RNA–Protein interactions for RNA: YMR019W

STB4, Transcript of Putative transcription factor, yeast

Gene STB4, Length 2,850 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB4	YMR019W	AIM22	P47051	409 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	IRC15	Q02733	499 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	NRT1	Q08485	598 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	VPS54	Q12071	889 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	YAR066W	P0CX18	203 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	YHR214W	P0CX19	203 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	MNE1	P24720	663 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	PUP2	P32379	260 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	RML2	P32611	393 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	ECM27	P47144	725 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	GIP3	Q03016	1276 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SKS1	Q12505	502 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	CTF3	Q12748	733 aa		1.99	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	MSN2	P33748	704 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	YPT53	P36019	220 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	PIM1	P36775	1133 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SER3	P40054	469 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	MEP1	P40260	492 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	GAT1	P43574	510 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SSN8	P47821	323 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	BUD32	P53323	261 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	YPL107W	Q02873	248 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	NUP53	Q03790	475 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	DIC1	Q06143	298 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SIL1	Q08199	421 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	THI20	Q08224	551 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	DCI1	Q08558	271 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	UAF30	Q08747	228 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	AEP3	Q12089	606 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	BUG1	Q12191	341 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	1.98	□□□□□ -2.09	not detected
STB4	YMR019W	NFI1	Q12216	726 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	GPM3	Q12326	303 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	CSR2	Q12734	1121 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	PDE2	P06776	526 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	BAR1	P12630	587 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	URA4	P20051	364 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	LEU5	P38702	357 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	YHR054C	P38780	354 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	MET30	P39014	640 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	PKP2	P53170	491 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	YGR111W	P53265	400 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	MPS1	P54199	764 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	GYL1	Q04322	720 aa		1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	1.98	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SPO7	P18410	259 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	PTR2	P32901	601 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	LTV1	P34078	463 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SPC34	P36131	295 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	YER130C	P39959	443 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	BTN2	P53286	410 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	PHO92	Q06390	306 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	BSC1	Q12140	328 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	YDL009C	Q12210	107 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	VAM3	Q12241	283 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	FRE6	Q12473	712 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	HIP1	P06775	603 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	ATP10	P18496	279 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SIF2	P38262	535 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.97	□□□□□ -2.09	not detected
STB4	YMR019W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	IKS1	P47042	667 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	CRZ1	P53968	678 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SLG1	P54867	378 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	PNG1	Q02890	363 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	PEX25	Q02969	394 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SLD5	Q03406	294 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	HSP31	Q04432	237 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	DCS1	Q06151	350 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	GEP3	Q08622	556 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	SPT7	P35177	1332 aa		1.97	□□□□□ -2.09
STB4	YMR019W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	1.96	□□□□□ -2.09

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23 ms