RNA–Protein interactions for RNA: YOR329C

SCD5, Transcript of Protein required for normal actin organization and endocytosis, yeast

Gene SCD5, Length 2,619 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCD5	YOR329C	TPP1	Q03796	238 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YML096W	Q04489	525 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	RNH202	Q05635	350 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YLR345W	Q06137	509 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	HDA2	Q06629	674 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SOG2	Q08817	791 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	PFA4	Q12006	378 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	MED2	Q12124	431 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SIA1	Q12212	622 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SKM1	Q12469	655 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SET6	Q12529	373 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SNF6	P18888	332 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	GIT1	P25346	518 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	NVJ1	P38881	321 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YHR219W	P38900	624 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SWD1	P39706	426 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	QDR2	P40474	542 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	ALR2	P43553	858 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SSY5	P47002	699 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	MDV1	P47025	714 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YJL055W	P47044	245 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	BUD17	P53727	317 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	NAT4	Q04751	285 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	BSC1	Q12140	328 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	ACF2	Q12168	779 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	GPR1	Q12361	961 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	COX9	P07255	59 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	NUP1	P20676	1076 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	RHB1	P25378	209 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	HYM1	P32464	399 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	KRE6	P32486	720 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	VPS17	P32913	551 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	TPO5	P36029	618 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	UBS1	P38290	277 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	OCA5	P38738	679 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	UME6	P39001	836 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	CEM1	P39525	442 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	AVT6	P40074	448 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	COG3	P40094	801 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SOK1	P40317	901 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	IBA57	P47158	497 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	HXT16	P47185	567 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SPT20	P50875	604 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SGF73	P53165	657 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	HXT15	P54854	567 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	AAT1	Q01802	451 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YKR011C	Q02209	353 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	NUP116	Q02630	1113 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YMR087W	Q04299	284 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	GPN3	Q06543	272 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	IPK1	Q06667	281 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	FLP1	P03870	423 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SAM35	P14693	329 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YIM1	P28625	365 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	ORC2	P32833	620 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	TOD6	P34219	525 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	JEN1	P36035	616 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YKL071W	P36086	256 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YBR096W	P38256	230 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YHR035W	P38769	630 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SBE22	P38814	852 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	CHL4	P38907	458 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	AIM2	P39721	246 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	GIP2	P40036	548 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	LAS21	P40367	830 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	YIL086C	P40503	102 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SMK1	P41808	388 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SHR5	P41912	237 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	GDS1	P41913	522 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	ECL1	P48235	211 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	NPY1	P53164	384 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCD5	YOR329C	SUN4	P53616	420 aa		2.17	□□□□□ -2.06

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