RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640939.1

GRAMD1B-217, Transcript of GRAM domain containing 1B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GRAMD1B, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1B-217ENST00000640939 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.88■■■■□ 3.33
GRAMD1B-217ENST00000640939 PREX2Q70Z35 1606 aa35.85■■■■□ 3.33
GRAMD1B-217ENST00000640939 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.84■■■■□ 3.33
GRAMD1B-217ENST00000640939 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.83■■■■□ 3.33
GRAMD1B-217ENST00000640939 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.82■■■■□ 3.32
GRAMD1B-217ENST00000640939 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.8■■■■□ 3.32
GRAMD1B-217ENST00000640939 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.78■■■■□ 3.32
GRAMD1B-217ENST00000640939 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.75■■■■□ 3.31
GRAMD1B-217ENST00000640939 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.75■■■■□ 3.31
GRAMD1B-217ENST00000640939 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
GRAMD1B-217ENST00000640939 TIAM1Q13009 1591 aa35.7■■■■□ 3.31
GRAMD1B-217ENST00000640939 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.7■■■■□ 3.31
GRAMD1B-217ENST00000640939 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.7■■■■□ 3.31
GRAMD1B-217ENST00000640939 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.68■■■■□ 3.3
GRAMD1B-217ENST00000640939 ABCC1P33527 1531 aa35.67■■■■□ 3.3
GRAMD1B-217ENST00000640939 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
GRAMD1B-217ENST00000640939 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.67■■■■□ 3.3
GRAMD1B-217ENST00000640939 AFAP1Q8N556 730 aa35.66■■■■□ 3.3
GRAMD1B-217ENST00000640939 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.66■■■■□ 3.3
GRAMD1B-217ENST00000640939 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.65■■■■□ 3.3
GRAMD1B-217ENST00000640939 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
GRAMD1B-217ENST00000640939 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.63■■■■□ 3.29
GRAMD1B-217ENST00000640939 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.62■■■■□ 3.29
GRAMD1B-217ENST00000640939 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
GRAMD1B-217ENST00000640939 KDM5CP41229 1560 aa35.6■■■■□ 3.29
GRAMD1B-217ENST00000640939 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.6■■■■□ 3.29
GRAMD1B-217ENST00000640939 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
GRAMD1B-217ENST00000640939 NCOA2Q15596 1464 aa35.55■■■■□ 3.28
GRAMD1B-217ENST00000640939 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.55■■■■□ 3.28
GRAMD1B-217ENST00000640939 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.55■■■■□ 3.28
GRAMD1B-217ENST00000640939 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.54■■■■□ 3.28
GRAMD1B-217ENST00000640939 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.54■■■■□ 3.28
GRAMD1B-217ENST00000640939 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.54■■■■□ 3.28
GRAMD1B-217ENST00000640939 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.53■■■■□ 3.28
GRAMD1B-217ENST00000640939 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.52■■■■□ 3.28
GRAMD1B-217ENST00000640939 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.51■■■■□ 3.28
GRAMD1B-217ENST00000640939 ATP10AO60312 1499 aa35.51■■■■□ 3.28
GRAMD1B-217ENST00000640939 MAP3K1Q13233 1512 aa35.51■■■■□ 3.27
GRAMD1B-217ENST00000640939 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
GRAMD1B-217ENST00000640939 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.48■■■■□ 3.27
GRAMD1B-217ENST00000640939 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
GRAMD1B-217ENST00000640939 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.47■■■■□ 3.27
GRAMD1B-217ENST00000640939 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.47■■■■□ 3.27
GRAMD1B-217ENST00000640939 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.45■■■■□ 3.27
GRAMD1B-217ENST00000640939 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.44■■■■□ 3.26
GRAMD1B-217ENST00000640939 ABCA6Q8N139 1617 aa35.43■■■■□ 3.26
GRAMD1B-217ENST00000640939 MADDQ8WXG6 1647 aa35.43■■■■□ 3.26
