RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MET32Q12041 191 aa3.87□□□□□ -1.79
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJR115WP47152 169 aa3.85□□□□□ -1.79
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data3.84□□□□□ -1.79not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SEC2P17065 759 aa3.83□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RRN7P40992 514 aa3.83□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HPF1Q05164 967 aa3.83□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RAD54P32863 898 aa3.82□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UBP14P38237 781 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR346CQ06139 101 aa3.82□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR204WQ08995 1032 aa3.82□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-DR4O74302 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-AP0CX57 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-PR1P0CX58 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-ORP0CX59 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-PR2P0CX60 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-DR5P0CX65 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-ER2P0CX66 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-GR3P0CX67 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-LR1P0CX68 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-MR2P0CX69 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-JR2P47099 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-DR1Q03856 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TUM1Q08686 304 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-BRQ12217 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-NL2Q12470 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-GR2Q12485 440 aa3.81□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TFB4Q12004 338 aa3.8□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VHR2P40041 505 aa3.79□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OPT2Q06593 877 aa3.78□□□□□ -1.8
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CSC1Q06538 782 aa3.77□□□□□ -1.81
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PHM7Q12252 991 aa3.77□□□□□ -1.81
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIR007WP40566 764 aa3.75□□□□□ -1.81
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSB3P48566 633 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GAP1P19145 602 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SRF1Q12516 437 aa3.72□□□□□ -1.81
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GLY1P37303 387 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SCW11P53189 542 aa3.71□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PUS5Q06244 254 aa3.71□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KIC1P38692 1080 aa3.7□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MOD5P07884 428 aa3.68□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SBP1P10080 294 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UGA3P26370 528 aa3.68□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MDJ1P35191 511 aa3.68□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PTK2P47116 818 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DPH6Q12429 685 aa3.68□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-BLQ12266 440 aa3.67□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MIP1P15801 1254 aa3.66□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IFH1P39520 1085 aa3.66□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TYW1Q08960 810 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CCT8P47079 568 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NUP85P46673 744 aa3.64□□□□□ -1.83
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NSG2P53898 299 aa3.63□□□□□ -1.83
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PAC1P39946 494 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDR090CQ03193 310 aa3.62□□□□□ -1.83
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KEX2P13134 814 aa3.59□□□□□ -1.83
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LYS5P50113 272 aa3.59□□□□□ -1.83
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UBP2Q01476 1272 aa3.59□□□□□ -1.83
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SYH1Q02875 849 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERF2Q06551 359 aa3.58□□□□□ -1.84
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MVP1P40959 511 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR109WQ06104 294 aa3.57□□□□□ -1.84
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 THI72Q08579 599 aa3.57□□□□□ -1.84
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ORC6P38826 435 aa3.55□□□□□ -1.84
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ROG3P43602 733 aa3.54□□□□□ -1.84
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LSC2P53312 427 aa3.54□□□□□ -1.84
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TUB4P53378 473 aa3.54□□□□□ -1.84
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AI1P03875 834 aa3.53□□□□□ -1.84
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RTT106P40161 455 aa3.53□□□□□ -1.84
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SET1P38827 1080 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 JJJ3P47138 172 aa3.52□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KXD1P53158 218 aa3.52□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY1A-MR1Q04215 440 aa3.52□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AGE1Q04412 482 aa3.52□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR053CQ6Q5F3 151 aa3.52□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YFL066CP43538 392 aa3.51□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TPD3P31383 635 aa3.5□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RGR1P19263 1082 aa3.49□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OSH7P38755 437 aa3.49□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CCP1P00431 361 aa3.48□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARG82P07250 355 aa3.48□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KIP2P28743 706 aa3.48□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HXT10P43581 546 aa3.48□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TCB1Q12466 1186 aa3.47□□□□□ -1.85
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRT4P33201 236 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SKN7P38889 622 aa3.46□□□□□ -1.86
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AAD14P42884 376 aa3.44□□□□□ -1.86
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJR098CP47139 656 aa3.44□□□□□ -1.86
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IXR1P33417 597 aa3.43□□□□□ -1.86
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IRC24P40580 263 aa3.43□□□□□ -1.86
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR187CQ03236 431 aa3.43□□□□□ -1.86
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DLD1P32891 587 aa3.42□□□□□ -1.86
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 REF2P42073 533 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RTF1P53064 558 aa3.41□□□□□ -1.86
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PDC1P06169 563 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNL115CP53925 644 aa3.39□□□□□ -1.87
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MAC1P35192 417 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms