Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6V8

Paip2, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip2Q9D6V8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Paip2Q9D6V8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Paip2Q9D6V8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Paip2Q9D6V8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Paip2Q9D6V8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Paip2Q9D6V8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Paip2Q9D6V8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Paip2Q9D6V8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Paip2Q9D6V8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Paip2Q9D6V8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Paip2Q9D6V8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Paip2Q9D6V8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Paip2Q9D6V8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Paip2Q9D6V8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Paip2Q9D6V8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Paip2Q9D6V8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Paip2Q9D6V8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Paip2Q9D6V8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Paip2Q9D6V8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Paip2Q9D6V8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Paip2Q9D6V8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Paip2Q9D6V8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Paip2Q9D6V8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Paip2Q9D6V8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Paip2Q9D6V8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Paip2Q9D6V8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Paip2Q9D6V8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Paip2Q9D6V8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Paip2Q9D6V8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Paip2Q9D6V8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Paip2Q9D6V8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Paip2Q9D6V8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Paip2Q9D6V8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Paip2Q9D6V8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Paip2Q9D6V8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Paip2Q9D6V8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Paip2Q9D6V8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Paip2Q9D6V8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Paip2Q9D6V8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Paip2Q9D6V8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Paip2Q9D6V8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Paip2Q9D6V8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Paip2Q9D6V8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Paip2Q9D6V8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Paip2Q9D6V8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Paip2Q9D6V8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Paip2Q9D6V8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Paip2Q9D6V8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Paip2Q9D6V8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Paip2Q9D6V8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Paip2Q9D6V8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Paip2Q9D6V8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Paip2Q9D6V8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Paip2Q9D6V8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Paip2Q9D6V8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Paip2Q9D6V8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Paip2Q9D6V8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Paip2Q9D6V8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Paip2Q9D6V8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Paip2Q9D6V8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Paip2Q9D6V8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Paip2Q9D6V8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Paip2Q9D6V8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Paip2Q9D6V8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Paip2Q9D6V8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Paip2Q9D6V8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Paip2Q9D6V8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Paip2Q9D6V8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Paip2Q9D6V8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Paip2Q9D6V8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Paip2Q9D6V8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Paip2Q9D6V8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Paip2Q9D6V8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Paip2Q9D6V8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Paip2Q9D6V8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Paip2Q9D6V8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Paip2Q9D6V8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Paip2Q9D6V8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Paip2Q9D6V8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Paip2Q9D6V8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Paip2Q9D6V8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Paip2Q9D6V8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Paip2Q9D6V8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Paip2Q9D6V8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Paip2Q9D6V8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Paip2Q9D6V8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Paip2Q9D6V8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Paip2Q9D6V8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Paip2Q9D6V8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Paip2Q9D6V8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Paip2Q9D6V8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Paip2Q9D6V8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Paip2Q9D6V8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Paip2Q9D6V8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Paip2Q9D6V8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Paip2Q9D6V8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Paip2Q9D6V8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Paip2Q9D6V8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Paip2Q9D6V8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Paip2Q9D6V8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms