RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q CKA2P19454 339 aa1.31□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q UTR5P32630 166 aa1.31□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRP46P53256 223 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q SKO1Q02100 647 aa1.31□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q DDC1Q08949 612 aa1.31□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q HIF1Q12373 385 aa1.31□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q HMS1Q12398 434 aa1.31□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q ADE4P04046 510 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q FRM2P37261 193 aa1.3□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q SHE3P38272 425 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q COS4P43542 379 aa1.3□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEH1P53011 349 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q INP2Q03824 705 aa1.3□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q FAR10Q06001 478 aa1.3□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q RUP1Q12242 671 aa1.3□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q SFM1Q12314 213 aa1.3□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q POM152P39685 1337 aa1.3□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATP1P07251 545 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q IMA3P0CW40 589 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q IMA4P0CW41 589 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q FUS3P16892 353 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q EPT1P22140 391 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data1.29□□□□□ -2.2not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q SCC4P40090 624 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q VID27P40157 782 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q STB1P42845 420 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q VEL1P53058 206 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGR117CP53270 476 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPN9Q04062 393 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRX8Q05473 314 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSC3Q05812 728 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q IMA2Q08295 589 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q MED2Q12124 431 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q PCL9Q12477 304 aa1.29□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q PDC2P32896 925 aa1.28□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR177WQ06251 628 aa1.28□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q MCT1Q12283 360 aa1.28□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR338WQ99326 363 aa1.28□□□□□ -2.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q AUS1Q08409 1394 aa1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q SCH9P11792 824 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q ALG1P16661 449 aa1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q GFD2P25370 566 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q LDS1P31379 325 aa1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAD23P32628 398 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q TOA1P32773 286 aa1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q SKT5P34226 696 aa1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q SMP1P38128 452 aa1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q KEG1P43614 200 aa1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRF5P48561 642 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPR6Q01684 191 aa1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q KAP120Q02932 1032 aa1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDR115WQ04598 105 aa1.27□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q CLB1P24868 471 aa1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q CLB3P24870 427 aa1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q ROX1P25042 368 aa1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPS19P32573 292 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPO23P33757 523 aa1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q ECM8P38246 354 aa1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q ASN2P49090 572 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRM112P53738 135 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q VAC7P53950 1165 aa1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q REX2P54964 269 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRP42Q03776 544 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q DON1Q05610 365 aa1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHC1Q05900 231 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRO7Q12038 1033 aa1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q MEX67Q99257 599 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRP7P12687 371 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q CKA1P15790 372 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSP1P28737 362 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q MCR1P36060 302 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q HEL1P36113 551 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q WSC4P38739 605 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q YIL059CP40520 121 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q IRC6P43615 237 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q RNH201P53942 307 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIM10P87108 93 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q LDS2Q08218 356 aa1.25□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q DAL5P15365 543 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q URA4P20051 364 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q BRF1P29056 596 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG12P38316 186 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPT35P38815 214 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q RBG1P39729 369 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q YER079WP40052 210 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q MMF1P40185 145 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q UFE1P41834 346 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q BIO3P50277 480 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q RTS3P53289 263 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR010WQ03687 405 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR155WQ03795 547 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR130WQ04223 302 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q DCS1Q06151 350 aa1.24□□□□□ -2.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q DST1P07273 309 aa1.23□□□□□ -2.21
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