RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	DPH2	P32461	534 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	COS9	P36034	407 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ACO2	P39533	789 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PAN6	P40459	309 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NEO1	P40527	1151 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	LYS5	P50113	272 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HCH1	P53834	153 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	IPK1	Q06667	281 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MFG1	Q07684	458 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PEX27	Q08580	376 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CIT2	P08679	460 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AMD2	P22580	549 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ACB1	P31787	87 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YBR062C	P38239	180 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PHO12	P38693	467 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YEL028W	P39989	153 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MGA1	P53050	456 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PEF1	P53238	335 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MRPS35	P53292	345 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PUN1	Q06991	263 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RAX1	Q08760	435 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FDH1	Q08911	376 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ACM1	Q08981	209 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BAG7	Q12128	409 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	INH1	P01097	85 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PBN1	P25580	416 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SUA5	P32579	426 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MTH1	P35198	433 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PEP8	P40335	379 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SAE2	P46946	345 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SSY5	P47002	699 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	UBX6	P47049	396 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MET13	P53128	600 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ADD37	Q03233	198 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	THP1	Q08231	455 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YPR202W	Q08993	238 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NPR1	P22211	790 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BEM1	P29366	551 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GID8	P40208	455 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DLS1	P40366	167 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YGR149W	P48236	432 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	APS2	Q00381	147 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MSC2	Q03455	724 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NPC2	Q12408	173 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	UGA1	P17649	471 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SLC1	P33333	303 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SEF1	P34228	1148 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	UIP3	P39547	235 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	VPS70	P47161	811 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GPG1	P53130	126 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MRPL13	Q02204	264 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YDR131C	Q03899	556 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DCI1	Q08558	271 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SIA1	Q12212	622 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	VAM3	Q12241	283 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RRI1	Q12468	440 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	REP2	P03872	296 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	COQ1	P18900	473 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DAL81	P21657	970 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HXT2	P23585	541 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YSP3	P25036	478 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PMT2	P31382	759 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PPH3	P32345	308 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GRX7	P38068	203 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GDH3	P39708	457 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PMT6	P42934	759 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	LSB6	P42951	607 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RTS3	P53289	263 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TGL2	P54857	326 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BTS1	Q12051	335 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BI4	P03879	638 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HAP3	P13434	144 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AMS1	P22855	1083 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	VAM7	P32912	316 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ARN2	P38724	620 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	OCA5	P38738	679 aa		2.69	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ABZ2	Q03266	374 aa		2.69	□□□□□ -1.98

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