RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeastyeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FPR4YLR449W SCL1P21243 252 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W CTS1P29029 562 aa12.47□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W TIF3P34167 436 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W ARA1P38115 344 aa12.47□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W MTG2P38860 518 aa12.47□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W APQ12P40532 138 aa12.47□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W MPH1P40562 993 aa12.47□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W YNR014WP53719 212 aa12.47□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W RHO1P06780 209 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W SWD1P39706 426 aa12.46□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W YJL043WP47053 257 aa12.46□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W RRN5Q02983 363 aa12.46□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W SRO7Q12038 1033 aa12.46□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W NAG1Q8TGN9 163 aa12.46□□□□□ -0.41
FPR4YLR449W GPH1P06738 902 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W PTP2P29461 750 aa12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W CYS4P32582 507 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W PEP12P32854 288 aa12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W MRPL6P32904 214 aa12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W YJL070CP40361 888 aa12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W MNT3P40549 630 aa12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W EMC2P47133 292 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W RRT8Q08219 342 aa12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W GYP1Q08484 637 aa12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W CCH1P50077 2039 aa12.45□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W SPT15P13393 240 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W CBP4P37267 147 aa12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W DSF2P38213 736 aa12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W GOS1P38736 223 aa12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W COQ5P49017 307 aa12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W KXD1P53158 218 aa12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W SWF1Q04629 336 aa12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W ENT2Q05785 613 aa12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W ARR1Q06596 294 aa12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W MCA1Q08601 432 aa12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W HAL9Q12180 1030 aa12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W YDL199CQ12407 687 aa12.44□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W LAT1P12695 482 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W CNA1P23287 553 aa12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W YCL049CP25577 312 aa12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W NTG1P31378 399 aa12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W NUP2P32499 720 aa12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W SSE2P32590 693 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W YKR015CP36111 568 aa12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W DED81P38707 554 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W MPM1P40364 252 aa12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W YRB2P40517 327 aa12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W RIB3Q99258 208 aa12.43□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W CTR86P25355 563 aa12.42□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W TRM7P38238 310 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W BIO3P50277 480 aa12.42□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W SDT1P53078 280 aa12.42□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W SWP1Q02795 286 aa12.42□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W YDR179W-AQ03983 463 aa12.42□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W REH1Q06709 432 aa12.42□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W SAC1P32368 623 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W SPC42P36094 363 aa12.41□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W MAP2P38174 421 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W HXT5P38695 592 aa12.41□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W YEL020CP39994 560 aa12.41□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W MAD2P40958 196 aa12.41□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data12.41□□□□□ -0.42not detected
FPR4YLR449W SSU1P41930 458 aa12.41□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W FAR7P43592 221 aa12.41□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data12.41□□□□□ -0.42not detected
FPR4YLR449W SNO2P53823 222 aa12.41□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W SMA1Q02651 245 aa12.41□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W FAB1P34756 2278 aa12.41□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W ALG7P07286 448 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W UBC8P28263 218 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W PET127P32606 800 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W HCS1P34243 683 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W LHS1P36016 881 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W SCO2P38072 301 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W RRN10P38204 145 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W ECM8P38246 354 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W STP2P38704 541 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W PRM10P42946 383 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W PMT4P46971 762 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W SGF73P53165 657 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W SMP3Q04174 516 aa12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
FPR4YLR449W TPK3P05986 398 aa12.39□□□□□ -0.43
FPR4YLR449W STE7P06784 515 aa12.39□□□□□ -0.43
FPR4YLR449W GRR1P24814 1151 aa12.39□□□□□ -0.43
FPR4YLR449W ADE1P27616 306 aa12.39□□□□□ -0.43
FPR4YLR449W SSH4P32343 579 aa12.39□□□□□ -0.43
FPR4YLR449W SIC1P38634 284 aa12.39□□□□□ -0.43
FPR4YLR449W RRP3P38712 501 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
FPR4YLR449W MSS2P40990 351 aa12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.8 ms