RNA–Protein interactions for RNA: YGL239C

YGL239C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGL239C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL239C	YGL239C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	GYP1	Q08484	637 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	AIM7	Q12156	149 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	KEX2	P13134	814 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	KIN1	P13185	1064 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	ERF2	Q06551	359 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	FPK1	P53739	893 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TRK1	P12685	1235 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	SEC2	P17065	759 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	SIT4	P20604	311 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	SCJ1	P25303	377 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	LEO1	P38439	464 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	YNL115C	P53925	644 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YGL239C	YGL239C	SAS4	Q04003	481 aa		4.4	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	SLY41	P22215	453 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	RRN7	P40992	514 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	CSN12	P47130	423 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	RTF1	P53064	558 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	MMP1	Q12372	583 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	ESS1	P22696	170 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	HST2	P53686	357 aa		4.38	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	TUB4	P53378	473 aa		4.36	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	SDH2	P21801	266 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	YJU3	P28321	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	AGE1	Q04412	482 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	ERG12	P07277	443 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YGL239C	YGL239C	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	PUS6	P53294	404 aa		4.33	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	TBF1	Q02457	562 aa		4.33	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	ARG8	P18544	423 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.32	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	YDL206W	Q12424	762 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	AMS1	P22855	1083 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.3	□□□□□ -1.72	not detected
YGL239C	YGL239C	KXD1	P53158	218 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	RAD59	Q12223	238 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	CST6	P40535	587 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	HPC2	Q01448	625 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	TFB3	Q03290	321 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	LAM6	Q08001	693 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	BRL1	P38770	471 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	RSC30	P38781	883 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	BDP1	P46678	594 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	ALR1	Q08269	859 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YGL239C	YGL239C	MOD5	P07884	428 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.27	□□□□□ -1.73	not detected
YGL239C	YGL239C	RPA14	P50106	137 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	PKC1	P24583	1151 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	HXT10	P43581	546 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	DMA2	P53924	522 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	PUS5	Q06244	254 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	YBL036C	P38197	257 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	CLA4	P48562	842 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	KIP2	P28743	706 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	TPD3	P31383	635 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YGL239C	YGL239C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	CSE4	P36012	229 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	YJL007C	P47080	104 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	GCR2	Q01722	534 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	IXR1	P33417	597 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	HED1	Q03937	162 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	ITT1	Q04638	464 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	VAC17	P25591	423 aa		4.18	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms