RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SLY41	P22215	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ITR1	P30605	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	NTH1	P32356	751 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RNP1	P32385	249 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	TAF14	P35189	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	TUL1	P36096	758 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MRPL37	P36532	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	APT2	P36973	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	BNA4	P38169	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MSS4	P38994	779 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MBP1	P39678	833 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YEL068C	P39977	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FMP10	P40098	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	OSW5	P40219	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	CIN1	P40987	1014 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	AZF1	P41696	914 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	BNA6	P43619	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	TIM54	P47045	478 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MDE1	P47095	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	AAD10	P47182	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	UBC12	P52491	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PMT5	P52867	743 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MTO1	P53070	669 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	GPG1	P53130	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PAU12	P53343	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RHO4	Q00246	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PLB2	Q03674	706 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MSS11	Q03825	758 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	TMN2	Q04562	672 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PLB3	Q08108	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FRE3	Q08905	711 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SKM1	Q12469	655 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FRE6	Q12473	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	CBS1	P14066	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ERD2	P18414	219 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RPB5	P20434	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YCR102C	P25608	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	DOA4	P32571	926 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	VPS17	P32913	551 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SKN1	P33336	771 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ECT1	P33412	323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MAC1	P35192	417 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ECM15	P35195	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	APL3	P38065	1025 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	DTR1	P38125	572 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PAU24	P38155	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RRF1	P38771	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MOB1	P40484	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PKP1	P40530	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	VOA1	P53262	265 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YGR266W	P53326	701 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MSC1	Q03104	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PRM15	Q03262	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ROT1	Q03691	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RRN11	Q04712	507 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ARV1	Q06541	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YEH1	Q07804	573 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ATG10	Q07879	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FDH1	Q08911	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FEX2	Q08991	375 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ATP16	Q12165	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PSF1	Q12488	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SKS1	Q12505	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	URA3	P03962	267 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBX7	YBR273C	COX9	P07255	59 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UBX7	YBR273C	CMP2	P14747	604 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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