RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL047WYLL047W LDS2Q08218 356 aa3.57□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W YDL012CQ12489 107 aa3.57□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W GIT1P25346 518 aa3.56□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W DPH2P32461 534 aa3.56□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W PEX5P35056 612 aa3.56□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W YPQ1Q12010 308 aa3.56□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W HMS1Q12398 434 aa3.56□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W MRPL8P22353 238 aa3.55□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W TIM17P39515 158 aa3.55□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W LCB2P40970 561 aa3.55□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W IGD1P43598 195 aa3.55□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W TRF5P48561 642 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W KTR6P54070 446 aa3.55□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W ERO1Q03103 563 aa3.55□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W SFM1Q12314 213 aa3.55□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W ERP4Q12450 207 aa3.55□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W PUP2P32379 260 aa3.54□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W BMT2P38278 337 aa3.54□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W KEG1P43614 200 aa3.54□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W MLC1P53141 149 aa3.54□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W CWC22P53333 577 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W REX2P54964 269 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W ECM8P38246 354 aa3.53□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W EFM4P40516 257 aa3.53□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W SEC27P41811 889 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W ABM1P47146 123 aa3.53□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W RSC1P53236 928 aa3.53□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W YFH1Q07540 174 aa3.53□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
YLL047WYLL047W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W MNL1P38888 796 aa3.52□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W PGU1P47180 361 aa3.52□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W YMR010WQ03687 405 aa3.52□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W CHA1P25379 360 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W MDL1P33310 695 aa3.51□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W ECT1P33412 323 aa3.51□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W PFF1P38244 976 aa3.51□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W GDI1P39958 451 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W YGL262WP53054 175 aa3.51□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W MSC3Q05812 728 aa3.51□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W ADH1P00330 348 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W LDS1P31379 325 aa3.5□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W EFB1P32471 206 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W SOL2P37262 315 aa3.5□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W PFS1P38872 237 aa3.5□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W CIN2P46670 268 aa3.5□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W YIP5P53108 310 aa3.5□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W YGR018CP53211 109 aa3.5□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W VAC7P53950 1165 aa3.5□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W MCT1Q12283 360 aa3.5□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W MAS2P11914 482 aa3.49□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W MNE1P24720 663 aa3.49□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W YBL028CP38202 106 aa3.49□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W CHL4P38907 458 aa3.49□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W SEC28P40509 296 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W MCH1Q07376 486 aa3.49□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W LDB17Q12342 491 aa3.49□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W TPI1P00942 248 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W HEM4P06174 275 aa3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W CMK2P22517 447 aa3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W VAM7P32912 316 aa3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W YKR015CP36111 568 aa3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W PEX22P39718 180 aa3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W SEC9P40357 651 aa3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W JEM1P40358 645 aa3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W RET3P53600 189 aa3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W PIN3Q06449 215 aa3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W IES4Q08561 116 aa3.48□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W HSP82P02829 709 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W SSE1P32589 693 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W YHR177WP38867 453 aa3.47□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W EPL1P43572 832 aa3.47□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W FLC3P53121 802 aa3.47□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W YDL109CQ12103 647 aa3.47□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W SKS1Q12505 502 aa3.47□□□□□ -1.85
YLL047WYLL047W ANP1P32629 500 aa3.46□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W LYS12P40495 371 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W YFL012WP43580 148 aa3.46□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W SEH1P53011 349 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W YPR078CQ06813 372 aa3.46□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W UNG1P12887 359 aa3.45□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W PSO2P30620 661 aa3.45□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W TOA1P32773 286 aa3.45□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W DTR1P38125 572 aa3.45□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W YPL107WQ02873 248 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.5 ms