RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	STR2	P47164	639 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSE4	YKL049C	NIS1	P53939	407 aa		6.03	□□□□□ -1.44
CSE4	YKL049C	ISM1	P48526	1002 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CSE4	YKL049C	YMR196W	Q04336	1088 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CSE4	YKL049C	FPK1	P53739	893 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CSE4	YKL049C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
CSE4	YKL049C	KEX2	P13134	814 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CSE4	YKL049C	SIT4	P20604	311 aa		5.98	□□□□□ -1.45
CSE4	YKL049C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
CSE4	YKL049C	RTF1	P53064	558 aa		5.97	□□□□□ -1.45
CSE4	YKL049C	TY1A-DR4	O74302	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-A	P0CX57	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	AMS1	P22855	1083 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	HST2	P53686	357 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	YNL115C	P53925	644 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	ERF2	Q06551	359 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	GYP1	Q08484	637 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	CSN12	P47130	423 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	SAS4	Q04003	481 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	MMP1	Q12372	583 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	SEC2	P17065	759 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	SCJ1	P25303	377 aa		5.93	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	SLY41	P22215	453 aa		5.92	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	ESS1	P22696	170 aa		5.9	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	RRN7	P40992	514 aa		5.9	□□□□□ -1.46
CSE4	YKL049C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	TUB4	P53378	473 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	AGE1	Q04412	482 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	YJU3	P28321	313 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	HPC2	Q01448	625 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	SDH2	P21801	266 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	PUS6	P53294	404 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	TBF1	Q02457	562 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	ARG8	P18544	423 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.84	□□□□□ -1.47	not detected
CSE4	YKL049C	LAM6	Q08001	693 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CSE4	YKL049C	ERG12	P07277	443 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	BRL1	P38770	471 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	TFB3	Q03290	321 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	RAD59	Q12223	238 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	YDL206W	Q12424	762 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	RSC30	P38781	883 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	KXD1	P53158	218 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	RPA14	P50106	137 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	DMA2	P53924	522 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	ALR1	Q08269	859 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CSE4	YKL049C	MOD5	P07884	428 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	PKC1	P24583	1151 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	CST6	P40535	587 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	YPR097W	Q06839	1073 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	HXT10	P43581	546 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	BDP1	P46678	594 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	TPD3	P31383	635 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	YBL036C	P38197	257 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	BRE2	P43132	505 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	CSE4	P36012	229 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CSE4	YKL049C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
CSE4	YKL049C	PUS5	Q06244	254 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CSE4	YKL049C	BIO2	P32451	375 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CSE4	YKL049C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CSE4	YKL049C	YJL007C	P47080	104 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CSE4	YKL049C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CSE4	YKL049C	KIP2	P28743	706 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CSE4	YKL049C	FIG4	P42837	879 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CSE4	YKL049C	CLA4	P48562	842 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CSE4	YKL049C	GCR2	Q01722	534 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CSE4	YKL049C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5

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