RNA–Protein interactions for RNA: YLR265C

NEJ1, Transcript of Protein involved in regulation of nonhomologous end joining, yeast

Gene NEJ1, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEJ1	YLR265C	GPI18	P38211	433 aa		3.22	□□□□□ -1.89
NEJ1	YLR265C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
NEJ1	YLR265C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
NEJ1	YLR265C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
NEJ1	YLR265C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.21	□□□□□ -1.9	RIP-Chip
NEJ1	YLR265C	ALG1	P16661	449 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	ZRC1	P20107	442 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	YGR117C	P53270	476 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	YPR091C	Q06833	770 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	CDC21	P06785	304 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	CPR2	P23285	205 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	INM1	P38710	295 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	YLR345W	Q06137	509 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	AEP3	Q12089	606 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	PFS1	P38872	237 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	TOS2	P50078	622 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	YGL262W	P53054	175 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	FLC3	P53121	802 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	SPR6	Q01684	191 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	RMT2	Q03305	412 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	YLR456W	Q06199	204 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	YDL114W	Q07530	308 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	FCY22	Q12119	530 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	COX13	P32799	129 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	GPI16	P38875	610 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	ZIM17	P42844	174 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	IGD1	P43598	195 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	STE24	P47154	453 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	IGO1	P53897	168 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	FUN26	P31381	517 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	PIB2	P53191	635 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	SPC19	Q03954	165 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	YDL199C	Q12407	687 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	PRM7	Q12459	698 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	DEP1	P31385	405 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	DPH2	P32461	534 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	SKT5	P34226	696 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	GPX2	P38143	162 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	FAD1	P38913	306 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	RRN9	P53437	365 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	KTR6	P54070	446 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	UAF30	Q08747	228 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	YPS3	Q12303	508 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	RNH203	Q12338	110 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEJ1	YLR265C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	YIP5	P53108	310 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	PIN3	Q06449	215 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	NSE1	Q07913	336 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	OPI3	P05375	206 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	DTR1	P38125	572 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	PMT5	P52867	743 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	YGR111W	P53265	400 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	MCH1	Q07376	486 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	RFM1	Q12192	310 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	YOP1	Q12402	180 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
NEJ1	YLR265C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
NEJ1	YLR265C	ECT1	P33412	323 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	QDR3	P38227	689 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	ECM8	P38246	354 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	ATM1	P40416	690 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	ECM7	Q06200	448 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	MCT1	Q12283	360 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	TPK3	P05986	398 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	CMK2	P22517	447 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	FMT1	P32785	401 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	SPO23	P33757	523 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	TIR2	P33890	251 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	GEP4	P38812	185 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	SEC9	P40357	651 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	KEG1	P43614	200 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	VHT1	P53241	593 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	ISA2	Q12425	185 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	RAX2	Q12465	1220 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	PCL9	Q12477	304 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	GIT1	P25346	518 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	PHO91	P27514	894 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	DBF4	P32325	704 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	TOA2	P32774	122 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	YFL012W	P43580	148 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEJ1	YLR265C	ABM1	P47146	123 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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