□ 3.12
RNF19B-201ENST00000235150 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
RNF19B-201ENST00000235150 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.5■■■■□ 3.11
RNF19B-201ENST00000235150 RGL3Q3MIN7 710 aa34.49■■■■□ 3.11
RNF19B-201ENST00000235150 PTPRTO14522 1441 aa34.48■■■■□ 3.11
RNF19B-201ENST00000235150 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.48■■■■□ 3.11
RNF19B-201ENST00000235150 KANK1Q14678 1352 aa34.47■■■■□ 3.11
RNF19B-201ENST00000235150 CEP152O94986 1710 aa34.47■■■■□ 3.11
RNF19B-201ENST00000235150 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.43■■■■□ 3.1
RNF19B-201ENST00000235150 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.42■■■■□ 3.1
RNF19B-201ENST00000235150 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.42■■■■□ 3.1
RNF19B-201ENST00000235150 KIF3BO15066 747 aa34.41■■■■□ 3.1
RNF19B-201ENST00000235150 CLTCL1P53675 1640 aa34.4■■■■□ 3.1
RNF19B-201ENST00000235150 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.37■■■■□ 3.09
RNF19B-201ENST00000235150 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
RNF19B-201ENST00000235150 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.36■■■■□ 3.09
RNF19B-201ENST00000235150 NEO1Q92859 1461 aa34.34■■■■□ 3.09
RNF19B-201ENST00000235150 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.33■■■■□ 3.09
RNF19B-201ENST00000235150 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.33■■■■□ 3.09
RNF19B-201ENST00000235150 MADDQ8WXG6 1647 aa34.33■■■■□ 3.09
RNF19B-201ENST00000235150 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.33■■■■□ 3.09
RNF19B-201ENST00000235150 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.32■■■■□ 3.08
RNF19B-201ENST00000235150 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.3■■■■□ 3.08
RNF19B-201ENST00000235150 CCDC184Q52MB2 194 aa34.29■■■■□ 3.08
RNF19B-201ENST00000235150 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.29■■■■□ 3.08
RNF19B-201ENST00000235150 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
RNF19B-201ENST00000235150 STAC3Q96MF2 364 aa34.26■■■■□ 3.08
RNF19B-201ENST00000235150 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
RNF19B-201ENST00000235150 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.25■■■■□ 3.07
RNF19B-201ENST00000235150 ABCA6Q8N139 1617 aa34.24■■■■□ 3.07
RNF19B-201ENST00000235150 MRS2Q9HD23 443 aa34.22■■■■□ 3.07
RNF19B-201ENST00000235150 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP34.21■■■■□ 3.07
RNF19B-201ENST00000235150 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
RNF19B-201ENST00000235150 KIF1BO60333 1816 aa34.19■■■■□ 3.06
RNF19B-201ENST00000235150 IQGAP1P46940 1657 aa34.17■■■■□ 3.06
RNF19B-201ENST00000235150 GLI2P10070 1586 aa34.17■■■■□ 3.06
RNF19B-201ENST00000235150 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.17■■■■□ 3.06
RNF19B-201ENST00000235150 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.17■■■■□ 3.06
RNF19B-201ENST00000235150 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.17■■■■□ 3.06
RNF19B-201ENST00000235150 TESK2Q96S53 571 aa34.15■■■■□ 3.06
RNF19B-201ENST00000235150 RICTORQ6R327 1708 aa34.15■■■■□ 3.06
RNF19B-201ENST00000235150 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.15■■■■□ 3.06
RNF19B-201ENST00000235150 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.14■■■■□ 3.06
RNF19B-201ENST00000235150 IFT172Q9UG01 1749 aa34.1■■■■□ 3.05
RNF19B-201ENST00000235150 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.1■■■■□ 3.05
RNF19B-201ENST00000235150 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
RNF19B-201ENST00000235150 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.09■■■■□ 3.05
RNF19B-201ENST00000235150 MYOM2P54296 1465 aa34.09■■■■□ 3.05
RNF19B-201ENST00000235150 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.07■■■■□ 3.05
RNF19B-201ENST00000235150 FAM9BQ8IZU0 186 aa34.07■■■■□ 3.04
RNF19B-201ENST00000235150 MROH2AA6NES4 1674 aa34.07■■■■□ 3.04
RNF19B-201ENST00000235150 RAPGEF3O95398 923 aa34.07■■■■□ 3.04
RNF19B-201ENST00000235150 NPATQ14207 1427 aa34.05■■■■□ 3.04
RNF19B-201ENST00000235150 ABCC3O15438 1527 aa34.05■■■■□ 3.04
RNF19B-201ENST00000235150 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
RNF19B-201ENST00000235150 ADGRB3O60242 1522 aa34.02■■■■□ 3.04
RNF19B-201ENST00000235150 TMF1P82094 1093 aa34.01■■■■□ 3.04
RNF19B-201ENST00000235150 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34■■■■□ 3.03
RNF19B-201ENST00000235150 GGT6Q6P531 493 aa33.99■■■■□ 3.03
RNF19B-201ENST00000235150 DIP2BQ9P265 1576 aa33.98■■■■□ 3.03
RNF19B-201ENST00000235150 RALBP1Q15311 655 aa33.98■■■■□ 3.03
RNF19B-201ENST00000235150 ZBED9Q6R2W3 1325 aa33.97■■■■□ 3.03
RNF19B-201ENST00000235150 NRXN1Q9ULB1 1477 aa33.96■■■■□ 3.03
RNF19B-201ENST00000235150 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
RNF19B-201ENST00000235150 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
RNF19B-201ENST00000235150 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
RNF19B-201ENST00000235150 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms