Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Pip4k2aO70172 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Pip4k2aO70172 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Pip4k2aO70172 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pip4k2aO70172 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pip4k2aO70172 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Pip4k2aO70172 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pip4k2aO70172 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pip4k2aO70172 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Pip4k2aO70172 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pip4k2aO70172 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pip4k2aO70172 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pip4k2aO70172 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Pip4k2aO70172 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Pip4k2aO70172 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pip4k2aO70172 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pip4k2aO70172 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pip4k2aO70172 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pip4k2aO70172 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pip4k2aO70172 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pip4k2aO70172 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pip4k2aO70172 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pip4k2aO70172 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pip4k2aO70172 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Pip4k2aO70172 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pip4k2aO70172 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Pip4k2aO70172 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Pip4k2aO70172 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pip4k2aO70172 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pip4k2aO70172 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Pip4k2aO70172 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pip4k2aO70172 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Pip4k2aO70172 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pip4k2aO70172 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pip4k2aO70172 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pip4k2aO70172 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Pip4k2aO70172 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pip4k2aO70172 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pip4k2aO70172 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Pip4k2aO70172 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Pip4k2aO70172 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Pip4k2aO70172 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Pip4k2aO70172 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pip4k2aO70172 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pip4k2aO70172 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pip4k2aO70172 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pip4k2aO70172 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pip4k2aO70172 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Pip4k2aO70172 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Pip4k2aO70172 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Pip4k2aO70172 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Pip4k2aO70172 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Pip4k2aO70172 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Pip4k2aO70172 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pip4k2aO70172 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Pip4k2aO70172 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pip4k2aO70172 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pip4k2aO70172 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pip4k2aO70172 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pip4k2aO70172 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Pip4k2aO70172 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pip4k2aO70172 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pip4k2aO70172 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Pip4k2aO70172 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pip4k2aO70172 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Pip4k2aO70172 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pip4k2aO70172 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pip4k2aO70172 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pip4k2aO70172 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pip4k2aO70172 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pip4k2aO70172 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pip4k2aO70172 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pip4k2aO70172 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pip4k2aO70172 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pip4k2aO70172 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pip4k2aO70172 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pip4k2aO70172 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pip4k2aO70172 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pip4k2aO70172 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Pip4k2aO70172 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Pip4k2aO70172 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Pip4k2aO70172 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pip4k2aO70172 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Pip4k2aO70172 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pip4k2aO70172 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pip4k2aO70172 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pip4k2aO70172 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pip4k2aO70172 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pip4k2aO70172 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pip4k2aO70172 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pip4k2aO70172 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pip4k2aO70172 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pip4k2aO70172 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pip4k2aO70172 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pip4k2aO70172 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pip4k2aO70172 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pip4k2aO70172 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pip4k2aO70172 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pip4k2aO70172 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pip4k2aO70172 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 393.1 ms