Protein–RNA interactions for Protein: P46662

Nf2, Merlin, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf2P46662 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
Nf2P46662 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Nf2P46662 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Nf2P46662 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Nf2P46662 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Nf2P46662 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Nf2P46662 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Nf2P46662 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Nf2P46662 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Nf2P46662 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Nf2P46662 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Nf2P46662 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Nf2P46662 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Nf2P46662 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Nf2P46662 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Nf2P46662 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Nf2P46662 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Nf2P46662 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Nf2P46662 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Nf2P46662 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Nf2P46662 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Nf2P46662 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Nf2P46662 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Nf2P46662 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Nf2P46662 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Nf2P46662 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Nf2P46662 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Nf2P46662 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Nf2P46662 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Nf2P46662 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Nf2P46662 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Nf2P46662 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Nf2P46662 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Nf2P46662 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Nf2P46662 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Nf2P46662 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Nf2P46662 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Nf2P46662 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Nf2P46662 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nf2P46662 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Nf2P46662 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Nf2P46662 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Nf2P46662 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Nf2P46662 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Nf2P46662 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nf2P46662 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Nf2P46662 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Nf2P46662 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Nf2P46662 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Nf2P46662 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nf2P46662 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Nf2P46662 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Nf2P46662 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nf2P46662 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nf2P46662 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nf2P46662 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Nf2P46662 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Nf2P46662 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nf2P46662 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nf2P46662 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Nf2P46662 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Nf2P46662 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Nf2P46662 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Nf2P46662 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Nf2P46662 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Nf2P46662 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nf2P46662 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Nf2P46662 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nf2P46662 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Nf2P46662 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nf2P46662 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Nf2P46662 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nf2P46662 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nf2P46662 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nf2P46662 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Nf2P46662 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Nf2P46662 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nf2P46662 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nf2P46662 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nf2P46662 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nf2P46662 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nf2P46662 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nf2P46662 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Nf2P46662 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nf2P46662 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nf2P46662 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Nf2P46662 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Nf2P46662 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nf2P46662 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nf2P46662 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nf2P46662 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Nf2P46662 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Nf2P46662 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Nf2P46662 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nf2P46662 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nf2P46662 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nf2P46662 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nf2P46662 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nf2P46662 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nf2P46662 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms