RNA–Protein interactions for RNA: YKL108W

SLD2, Transcript of Single-stranded DNA origin-binding and annealing protein, yeast

Gene SLD2, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLD2	YKL108W	PUS9	Q12069	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	MHP1	P43638	1398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SEC62	P21825	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	INM1	P38710	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	GCD10	P41814	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	TRS85	P46944	698 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	DIC1	Q06143	298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	ECM7	Q06200	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	MCP2	Q06567	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	RKM5	Q12367	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	PEP1	P32319	1579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	HXT2	P23585	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	PET18	P25362	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	RGT1	P32862	1170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	MRPL37	P36532	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	ERG7	P38604	731 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	ALP1	P38971	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SNL1	P40548	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YGL114W	P53134	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	ARR1	Q06596	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	BSP1	Q06604	576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	REV3	P14284	1504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SIN3	P22579	1536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	OPI3	P05375	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	MAS1	P10507	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SNC1	P31109	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	APD1	P38281	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SWC5	P38326	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	RTT107	P38850	1070 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	PHO90	P39535	881 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	UBP5	P39944	805 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YIR014W	P40570	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YPS6	P40583	537 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	PAC11	P40960	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	IRC7	P43623	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	BRO1	P48582	844 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	NUP84	P52891	726 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	PCP1	P53259	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YNL146W	P53906	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	RHO4	Q00246	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	GLE1	Q12315	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	MYO4	P32492	1471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	RPN13	O13563	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	UTR4	P32626	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	RAD24	P32641	659 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	ELM1	P32801	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	MIC60	P36112	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	FLO10	P36170	1169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	PHB2	P50085	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	GPI1	P53306	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	NUP100	Q02629	959 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	CAB5	Q03941	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	GLO2	Q05584	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	NRT1	Q08485	598 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	FRE7	Q12333	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	DST1	P07273	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	UGA1	P17649	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	SPO11	P23179	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	RAD57	P25301	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	GID7	P25569	745 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	YKL070W	P36087	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	SPT8	P38915	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	YGL185C	P53100	379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	RTT102	P53330	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	MPS1	P54199	764 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	IVY1	Q04934	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	RUP1	Q12242	671 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	RNH203	Q12338	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	RRI1	Q12468	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	RMD5	Q12508	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	PDR10	P51533	1564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	HIR3	P47171	1648 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	GAL4	P04386	881 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLD2	YKL108W	UNG1	P12887	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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