RNA–Protein interactions for RNA: YMR078C

CTF18, Transcript of Subunit of a complex with Ctf8p, yeast

Gene CTF18, Length 2,226 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTF18	YMR078C	MEH1	Q02205	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTF18	YMR078C	BET5	Q03630	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTF18	YMR078C	NDL1	Q06568	189 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTF18	YMR078C	SLY1	P22213	666 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	RTT103	Q05543	409 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	MUM3	Q08750	479 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	RIB5	P38145	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	PFF1	P38244	976 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	YBP1	P38315	674 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	YHR218W	P38899	603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	ROG1	P53118	685 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	IBD2	P53892	351 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	SIM1	P40472	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	YIL067C	P40514	678 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	FRE6	Q12473	712 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	SKS1	Q12505	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	PHO2	P07269	559 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	MLC1	P53141	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	DAP2	P18962	818 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	KKQ8	P36004	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	INM1	P38710	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	AZR1	P50080	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	RUP1	Q12242	671 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	YBR139W	P38109	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	QDR3	P38227	689 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	YSW1	P38280	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	PIB2	P53191	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	BOR1	P53838	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	PPM1	Q04081	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	RNH203	Q12338	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	PHO91	P27514	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	YSC83	P32792	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	STD1	Q02794	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	TOS2	P50078	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	NSE1	Q07913	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	PDE2	P06776	526 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	CDC21	P06785	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	OPI1	P21957	404 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	SPS22	P25380	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
CTF18	YMR078C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	PMT5	P52867	743 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	MMT1	Q03218	510 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTF18	YMR078C	CPR4	P25334	318 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
CTF18	YMR078C	JLP2	P40206	208 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	BCH1	Q05029	724 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	NFI1	Q12216	726 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	ERV2	Q12284	196 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	DST1	P07273	309 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	YIP5	P53108	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	ECM7	Q06200	448 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	TLG2	Q08144	397 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	ESA1	Q08649	445 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	YBR056W	P38081	501 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	MTC6	P38849	526 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	YFL067W	P43537	175 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	BRO1	P48582	844 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	YGR016W	P53209	190 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	COS1	P53822	381 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	OPI3	P05375	206 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	CYC3	P06182	269 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	SKN1	P33336	771 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	MRPL4	P36517	319 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	NCA3	P46955	337 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	SFH5	P47008	294 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	YHR177W	P38867	453 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	MNL1	P38888	796 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	PRM5	P40476	318 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	MTM1	P53320	366 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	CPR3	P25719	182 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	MSP1	P28737	362 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	TOF1	P53840	1238 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	EOS1	P53938	366 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	URC2	Q04411	772 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTF18	YMR078C	RAX1	Q08760	435 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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