RNA–Protein interactions for RNA: YHL030W

ECM29, Transcript of Scaffold protein, yeast

Gene ECM29, Length 5,607 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM29	YHL030W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	TTI1	P36097	1038 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	CAT8	P39113	1433 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	YOR1	P53049	1477 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	BPT1	P14772	1559 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	IME2	P32581	645 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	BBC1	P47068	1157 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	RNT1	Q02555	471 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	RMD1	Q03441	430 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	SMC3	P47037	1230 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	MSP1	P28737	362 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	SQT1	P35184	431 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	CYC8	P14922	966 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	DSN1	P40568	576 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	CDC11	P32458	415 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	ENT3	P47160	408 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	POL32	P47110	350 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	YPK9	Q12697	1472 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	SAP190	P36123	1033 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	AOS1	Q06624	347 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	VPS15	P22219	1454 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	SPO1	P53541	631 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
ECM29	YHL030W	PBY1	P38254	753 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	MAM1	P40065	302 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	BUD6	P41697	788 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	RCM1	P53972	490 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	RRI2	Q12348	645 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	PDR18	P53756	1333 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	VPS64	Q03944	604 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	RBA50	Q04418	439 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	RTC1	Q08281	1341 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	DID4	P36108	232 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	NKP2	Q06162	153 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	SPC110	P32380	944 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	SPT8	P38915	602 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	SGM1	P47166	707 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	DOS2	P54858	310 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	SIP3	P38717	1229 aa		3.15	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
ECM29	YHL030W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	PET123	P17558	318 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	DLD1	P32891	587 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	YJL181W	P46987	611 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	SVF1	Q05515	481 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	YCG1	Q06680	1035 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	SIN3	P22579	1536 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	KEX1	P09620	729 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	RRM3	P38766	723 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	MSH3	P25336	1018 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	PRD1	P25375	712 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	VPS20	Q04272	221 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	IQG1	Q12280	1495 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	FKH1	P40466	484 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	YKE2	P52553	114 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	NDC80	P40460	691 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	YGR130C	P53278	816 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	APC11	Q12157	165 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	CTR9	P89105	1077 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	SSK2	P53599	1579 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	TOP1	P04786	769 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	CLB5	P30283	435 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	LTV1	P34078	463 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	YOL098C	Q12496	1037 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	TRK1	P12685	1235 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	ATG13	Q06628	738 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	NUP133	P36161	1157 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	RAD26	P40352	1085 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
ECM29	YHL030W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	HST1	P53685	503 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECM29	YHL030W	OMS1	Q06668	471 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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