RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000102834.7

Ptprd-204, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprd, Length 8,084 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprd-204ENSMUST00000102834 March6Q6ZQ89 909 aa6.45□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Dnai1Q8C0M8 701 aa6.45□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 TxlnbQ8VBT1 685 aa6.44□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Tmc1Q8R4P5 757 aa6.44□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Eif3j2Q66JS6 263 aa6.44□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Nap1l3Q794H2 544 aa6.44□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa6.44□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 OptnQ8K3K8 584 aa6.44□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 CenpqQ9CPQ5 267 aa6.44□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 UvssaQ9D479 717 aa6.43□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Cdr1E9Q0B4 517 aa6.43□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Nf2P46662 596 aa6.43□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Tomm22Q9CPQ3 142 aa6.43□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 AdnpQ9Z103 1108 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa6.43□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Gm38655A0A286YDK6 273 aa6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Map9Q3TRR0 646 aa6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Erc1Q99MI1 1120 aa6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Pnmal2G3X9N3 661 aa6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Pip4k2aO70172 405 aa6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Taok2Q6ZQ29 1240 aa6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Cetn4Q8K4K1 168 aa6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Gm44503E9PYU5 387 aa6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Dnaaf4Q8R368 420 aa6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 NefhP19246 1090 aa6.41□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 St18Q80TY4 1045 aa6.41□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ccdc191J3QQ27 883 aa6.41□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Trap1aP19473 224 aa6.41□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Rnf20Q5DTM8 973 aa6.41□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa6.41□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Commd10Q8JZY2 202 aa6.41□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Syap1Q9D5V6 365 aa6.41□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Hoxa7P02830 229 aa6.41□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Rsph6aQ8CDR2 708 aa6.41□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ipo4Q8VI75 1082 aa6.4□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Kif3bQ61771 747 aa6.4□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Rec8Q8C5S7 591 aa6.4□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 ClasrpQ8CFC7 668 aa6.4□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 CactinQ9CS00 772 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Rwdd1Q9CQK7 243 aa6.4□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Kiaa0753Q6A000 959 aa6.4□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 4933428M09RikQ9D3X3 192 aa6.4□□□□□ -1.38
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa6.4□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Trim29Q8R2Q0 587 aa6.4□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Rsph3aQ3UFY4 516 aa6.4□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Cgnl1Q6AW69 1298 aa6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Paip2Q9D6V8 124 aa6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 DesP31001 469 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Cep112Q5PR68 954 aa6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Chmp5Q9D7S9 219 aa6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Acbd3Q8BMP6 525 aa6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Mical1Q8VDP3 1048 aa6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ccdc83Q9D4V3 305 aa6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 NacadQ5SWP3 1504 aa6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 EspnQ9ET47 871 aa6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Homer1Q9Z2Y3 366 aa6.39□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Pknox2Q8BG99 474 aa6.38□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Clip1Q922J3 1391 aa6.37□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa6.37□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ipo8Q7TMY7 1010 aa6.37□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa6.37□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Fam71e1A1L3C1 212 aa6.37□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 MvpQ9EQK5 861 aa6.37□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Cetn2Q9R1K9 172 aa6.37□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Cplx1P63040 134 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ggt6Q6PDE7 497 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Cfap53Q9D439 514 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Kif7B7ZNG0 1348 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Dcaf1Q80TR8 1506 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ccdc112A0AUP1 442 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 SlkO54988 1233 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Smc4Q8CG47 1286 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ubxn4Q8VCH8 506 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Kcnj4P52189 445 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Ccdc148Q6P5U8 527 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Tmco3Q8BH01 678 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Gpatch3Q8BIY1 525 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Cep89Q9CZX2 791 aa6.36□□□□□ -1.39
Ptprd-204ENSMUST00000102834 Tex35Q14BK3 207 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 73.5 ms