RNA–Protein interactions for RNA: YMR089C

YTA12, Transcript of Mitochondrial inner membrane m-AAA protease component, yeast

Gene YTA12, Length 2,478 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YTA12	YMR089C	SPC2	Q04969	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	IPK1	Q06667	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	MCM21	Q06675	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SNA4	Q07549	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	VAM3	Q12241	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	GAL4	P04386	881 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	RHB1	P25378	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YTA12	YMR089C	YBR144C	P34215	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SAP30	P38429	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SHR3	Q02774	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	RIM13	Q03792	727 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	HOF1	Q05080	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	REX4	Q08237	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	GRE1	Q08969	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	BTS1	Q12051	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YTA12	YMR089C	POM34	Q12445	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	TRP3	P00937	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	RAD3	P06839	778 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SPO12	P17123	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	HXT2	P23585	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	DOA1	P36037	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YKL071W	P36086	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YHR122W	P38829	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YEL020C	P39994	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SDP1	P40479	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	IDS2	P46958	469 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	ROG1	P53118	685 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SEC10	Q06245	871 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	PDE2	P06776	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SAM35	P14693	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	KIN82	P25341	720 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SHP1	P34223	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SAF1	P38352	637 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YHR210C	P38893	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	ALP1	P38971	573 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
YTA12	YMR089C	RNT1	Q02555	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	VPS60	Q03390	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	TPP1	Q03796	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	ECM3	Q99252	613 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	PUT2	P07275	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SEC63	P14906	663 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	PHO13	P19881	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	PPA2	P28239	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	TRM2	P33753	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	GPI16	P38875	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SNG1	P46950	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	HIT1	P46973	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	STE24	P47154	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	LIF1	P53150	421 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YAT1	P80235	687 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	FMP30	Q02883	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	CDC123	Q05791	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	SUL1	P38359	859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	FHL1	P39521	936 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	UBP5	P39944	805 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	NDC80	P40460	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	TED1	P40533	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	MRP51	Q02950	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	ATG17	Q06410	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	POS5	Q06892	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	PAM18	Q07914	168 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	CHS1	P08004	1131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YTA12	YMR089C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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