RNA–Protein interactions for RNA: YDL093W

PMT5, Transcript of Protein O-mannosyltransferase, yeast

Gene PMT5, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMT5	YDL093W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	VHS2	P40463	436 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	NMD5	P46970	1048 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	UBX6	P47049	396 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	AIM22	P47051	409 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	BRO1	P48582	844 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	NMA2	P53204	395 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YML053C	Q04978	212 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	CRT10	Q08226	957 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	GAL3	P13045	520 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	GID7	P25569	745 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	GSH1	P32477	678 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YHR045W	P38775	560 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	NSG2	P53898	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	VAC14	Q06708	880 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	ARG81	P05085	880 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	ABF1	P14164	731 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	STE11	P23561	717 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	TSC10	P38342	320 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YGR127W	P53275	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	GTO3	Q04806	366 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	POM152	P39685	1337 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	APL3	P38065	1025 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YGR126W	P53274	230 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	HRD3	Q05787	833 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	RRD2	Q12461	358 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	FIG2	P25653	1609 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	PMD1	P32634	1753 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	MSF1	P08425	469 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	LHS1	P36016	881 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	ARP1	P38696	384 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	LAM4	P38800	1345 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	MTW1	P39731	289 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	LAS21	P40367	830 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YGR117C	P53270	476 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	RET3	P53600	189 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	TRS23	Q03784	219 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	GEP3	Q08622	556 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	MED2	Q12124	431 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
PMT5	YDL093W	VAM3	Q12241	283 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	LAG2	Q92325	660 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	CDC23	P16522	626 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	HIR2	P32480	875 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	SWC5	P38326	303 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	ATG27	P46989	271 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	SPT20	P50875	604 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YIP5	P53108	310 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	PLM2	Q04383	521 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	ARR2	Q06597	130 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	CYK3	Q07533	885 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	TEN1	Q07921	160 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	COX3	P00420	269 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	CHO1	P08456	276 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	HXT1	P32465	570 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	TRM2	P33753	639 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	SHC1	P39000	512 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YGL108C	P53139	140 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	CAB5	Q03941	241 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	APC4	Q04601	652 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	RRG8	Q06109	277 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	DCS1	Q06151	350 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	MTR10	Q99189	972 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	RAP1	P11938	827 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PMT5	YDL093W	ADY2	P25613	283 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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