Protein–RNA interactions for Protein: Q12038

SRO7, Lethal(2) giant larvae protein homolog SRO7, yeastyeast

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Length 1,033 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRO7Q12038 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.2■□□□□ 0.82
SRO7Q12038 NSR1YGR159C 1245 nt19.76■□□□□ 0.75
SRO7Q12038 NOP1YDL014W 984 nt19.72■□□□□ 0.75
SRO7Q12038 YKL036CYKL036C 393 nt18.46■□□□□ 0.55
SRO7Q12038 MDJ1YFL016C 1536 nt17.32■□□□□ 0.36
SRO7Q12038 YJL027CYJL027C 417 nt17.31■□□□□ 0.36
SRO7Q12038 Q0297Q0297 156 nt17.3■□□□□ 0.36
SRO7Q12038 SRX1YKL086W 384 nt17.2■□□□□ 0.34
SRO7Q12038 SCS3YGL126W 1143 nt16.93■□□□□ 0.3
SRO7Q12038 YCR051WYCR051W 669 nt16.42■□□□□ 0.22
SRO7Q12038 YOL085CYOL085C 342 nt15.96■□□□□ 0.15
SRO7Q12038 PKP1YIL042C 1185 nt15.75■□□□□ 0.11
SRO7Q12038 RPP1BYDL130W 321 nt15.55■□□□□ 0.08
SRO7Q12038 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.38■□□□□ 0.05
SRO7Q12038 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.38■□□□□ 0.05
SRO7Q12038 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.38■□□□□ 0.05
SRO7Q12038 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.38■□□□□ 0.05
SRO7Q12038 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.38■□□□□ 0.05
SRO7Q12038 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.38■□□□□ 0.05
SRO7Q12038 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.38■□□□□ 0.05
SRO7Q12038 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.38■□□□□ 0.05
SRO7Q12038 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.38■□□□□ 0.05
SRO7Q12038 DBP2YNL112W 1641 nt15.36■□□□□ 0.05
SRO7Q12038 CCC1YLR220W 969 nt15.32■□□□□ 0.04
SRO7Q12038 SCJ1YMR214W 1134 nt15.31■□□□□ 0.04
SRO7Q12038 ATS1YAL020C 1002 nt15.21■□□□□ 0.03
SRO7Q12038 PET122YER153C 765 nt14.84□□□□□ -0.03
SRO7Q12038 SCR1SCR1 522 nt14.79□□□□□ -0.04
SRO7Q12038 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.67□□□□□ -0.06
SRO7Q12038 YBR190WYBR190W 312 nt14.65□□□□□ -0.06
SRO7Q12038 RVS167YDR388W 1449 nt14.6□□□□□ -0.07
SRO7Q12038 RRN5YLR141W 1092 nt14.45□□□□□ -0.1
SRO7Q12038 RTC3YHR087W 336 nt14.44□□□□□ -0.1
SRO7Q12038 RSB1YOR049C 1065 nt14.28□□□□□ -0.12
SRO7Q12038 YDJ1YNL064C 1230 nt14.16□□□□□ -0.14
SRO7Q12038 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.15□□□□□ -0.14
SRO7Q12038 SHR5YOL110W 714 nt14.12□□□□□ -0.15
SRO7Q12038 PST2YDR032C 597 nt14.02□□□□□ -0.17
SRO7Q12038 GAR1YHR089C 618 nt13.87□□□□□ -0.19
SRO7Q12038 DEP1YAL013W 1218 nt13.69□□□□□ -0.22
SRO7Q12038 YKL097CYKL097C 411 nt13.67□□□□□ -0.22
SRO7Q12038 URN1YPR152C 1398 nt13.58□□□□□ -0.23
SRO7Q12038 YNL208WYNL208W 600 nt13.46□□□□□ -0.25
SRO7Q12038 RPN10YHR200W 807 nt13.45□□□□□ -0.26
SRO7Q12038 SHU1YHL006C 453 nt13.41□□□□□ -0.26
SRO7Q12038 TIR1YER011W 765 nt13.36□□□□□ -0.27
SRO7Q12038 OPI9YLR338W 858 nt13.28□□□□□ -0.28
SRO7Q12038 SSA3YBL075C 1950 nt13.18□□□□□ -0.3