GRAMD1B-217ENST00000640939 APLP2Q06481 763 aa35.4■■■■□ 3.26
GRAMD1B-217ENST00000640939 MLECQ14165 292 aa35.4■■■■□ 3.26
GRAMD1B-217ENST00000640939 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.4■■■■□ 3.26
GRAMD1B-217ENST00000640939 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
GRAMD1B-217ENST00000640939 PTPRMP28827 1452 aa35.35■■■■□ 3.25
GRAMD1B-217ENST00000640939 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
GRAMD1B-217ENST00000640939 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.32■■■■□ 3.24
GRAMD1B-217ENST00000640939 MBD5Q9P267 1494 aa35.32■■■■□ 3.24
GRAMD1B-217ENST00000640939 REREQ9P2R6 1566 aa35.31■■■■□ 3.24
GRAMD1B-217ENST00000640939 ATP7AQ04656 1500 aa35.29■■■■□ 3.24
GRAMD1B-217ENST00000640939 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
GRAMD1B-217ENST00000640939 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.25■■■■□ 3.23
GRAMD1B-217ENST00000640939 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.23■■■■□ 3.23
GRAMD1B-217ENST00000640939 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.2■■■■□ 3.23
GRAMD1B-217ENST00000640939 AGLP35573 1532 aa35.2■■■■□ 3.23
GRAMD1B-217ENST00000640939 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.19■■■■□ 3.22
GRAMD1B-217ENST00000640939 MIA2Q96PC5 1412 aa35.15■■■■□ 3.22
GRAMD1B-217ENST00000640939 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.13■■■■□ 3.21
GRAMD1B-217ENST00000640939 A2MP01023 1474 aa35.12■■■■□ 3.21
GRAMD1B-217ENST00000640939 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.12■■■■□ 3.21
GRAMD1B-217ENST00000640939 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.12■■■■□ 3.21
GRAMD1B-217ENST00000640939 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.1■■■■□ 3.21
GRAMD1B-217ENST00000640939 PLXNC1O60486 1568 aa35.09■■■■□ 3.21
GRAMD1B-217ENST00000640939 TSPY4P0CV99 314 aa35.03■■■■□ 3.2
GRAMD1B-217ENST00000640939 TSPY10P0CW01 314 aa35.03■■■■□ 3.2
GRAMD1B-217ENST00000640939 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.03■■■■□ 3.2
GRAMD1B-217ENST00000640939 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
GRAMD1B-217ENST00000640939 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
GRAMD1B-217ENST00000640939 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.99■■■■□ 3.19
GRAMD1B-217ENST00000640939 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
GRAMD1B-217ENST00000640939 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.95■■■■□ 3.18
GRAMD1B-217ENST00000640939 GGT6Q6P531 493 aa34.94■■■■□ 3.18
GRAMD1B-217ENST00000640939 C3P01024 1663 aa34.92■■■■□ 3.18
GRAMD1B-217ENST00000640939 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.92■■■■□ 3.18
GRAMD1B-217ENST00000640939 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
GRAMD1B-217ENST00000640939 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.9■■■■□ 3.18
GRAMD1B-217ENST00000640939 ABCC5O15440 1437 aa34.88■■■■□ 3.17
GRAMD1B-217ENST00000640939 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.86■■■■□ 3.17
GRAMD1B-217ENST00000640939 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
GRAMD1B-217ENST00000640939 KIF3BO15066 747 aa34.86■■■■□ 3.17
GRAMD1B-217ENST00000640939 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
GRAMD1B-217ENST00000640939 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
GRAMD1B-217ENST00000640939 MROH2AA6NES4 1674 aa34.83■■■■□ 3.17
GRAMD1B-217ENST00000640939 DAPK1P53355 1430 aa34.83■■■■□ 3.17
GRAMD1B-217ENST00000640939 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.81■■■■□ 3.16
GRAMD1B-217ENST00000640939 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.8■■■■□ 3.16
GRAMD1B-217ENST00000640939 ZMYM3Q14202 1370 aa34.8■■■■□ 3.16
GRAMD1B-217ENST00000640939 HSPA2P54652 639 aa34.8■■■■□ 3.16
GRAMD1B-217ENST00000640939 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
GRAMD1B-217ENST00000640939 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.77■■■■□ 3.16
GRAMD1B-217ENST00000640939 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
GRAMD1B-217ENST00000640939 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.73■■■■□ 3.15
GRAMD1B-217ENST00000640939 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.72■■■■□ 3.15
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