RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C YBR096WP38256 230 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C EXO84P38261 753 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C FZO1P38297 855 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MTC4P38335 694 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GOS1P38736 223 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TRM5P38793 499 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CHS7P38843 316 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C UTP9P38882 575 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YHR219WP38900 624 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MLH1P38920 769 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SHU2P38957 223 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data0.62□□□□□ -2.31not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C SOP4P39543 234 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RBG1P39729 369 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS26AP39938 119 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RPS26BP39939 119 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YER184CP39961 794 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C DLD3P39976 496 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YER010CP40011 234 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ISC1P40015 477 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ZRG8P40021 1076 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ARB1P40024 610 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C TPA1P40032 644 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C BUR6P40096 142 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NTA1P40354 457 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL169CP40442 995 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL166CP40445 542 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL165CP40446 119 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C XBP1P40489 647 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HIS6P40545 261 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SNL1P40548 159 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MPH1P40562 993 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data0.62□□□□□ -2.31not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C POP1P41812 875 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C QRI7P43122 407 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YFL051CP43552 160 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C UBP6P43593 499 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C IRC6P43615 237 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C IRC7P43623 340 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C IDS2P46958 469 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SSY5P47002 699 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C BNA3P47039 444 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YJR115WP47152 169 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HMS2P47175 358 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C UPF3P48412 387 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SUT1P53032 299 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YGL260WP53056 76 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RMR1P53060 241 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MON1P53129 644 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PRM8P53174 237 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PEF1P53238 335 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C DAM1P53267 343 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SYF2P53277 215 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MEP3P53390 489 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C OGG1P53397 376 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C DBP6P53734 629 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C GTR1Q00582 310 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NAN1Q02931 896 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL039WQ03080 316 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RSC9Q03124 581 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ABZ2Q03266 374 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SDC1Q03323 175 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C HAS1Q03532 505 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C INP1Q03694 420 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RCF1Q03713 159 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NUP53Q03790 475 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C AIM36Q03798 255 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SPC19Q03954 165 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RSM24Q03976 319 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SNX41Q04053 625 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PEX12Q04370 399 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C AGE1Q04412 482 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NAT4Q04751 285 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ELP6Q04868 273 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SPC2Q04969 178 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C COQ11Q05892 277 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C DBP9Q06218 594 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C EMG1Q06287 252 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ATG26Q06321 1198 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ARV1Q06541 321 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RAF1Q06891 181 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SYO1Q07395 620 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C CYK3Q07533 885 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C SNA4Q07549 140 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C PML1Q07930 204 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR036CQ07986 203 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C COQ10Q08058 207 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C MIM1Q08176 113 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C NTG2Q08214 380 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C ENB1Q08299 606 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C DCI1Q08558 271 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C FRE3Q08905 711 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL272CQ08984 517 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C YDL176WQ12027 708 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C RCN2Q12044 265 aa0.62□□□□□ -2.31
tT(AGU)CtT(AGU)C THP3Q12049 470 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.3 ms