SRO7Q12038 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.16□□□□□ -0.3
SRO7Q12038 SAH1YER043C 1350 nt13.16□□□□□ -0.3
SRO7Q12038 SSA1YAL005C 1929 nt13.11□□□□□ -0.31
SRO7Q12038 PUT4YOR348C 1884 nt13.06□□□□□ -0.32
SRO7Q12038 YOR139CYOR139C 393 nt13.02□□□□□ -0.33
SRO7Q12038 YJR018WYJR018W 363 nt12.96□□□□□ -0.33
SRO7Q12038 SRB2YHR041C 633 nt12.94□□□□□ -0.34
SRO7Q12038 NPL3YDR432W 1245 nt12.92□□□□□ -0.34
SRO7Q12038 PUN1YLR414C 792 nt12.92□□□□□ -0.34
SRO7Q12038 ARE1YCR048W 1833 nt12.92□□□□□ -0.34
SRO7Q12038 YGR021WYGR021W 873 nt12.83□□□□□ -0.36
SRO7Q12038 WWM1YFL010C 636 nt12.82□□□□□ -0.36
SRO7Q12038 RPP2BYDR382W 333 nt12.81□□□□□ -0.36
SRO7Q12038 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.81□□□□□ -0.36
SRO7Q12038 MNP1YGL068W 585 nt12.8□□□□□ -0.36
SRO7Q12038 HOM6YJR139C 1080 nt12.77□□□□□ -0.37
SRO7Q12038 YJR120WYJR120W 351 nt12.76□□□□□ -0.37
SRO7Q12038 POA1YBR022W 534 nt12.74□□□□□ -0.37
SRO7Q12038 PTC2YER089C 1395 nt12.73□□□□□ -0.37
SRO7Q12038 YOL037CYOL037C 354 nt12.67□□□□□ -0.38
SRO7Q12038 RKM5YLR137W 1104 nt12.6□□□□□ -0.39
SRO7Q12038 BUD23YCR047C 828 nt12.59□□□□□ -0.39
SRO7Q12038 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.59□□□□□ -0.39
SRO7Q12038 BDH2YAL061W 1254 nt12.56□□□□□ -0.4
SRO7Q12038 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.5□□□□□ -0.41
SRO7Q12038 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.5□□□□□ -0.41
SRO7Q12038 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.5□□□□□ -0.41
SRO7Q12038 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.5□□□□□ -0.41
SRO7Q12038 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.5□□□□□ -0.41
SRO7Q12038 NAB2YGL122C 1578 nt12.5□□□□□ -0.41
SRO7Q12038 FPR4YLR449W 1179 nt12.46□□□□□ -0.41
SRO7Q12038 INM2YDR287W 879 nt12.45□□□□□ -0.42
SRO7Q12038 LSM3YLR438C-A 270 nt12.43□□□□□ -0.42
SRO7Q12038 YBL100CYBL100C 315 nt12.4□□□□□ -0.42
SRO7Q12038 DAL1YIR027C 1383 nt12.4□□□□□ -0.42
SRO7Q12038 BSC6YOL137W 1494 nt12.39□□□□□ -0.43
SRO7Q12038 PUS2YGL063W 1113 nt12.37□□□□□ -0.43
SRO7Q12038 YLR281CYLR281C 468 nt12.34□□□□□ -0.43
SRO7Q12038 FIS1YIL065C 468 nt12.33□□□□□ -0.44
SRO7Q12038 TRM9YML014W 840 nt12.31□□□□□ -0.44
SRO7Q12038 WHI5YOR083W 888 nt12.29□□□□□ -0.44
SRO7Q12038 PHO4YFR034C 939 nt12.28□□□□□ -0.44
SRO7Q12038 FUN26YAL022C 1554 nt12.25□□□□□ -0.45
SRO7Q12038 MOT3YMR070W 1473 nt12.14□□□□□ -0.47
SRO7Q12038 CCT6YDR188W 1641 nt12.11□□□□□ -0.47
SRO7Q12038 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.07□□□□□ -0.48
SRO7Q12038 ALF1YNL148C 765 nt12.07□□□□□ -0.48
SRO7Q12038 FMP45YDL222C 930 nt12.06□□□□□ -0.48
SRO7Q12038 DSK2YMR276W 1122 nt12.06□□□□□ -0.48
SRO7Q12038 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.04□□□□□ -0.48
SRO7Q12038 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.04□□□□□ -0.48
SRO7Q12038 YPR011CYPR011C 981 nt12.01□□□□□ -0.49
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