RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000175756.9

PTPN18-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN18, Length 3,669 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18-201ENST00000175756 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN18-201ENST00000175756 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPN18-201ENST00000175756 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN18-201ENST00000175756 MS4A1P11836 297 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN18-201ENST00000175756 ERCC6Q03468 1493 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN18-201ENST00000175756 IQGAP2Q13576 1575 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN18-201ENST00000175756 APAF1O14727 1248 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN18-201ENST00000175756 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPN18-201ENST00000175756 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPN18-201ENST00000175756 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPN18-201ENST00000175756 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
PTPN18-201ENST00000175756 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
PTPN18-201ENST00000175756 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.2■■□□□ 1.15
PTPN18-201ENST00000175756 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 NFKBIBQ15653 356 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 CDCA8Q53HL2 280 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 GSE1Q14687 1217 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 FAM161AQ3B820 660 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 USP35Q9P2H5 1018 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 COG6Q9Y2V7 657 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPN18-201ENST00000175756 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPN18-201ENST00000175756 BCAR3O75815 825 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPN18-201ENST00000175756 BECN1Q14457 450 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPN18-201ENST00000175756 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPN18-201ENST00000175756 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPN18-201ENST00000175756 PZPP20742 1482 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPN18-201ENST00000175756 PPP2R1AP30153 589 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPN18-201ENST00000175756 SAMD9Q5K651 1589 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPN18-201ENST00000175756 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPN18-201ENST00000175756 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPN18-201ENST00000175756 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
PTPN18-201ENST00000175756 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPN18-201ENST00000175756 PANK1Q8TE04 598 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPN18-201ENST00000175756 ARHGEF11O15085 1522 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPN18-201ENST00000175756 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPN18-201ENST00000175756 MORC1Q86VD1 984 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPN18-201ENST00000175756 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPN18-201ENST00000175756 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPN18-201ENST00000175756 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PTPN18-201ENST00000175756 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPN18-201ENST00000175756 PTPRGP23470 1445 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPN18-201ENST00000175756 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPN18-201ENST00000175756 WDR62O43379 1518 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 RSPH4AQ5TD94 716 aa22■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 KIF3BO15066 747 aa22■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 ERBINQ96RT1 1412 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPN18-201ENST00000175756 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 AFAP1Q8N556 730 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 E9PSI1 815 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 CFAP53Q96M91 514 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 TESK2Q96S53 571 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 SLFN5Q08AF3 891 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 GRIN2AQ12879 1464 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 GGT6Q6P531 493 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPN18-201ENST00000175756 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPN18-201ENST00000175756 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPN18-201ENST00000175756 DISP1Q96F81 1524 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPN18-201ENST00000175756 STK26Q9P289 416 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPN18-201ENST00000175756 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPN18-201ENST00000175756 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPN18-201ENST00000175756 IGHDP01880 384 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPN18-201ENST00000175756 IFT140Q96RY7 1462 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPN18-201ENST00000175756 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPN18-201ENST00000175756 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPN18-201ENST00000175756 C8orf34Q49A92 452 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPN18-201ENST00000175756 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPN18-201ENST00000175756 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPN18-201ENST00000175756 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPN18-201ENST00000175756 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPN18-201ENST00000175756 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPN18-201ENST00000175756 POGKQ9P215 609 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPN18-201ENST00000175756 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.82■■□□□ 1.08
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