Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
TxlnbQ8VBT1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TxlnbQ8VBT1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TxlnbQ8VBT1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TxlnbQ8VBT1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TxlnbQ8VBT1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TxlnbQ8VBT1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TxlnbQ8VBT1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TxlnbQ8VBT1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TxlnbQ8VBT1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TxlnbQ8VBT1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TxlnbQ8VBT1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
TxlnbQ8VBT1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TxlnbQ8VBT1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TxlnbQ8VBT1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TxlnbQ8VBT1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TxlnbQ8VBT1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
TxlnbQ8VBT1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TxlnbQ8VBT1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TxlnbQ8VBT1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TxlnbQ8VBT1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TxlnbQ8VBT1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TxlnbQ8VBT1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TxlnbQ8VBT1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TxlnbQ8VBT1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TxlnbQ8VBT1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TxlnbQ8VBT1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TxlnbQ8VBT1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TxlnbQ8VBT1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TxlnbQ8VBT1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TxlnbQ8VBT1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TxlnbQ8VBT1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TxlnbQ8VBT1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TxlnbQ8VBT1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TxlnbQ8VBT1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TxlnbQ8VBT1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TxlnbQ8VBT1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TxlnbQ8VBT1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TxlnbQ8VBT1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TxlnbQ8VBT1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TxlnbQ8VBT1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TxlnbQ8VBT1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TxlnbQ8VBT1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TxlnbQ8VBT1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TxlnbQ8VBT1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TxlnbQ8VBT1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TxlnbQ8VBT1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TxlnbQ8VBT1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TxlnbQ8VBT1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TxlnbQ8VBT1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TxlnbQ8VBT1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TxlnbQ8VBT1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TxlnbQ8VBT1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TxlnbQ8VBT1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TxlnbQ8VBT1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TxlnbQ8VBT1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TxlnbQ8VBT1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TxlnbQ8VBT1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TxlnbQ8VBT1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TxlnbQ8VBT1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TxlnbQ8VBT1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TxlnbQ8VBT1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TxlnbQ8VBT1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TxlnbQ8VBT1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TxlnbQ8VBT1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TxlnbQ8VBT1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TxlnbQ8VBT1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TxlnbQ8VBT1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TxlnbQ8VBT1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TxlnbQ8VBT1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TxlnbQ8VBT1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TxlnbQ8VBT1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TxlnbQ8VBT1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TxlnbQ8VBT1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TxlnbQ8VBT1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TxlnbQ8VBT1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TxlnbQ8VBT1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TxlnbQ8VBT1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TxlnbQ8VBT1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TxlnbQ8VBT1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TxlnbQ8VBT1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TxlnbQ8VBT1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TxlnbQ8VBT1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TxlnbQ8VBT1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TxlnbQ8VBT1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TxlnbQ8VBT1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TxlnbQ8VBT1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TxlnbQ8VBT1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TxlnbQ8VBT1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TxlnbQ8VBT1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TxlnbQ8VBT1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TxlnbQ8VBT1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TxlnbQ8VBT1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TxlnbQ8VBT1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TxlnbQ8VBT1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TxlnbQ8VBT1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TxlnbQ8VBT1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TxlnbQ8VBT1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TxlnbQ8VBT1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TxlnbQ8VBT1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms